Codexis, Inc.

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Type PI
        Brevet 762
        Marque 32
Juridiction
        États-Unis 499
        International 221
        Canada 70
        Europe 4
Date
Nouveautés (dernières 4 semaines) 3
2025 mai (MACJ) 2
2025 avril 7
2025 mars 3
2025 janvier 6
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Classe IPC
C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase 144
C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1) 135
C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote 122
C12N 9/10 - Transférases (2.) 119
C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes 76
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Classe NICE
01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture 19
40 - Traitement de matériaux; recyclage, purification de l'air et traitement de l'eau 12
09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques 10
42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception 10
05 - Produits pharmaceutiques, vétérinaires et hygièniques 1
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Statut
En Instance 133
Enregistré / En vigueur 661
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1.

ENGINEERED NUCLEOSIDE DEOXYRIBOSYLTRANSFERASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18683245
Statut En instance
Date de dépôt 2022-08-10
Date de la première publication 2025-05-01
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Borra-Garske, Margie Tabuga
  • Alvizo, Oscar
  • Miller, Lillian Jasmine
  • Petkova, Aksiniya Lyubenova
  • Huffman, Mark
  • Rodriguez-Granillo, Agustina

Abrégé

The present invention provides engineered nucleoside deoxyribosyltransferase (NDT) enzymes, polypeptides having NDT activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing NDT enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the NDT enzymes and methods of using the engineered NDT enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli

2.

ENGINEERED IMINE REDUCTASES AND METHODS FOR THE REDUCTIVE AMINATION OF KETONE AND AMINE COMPOUNDS

      
Numéro d'application 18976769
Statut En instance
Date de dépôt 2024-12-11
Date de la première publication 2025-05-01
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Yi, Xiang
  • Alvizo, Oscar
  • Garcia, Ravi David
  • Entwistle, David
  • Ching, Charlene
  • Riggins, James Nicholas

Abrégé

The present application provides engineered polypeptides having imine reductase activity, polynucleotides encoding the engineered polypeptides, host cells capable of expressing the engineered polypeptides, and methods of using these engineered polypeptides with a range of ketone and amine substrate compounds to prepare secondary and tertiary amine product compounds.

Classes IPC  ?

  • C12P 13/04 - Alpha- ou bêta-amino-acides
  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)

3.

ENGINEERED GLUCOSE DEHYDROGENASES AND METHODS FOR THE REDUCTIVE AMINATION OF KETONE AND AMINE COMPOUNDS

      
Numéro d'application 18999352
Statut En instance
Date de dépôt 2024-12-23
Date de la première publication 2025-04-24
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Yi, Xiang
  • Alvizo, Oscar
  • Garcia, Ravi David
  • Entwistle, David
  • Ching, Charlene
  • Riggins, James Nicholas
  • Subramanian, Nandhitha

Abrégé

The present application provides engineered glucose dehydrogenase polypeptides having imine reductase activity, polynucleotides encoding the engineered polypeptides, host cells capable of expressing the engineered polypeptides, and methods of using these engineered polypeptides with a range of ketone and amine substrate compounds to prepare secondary and tertiary amine product compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 15/72 - Systèmes d'expression utilisant des séquences régulatrices dérivées de l'opéron lac

4.

ENGINEERED ADENYLATE KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18913751
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-11
Date de la première publication 2025-04-17
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie Marie
  • Knight, Anders Matthew
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure provides engineered adenylate kinases, and recombinant polynucleotides encoding the engineered adenylate kinases. The present disclosure further provides uses of the engineered adenylate kinases for converting NMP to NDP.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 9/08 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur le peroxyde d'hydrogène comme accepteur (1.11)
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées

5.

ENGINEERED ADENOSINE KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18913982
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-11
Date de la première publication 2025-04-17
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie Marie
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Teadt, Leann Quertinmont
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure provides engineered adenosine kinase polypeptides, and recombinant polynucleotides encoding the engineered adenosine kinases. The present disclosure further provides method of using the engineered adenosine kinases.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

6.

