Provided herein are systems, compositions, and methods for single cell analysis. In particular, provided herein are systems, compositions, and methods for scalable, high-throughput isolation and sequencing of nucleic acids from rare and/or fragile single cells.
Provided herein are compositions and methods for amplifying long nucleic acid molecules. In particular, provided herein are compositions and methods for amplifying long nucleic acid molecules that are mixed in complex samples, for example, complex biological samples.
Provided herein are compositions and methods for amplifying long nucleic acid molecules. In particular, provided herein are compositions and methods for amplifying long nucleic acid molecules that are mixed in complex samples, for example, complex biological samples.
Provided herein systems, compositions, and methods for nucleic acid quantification that combines the sensitivity and accuracy of digital PCR with the capability for high-throughput multiplexing. The methods integrate digital amplification in compartments with capillary electrophoresis or other methodologies as a readout mechanism.
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
C40B 70/00 - Étiquettes ["tags"] ou marqueurs ["labels"] spécialement adaptés à la chimie combinatoire ou aux chimiothèques, p. ex. "tags" fluorescents ou codes-barres
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C12Q 1/6888 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C12Q 1/6888 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour la détection ou l’identification d’organismes
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
6.
CORE-SHELL GEL PARTICLES FOR SEPARATING AND ANALYZING RNA AND DNA FROM A CELL
Provided herein are compositions, systems, kits, and methods for separating and analyzing RNA/cDNA from genomic DNA molecules using core-shell gel particles (e.g., such that separate barcoded sequencing libraries can be generated from each). In certain embodiments, the core-shell gel particles comprise an outer gel shell, and an interior region surrounded by said shell that comprises: A) an interior solution that is at least partially aqueous, B) optionally an inner gel core; C) at least one cell, and D) a plurality of capture beads comprising capture probes configured to hybridize to RNA from the cell, and optionally configured to hybridize to genomic DNA and/or bind target proteins.
Provided herein are devices, assemblies, systems, kits, and methods for generating an emulsion with a microfluidic chamber composed of impediments (e.g., posts) regularly or irregularly spaced apart to create pores (e.g., 10-1000 microns in diameter). In certain embodiments, a non-emulsion mixture composed of sample fluid (e.g., containing cells and/or beads) and an immiscible carrier fluid are flown through the microfluidic chamber once or repeatedly such that an emulsion is generated comprising sample microdroplets (e.g., about the same size as the pores, or of irregular shape). In some embodiments, the microfluidic chamber is housed in a pipette tip and a micropipette is used to push or draw the non-emulsion mixture through the microfluidic chamber.
C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
C12Q 1/6848 - Réactions d’amplification d’acides nucléiques caracterisées par les moyens d’empêcher la contamination ou d’augmenter la spécificité ou la sensibilité d’une réaction d’amplification
C12Q 1/6886 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique pour le cancer
11.
SYSTEMS, COMPOSITIONS, AND METHODS FOR SINGLE CELL ANALYSIS
Provided herein are systems, compositions, and methods for single cell analysis. In particular, provided herein are systems, compositions, and methods for scalable, high-throughput isolation and sequencing of nucleic acids from rare and/or fragile single cells.
C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]
C12Q 1/6848 - Réactions d’amplification d’acides nucléiques caracterisées par les moyens d’empêcher la contamination ou d’augmenter la spécificité ou la sensibilité d’une réaction d’amplification
C12Q 1/6886 - Produits d’acides nucléiques utilisés dans l’analyse d’acides nucléiques, p. ex. amorces ou sondes pour les maladies provoquées par des altérations du matériel génétique pour le cancer
brevets