ENGINEERED ADENOSINE KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024051139
Numéro de publication 2025/081113
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-10-11
Date de publication 2025-04-17
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie, Marie
  • Macavoy, Marissa, Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Teadt, Leann, Quertinmont
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure provides engineered adenosine kinase polypeptides, and recombinant polynucleotides encoding the engineered adenosine kinases. The present disclosure further provides method of using the engineered adenosine kinases.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12P 19/30 - Nucléotides

7.

ENGINEERED ACETATE KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18913845
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-11
Date de la première publication 2025-04-17
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie Marie
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure relates to engineered acetate kinase enzymes and compositions thereof, recombinant polynucleotides encoding the engineered acetate kinase enzymes, and method of using the engineered acetate kinase enzymes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 11/00 - Enzymes fixées sur un support ou immobiliséesCellules microbiennes fixées sur un support ou immobiliséesLeur préparation
  • C12P 19/38 - Nucléosides

8.

ENGINEERED ADENYLATE KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024051084
Numéro de publication 2025/081067
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-10-11
Date de publication 2025-04-17
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie, Marie
  • Knight, Anders, Matthew
  • Macavoy, Marissa, Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure provides engineered adenylate kinases, and recombinant polynucleotides encoding the engineered adenylate kinases. The present disclosure further provides uses of the engineered adenylate kinases for converting NMP to NDP.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/48 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une transférase
  • C07H 21/02 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le ribosyle comme radical saccharide
  • C12Q 1/22 - Test des conditions de stérilité
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 19/30 - Nucléotides

9.

ENGINEERED ACETATE KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024051118
Numéro de publication 2025/081095
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-10-11
Date de publication 2025-04-17
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie Marie
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure relates to engineered acetate kinase enzymes and compositions thereof, recombinant polynucleotides encoding the engineered acetate kinase enzymes, and method of using the engineered acetate kinase enzymes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C07K 14/195 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli

10.

BIOCATALYSTS AND METHODS FOR THE SYNTHESIS OF SUBSTITUTED LACTAMS

      
Numéro d'application 18971755
Statut En instance
Date de dépôt 2024-12-06
Date de la première publication 2025-03-27
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Cabirol, Fabien Louis
  • Chen, Haibin
  • Gohel, Anupam
  • Salim, Paulina Elena
  • Smith, Derek J.
  • Janey, Jacob
  • Kosjek, Birgit
  • Tang, Weng Lin
  • Hsieh, Helen
  • Pham, Son Q.

Abrégé

The present disclosure relates to transaminase polypeptides capable of aminating a dicarbonyl substrate, and polynucleotides, vectors, host cells, and methods of making and using the transaminase polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C07D 211/76 - Atomes d'oxygène liés en position 2 ou 6
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 17/12 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons

11.

ENGINEERED CYCLIC GMP-AMP SYNTHASE (cGAS) VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18953518
Statut En instance
Date de dépôt 2024-11-20
Date de la première publication 2025-03-13
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Borra-Garske, Margie Tabuga
  • Alvizo, Oscar
  • Miller, Lillian Jasmine
  • Petkova, Aksiniya Lyubenova

Abrégé

Cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) enzymes have been engineered to produce polypeptides having increased cGAS activity in the cyclization of modified nucleoside triphosphates, including thiolated or fluorinated nucleoside triphosphates, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing cGAS enzymes, compositions comprising the cGAS enzymes and methods of using the engineered cGAS enzymes are useful for the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

12.

IGM PROTEASES

      
Numéro d'application US2024044871
Numéro de publication 2025/050045
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-08-30
Date de publication 2025-03-06
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Ferrer, Brian
  • Kruse, Nikki, D.
  • Silverman, Adam, P.
  • Windgassen, Tricia

Abrégé

The present disclosure relates to proteases that exhibit activity against immunoglobulins, particularly IgM antibodies, and uses of the proteases for analysis of IgM, for generation of IgM antibody fragments, diagnostics related to IgM antibodies, and for treating and/or preventing diseases mediated by IgM antibodies.

Classes IPC  ?

  • C07K 16/12 - Immunoglobulines, p. ex. anticorps monoclonaux ou polyclonaux contre du matériel provenant de bactéries
  • C07K 14/315 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries provenant de Streptococcus (G), p. ex. Enterocoques
  • A61K 39/00 - Préparations médicinales contenant des antigènes ou des anticorps
  • A61P 35/00 - Agents anticancéreux

13.

ENGINEERED THREONINE ALDOLASES AND AMINO ACID DECARBOXYLASES

      
Numéro d'application 18714030
Statut En instance
Date de dépôt 2022-12-01
Date de la première publication 2025-01-30
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Novick, Scott J.
  • Subramanian, Nandhitha
  • Schlama, Thierry

Abrégé

The present invention provides engineered threonine aldolase and amino acid decarboxylase polypeptides useful for the production of the chiral tertiary amino alcohols, as well as polynucleotides, compositions, and methods utilizing these engineered polypeptides.

Classes IPC  ?

14.

PENICILLIN-G ACYLASES

      
Numéro d'application 18612248
Statut En instance
Date de dépôt 2024-03-21
Date de la première publication 2025-01-30
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Nazor, Jovana
  • Mitchell, Vesna
  • Elgart, David
  • Lexa, Katrina W.
  • Dellas, Nikki
  • Orr, Robert Kevin
  • Alvizo, Oscar
  • Garcia, Ravi David
  • Viduya, Judy Victoria Antonio
  • Moffett, Courtney Dianne

Abrégé

The present invention provides engineered penicillin G acylase (PGA) enzymes having improved properties, polynucleotides encoding such enzymes, compositions including the enzymes, and methods of using the enzymes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/84 - Penicillinamidase
  • C07K 14/62 - Insulines
  • C12P 21/02 - Préparation de peptides ou de protéines comportant une séquence connue de plusieurs amino-acides, p. ex. glutathion

15.

ENGINEERED DNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18903185
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-01
Date de la première publication 2025-01-23
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Bermudez, Ericka
  • Elgart, David
  • Kruse, Nikki D.
  • Miller, Mathew G.
  • Mitchell, Vesna
  • Nazor, Jovana
  • Subramanian, Nandhitha

Abrégé

The present disclosure relates to engineered DNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered DNA polymerase polypeptides or compositions thereof for diagnostic and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

16.

ENGINEERED PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18906502
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-04
Date de la première publication 2025-01-23
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Novick, Scott J.
  • Dellas, Nikki
  • Mitchell, Vesna
  • Duan, Da
  • Nazor, Jovana
  • Alvizo, Oscar
  • Sowell-Kantz, Auric Anthony
  • Moore, Jeffrey C.
  • Huffman, Mark A.
  • Rodriguez-Granillo, Agustina
  • Verma, Deeptak
  • Marshall, Nicholas M.
  • Russell, Jay H.
  • Canada, Keith A.

Abrégé

The present invention provides engineered purine nucleoside phosphorylase (PNP) enzymes, polypeptides having PNP activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing PNP enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the PNP enzymes and methods of using the engineered PNP enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

17.

T7 RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18909833
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-08
Date de la première publication 2025-01-23
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Miller, Mathew G.
  • Chng, Chinping
  • Alvizo, Oscar
  • Mayo, Melissa Ann
  • Riggins, James Nicholas
  • Yi, Xiang
  • Penfield, Jonathan S.
  • Huisman, Gjalt W.
  • Davis, Jared
  • Saotome, Yasushi

Abrégé

The present invention provides engineered RNA polymerase variants and compositions comprising these variants. The present invention further provides engineered T7 RNA polymerase variants and compositions comprising these variants. These variants have been evolved for selective incorporation of the m7G(5′)ppp(5′)m7G cap analog over GTP at the initiation of in vitro transcription. The present invention also provides methods for selective capping of RNA transcripts.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/00 - Techniques de mutation ou génie génétiqueADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p. ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purificationUtilisation d'hôtes pour ceux-ci
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides

18.

BIOCATALYSTS FOR EZETIMIBE SYNTHESIS

      
Numéro d'application 18886292
Statut En instance
Date de dépôt 2024-09-16
Date de la première publication 2025-01-09
Propriétaire Codexis Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Crowe, Michael A.
  • Alvizo, Oscar
  • Behrouzian, Behnaz
  • Bong, Yong Koy
  • Collier, Steven J.
  • Gohel, Anupam
  • Mavinahalli, Jagedeesh
  • Modukuru, Naga K.
  • Mundorff, Emily
  • Smith, Derek J.
  • Song, Shiwei
  • Yeo, Wan Lin

Abrégé

The present disclosure relates to non-naturally occurring polypeptides useful for preparing Ezetimibe, polynucleotides encoding the polypeptides, and methods of using the polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • A61K 38/00 - Préparations médicinales contenant des peptides
  • C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères
  • C12P 17/10 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle
  • C12P 17/14 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote ou l'oxygène comme hétéro-atome du cycle et dans le même cycle au moins un autre hétéro-atome différent

19.

ENGINEERED PANTOTHENATE KINASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18822990
Statut En instance
Date de dépôt 2024-09-03
Date de la première publication 2024-12-26
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Borra-Garske, Margie Tabuga
  • Alvizo, Oscar
  • Miller, Lillian Jasmine
  • Slaton, Jesse B.
  • Petkova, Aksiniya Lyubenova
  • Subramanian, Nandhitha
  • Kolev, Joshua
  • Fryszkowska, Anna
  • Rodriguez-Granillo, Agustina
  • Murphy, Grant

Abrégé

The present invention provides engineered pantothenate kinase (PanK) enzymes, polypeptides having PanK activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing PanK enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the PanK enzymes and methods of using the engineered PanK enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

20.

ENGINEERED PROTEASE POLYPEPTIDES

      
Numéro d'application 18679281
Statut En instance
Date de dépôt 2024-05-30
Date de la première publication 2024-12-12
Propriétaire
  • Codexis, Inc. (USA)
  • Société des Produits Nestlé S.A. (Suisse)
Inventeur(s)
  • Chng, Chinping
  • Cong, Ruth L.
  • Duan, Da
  • Ferrer, Brian
  • Garcia, Ravi David
  • Kruse, Nikki D.
  • Kumar, Hirdesh
  • Millet, Stephen Joshua Macaso
  • Windgassen, Trica
  • Zhu, Liang

Abrégé

The present disclosure provides engineered protease polypeptides, recombinant polynucleotides encoding the engineered protease polypeptides, and uses of the engineered protease polypeptides in therapeutic applications.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/54 - Protéinases provenant de bactéries les bactéries étant du genre Bacillus
  • C12N 9/96 - Stabilisation d'une enzyme par formation d'un adduct ou d'une compositionFormation de conjugaisons d'enzymes

21.

PENICILLIN-G ACYLASES

      
Numéro d'application 18813482
Statut En instance
Date de dépôt 2024-08-23
Date de la première publication 2024-12-12
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Elgart, David
  • Orr, Robert Kevin
  • Riggins, James Nicholas
  • Fryszkowska, Anna
  • Lexa, Katrina W.
  • Yi, Xiang
  • Duan, Da
  • Moffett, Courtney Dianne
  • Dellas, Nikki
  • Mitchell, Vesna

Abrégé

The present invention provides engineered penicillin G acylase (PGA) enzymes, polynucleotides encoding the enzymes, compositions comprising the enzymes, and methods of using the engineered PGA enzymes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/84 - Penicillinamidase
  • C07K 14/62 - Insulines
  • C12P 21/02 - Préparation de peptides ou de protéines comportant une séquence connue de plusieurs amino-acides, p. ex. glutathion

22.

ENGINEERED PROTEASE POLYPEPTIDES

      
Numéro d'application US2024031771
Numéro de publication 2024/249694
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-05-30
Date de publication 2024-12-05
Propriétaire
  • CODEXIS, INC. (USA)
  • SOCIETE DES PRODUITS NESTLE S.A. (Suisse)
Inventeur(s)
  • Chng, Chinping
  • Cong, Ruth, L.
  • Duan, Da
  • Ferrer, Brian
  • Garcia, Ravi, David
  • Kruse, Nikki, D.
  • Kumar, Hirdesh
  • Millet, Stephen, Joshua, Macaso
  • Windgassen, Tricia
  • Zhu, Liang

Abrégé

The present disclosure provides engineered protease polypeptides, recombinant polynucleotides encoding the engineered protease polypeptides, and uses of the engineered protease polypeptides in therapeutic applications.

Classes IPC  ?

  • C11D 3/386 - Préparations contenant des enzymes
  • C12N 9/54 - Protéinases provenant de bactéries les bactéries étant du genre Bacillus
  • C12N 9/64 - Protéinases provenant de tissu animal, p. ex. rennine

23.

ENGINEERED RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024028783
Numéro de publication 2024/238327
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-05-10
Date de publication 2024-11-21
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Camacho Hernandez, Martha
  • Miller, Mathew, G.
  • Nazor, Jovana
  • Nguyen, James, D.
  • Patel, Anand
  • Rui, Zhe

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA polymerase polypeptides or compositions thereof for producing RNA.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides

24.

ENGINEERED RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024028987
Numéro de publication 2024/238409
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-05-10
Date de publication 2024-11-21
Propriétaire
  • CODEXIS, INC. (USA)
  • PFIZER INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Artz, Jacob, Hansen
  • Camacho Hernandez, Martha
  • Fell, Jason
  • Miller, Mathew, G.
  • Nazor, Jovana
  • Nguyen, James, D.
  • Patel, Anand
  • Rui, Zhe

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA polymerase polypeptides or compositions thereof for producing RNA.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides

25.

ENGINEERED AMYLASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18789167
Statut En instance
Date de dépôt 2024-07-30
Date de la première publication 2024-11-21
Propriétaire
  • Codexis, Inc. (USA)
  • Societe des Produits Nestle S.A. (Suisse)
Inventeur(s)
  • Chng, Chinping
  • Dellas, Nikki
  • Duan, Da
  • Garcia, Ravi David
  • Maniar, Harvinder Chagger

Abrégé

The present invention provides engineered amylase polypeptides and compositions thereof. The engineered amylase polypeptides have been optimized to provide improved thermostability, protease stability, and stability under a range of pH conditions, including acidic (pH<7) conditions. The invention also relates to the use of the compositions comprising the engineered amylase polypeptides for therapeutic and/or nutritional purposes. The present invention also provides polynucleotides encoding the engineered amylase polypeptides, as well as methods for making the engineered polynucleotides and amylase polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/26 - Hydrolases (3.) agissant sur les composés glycosyliques (3.2) agissant sur les liaisons alpha-glucosidiques-1, 4, p. ex. hyaluronidase, invertase, amylase
  • A61K 38/47 - Hydrolases (3) agissant sur des composés glycosyliques (3.2), p. ex. cellulases, lactases
  • A61P 1/18 - Médicaments pour le traitement des troubles du tractus alimentaire ou de l'appareil digestif des troubles pancréatiques, p. ex. enzymes pancréatiques

26.

RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024028884
Numéro de publication 2024/238367
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-05-10
Date de publication 2024-11-21
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bakhtina, Marina, Mikhailovna
  • Copeland, Rachelle
  • Duran, Aldo
  • Knight, Anders, Matthew
  • Mayo, Melissa, Ann

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA polymerase polypeptides or compositions thereof for producing RNA.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides

27.

ECO SYNTHESIS

      
Numéro de série 98863642
Statut En instance
Date de dépôt 2024-11-20
Propriétaire Codexis, Inc. ()
Classes de Nice  ? 40 - Traitement de matériaux; recyclage, purification de l'air et traitement de l'eau

Produits et services

RNA manufacturing services for others utilizing proprietary enzymatic technologies to enable nucleic acid therapeutics development

28.

ENGINEERED RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18660729
Statut En instance
Date de dépôt 2024-05-10
Date de la première publication 2024-11-14
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Camacho Hernandez, Martha
  • Miller, Mathew G.
  • Nazor, Jovana
  • Nguyen, James D.
  • Patel, Anand
  • Rui, Zhe

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA polymerase polypeptides or compositions thereof for producing RNA.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 9/14 - Hydrolases (3.)
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

29.

RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18660851
Statut En instance
Date de dépôt 2024-05-10
Date de la première publication 2024-11-14
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bakhtina, Marina Mikhailovna
  • Copeland, Rachelle
  • Duran, Aldo
  • Knight, Anders Matthew
  • Mayo, Melissa Ann

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA polymerase polypeptides or compositions thereof for producing RNA.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 9/14 - Hydrolases (3.)

30.

ENGINEERED RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18661523
Statut En instance
Date de dépôt 2024-05-10
Date de la première publication 2024-11-14
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Artz, Jacob Hansen
  • Camacho Hernandez, Martha
  • Fell, Jason
  • Miller, Mathew G.
  • Nazor, Jovana
  • Nguyen, James D.
  • Patel, Anand
  • Rui, Zhe
  • Abyad, Jenna Tawil
  • Juhn, Hugo
  • Lotvin, Jason Arnold
  • Liu, Qi
  • Sztuba-Solinska, Joanna

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA polymerase polypeptides or compositions thereof for producing RNA.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

31.

LOV-D ACYLTRANSFERASE MEDIATED ACYLATION

      
Numéro d'application 18781007
Statut En instance
Date de dépôt 2024-07-23
Date de la première publication 2024-11-07
Propriétaire Codexis Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Collier, Steven J.
  • Teo, Ee Ling
  • Sukumaran, Joly
  • Wilson, Robert J.
  • Xu, Junye

Abrégé

Methods for the improved acylation of chemical substrates using LovD acyltransferases, thioesters having acyl groups, and (i) thiol scavengers and/or (ii) precipitating agents are presented. An improved method for the production of simvastatin using (i) activated charcoal as a thiol scavenger and/or (ii) ammonium hydroxide as a precipitating agent is also presented.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/06 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'oxygène comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons, p. ex. fluorescéine
  • C07K 14/00 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 7/62 - Esters d’acides carboxyliques

32.

P450-BM3 VARIANTS WITH IMPROVED ACTIVITY

      
Numéro d'application US2023080715
Numéro de publication 2024/196434
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-11-21
Date de publication 2024-09-26
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Entwistle, David
  • Fell, Jason
  • Jenne, Stephan
  • Knight, Anders Matthew
  • Ng, Simon
  • Reeves, Ryan D.
  • Seibel, Zara Maxine
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

terttert-Butoxycarbonylaminocyclopentanoic acid substrate.

Classes IPC  ?

  • A61K 38/41 - Peptides contenant des cycles porphyrine ou corrine
  • C07K 14/80 - Cytochromes
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes

33.

P450-BM3 VARIANTS WITH IMPROVED ACTIVITY

      
Numéro d'application 18516054
Statut En instance
Date de dépôt 2023-11-21
Date de la première publication 2024-09-26
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Entwistle, David
  • Fell, Jason
  • Jenne, Stephan
  • Knight, Anders Matthew
  • Ng, Simon
  • Reeves, Ryan D.
  • Seibel, Zara Maxine
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present invention provides improved P450-BM3 variants with improved activity. In some embodiments, the P450-BM3 variants exhibit improved activity on a 1-tert-Butoxycarbonylaminocyclopentanoic acid substrate.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase

34.

ENGINEERED DNA LIGASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18420040
Statut En instance
Date de dépôt 2024-01-23
Date de la première publication 2024-09-19
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Artz, Jacob Hansen
  • Copeland, Rachelle
  • Fell, Jason
  • Knight, Anders Matthew
  • Krawczyk, Mikayla Jianghongxia
  • Miller, Mathew G.
  • Nazor, Jovana
  • Shoubber, Amani
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure relates to engineered DNA ligase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA ligase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered DNA ligase polypeptides or compositions thereof in diagnostics and as a molecular biological tool.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes

35.

PEROXIDASE ACTIVITY TOWARDS 10-ACETYL-3,7-DIHYDROXYPHENOXAZINE

      
Numéro d'application 18655701
Statut En instance
Date de dépôt 2024-05-06
Date de la première publication 2024-09-12
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Duan, Da
  • Sowell-Kantz, Auric Anthony
  • Petkova, Aksiniya Lyubenova
  • Nazor, Jovana
  • Subramanian, Nandhitha
  • Alvizo, Oscar

Abrégé

The present invention provides engineered peroxidase enzymes, polypeptides having peroxidase activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing peroxidase enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the peroxidase enzymes and methods of using the engineered peroxidase enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical and other compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/08 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur le peroxyde d'hydrogène comme accepteur (1.11)

36.

KETOREDUCTASE POLYPEPTIDES FOR THE PREPARATION OF PHENYLEPHRINE

      
Numéro d'application 18671324
Statut En instance
Date de dépôt 2024-05-22
Date de la première publication 2024-09-12
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Collier, Steven J.
  • Hennemann, Hans-Georg Joerg
  • Oh, Seong Ho
  • Zha, Wenjuan

Abrégé

The disclosure relates to engineered ketoreductase polypeptides and processes of using the polypeptides for production of phenylephrine.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • A61K 31/137 - Arylalkylamines, p. ex. amphétamine, épinéphrine, salbutamol, éphédrine
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote

37.

ENGINEERED GALACTOSE OXIDASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18657101
Statut En instance
Date de dépôt 2024-05-07
Date de la première publication 2024-08-29
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Micklitsch, Christopher
  • Alvizo, Oscar
  • Nazor, Jovana
  • Maniar, Harvinder Chagger
  • Krawczyk, Mikayla Jianghongxia
  • Borra-Garske, Margie Tabuga
  • Subramanian, Nandhitha
  • Fryszkowska, Anna
  • Marshall, Nicholas M.
  • Rodriguez-Granillo, Agustina
  • Verma, Deeptak
  • Andrews, Dewan

Abrégé

The present invention provides engineered galactose oxidase (GOase) enzymes, polypeptides having GOase activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing GOase enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the GOase enzymes and methods of using the engineered GOase enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical and other compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 21/02 - Préparation de peptides ou de protéines comportant une séquence connue de plusieurs amino-acides, p. ex. glutathion

38.

NEURAL SPHEROIDS

      
Numéro d'application US2024015808
Numéro de publication 2024/173561
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-02-14
Date de publication 2024-08-22
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Lee, Grace, Sohee
  • Schmitt, Christopher, Edward

Abrégé

The present disclosure provides a method of preparing neural spheroids, the neural spheroid prepared by the method, and uses of the neural spheroids. In some embodiments, the present disclosure provides a method of forming neural spheroids, a three dimensional network of cells comprising neural and glial cells, where the method comprises culturing differentiated fore brain progenitor cells in a cell culture well having an ultra-low attachment surface and shaped to promote self-assembly of cells into neural spheroids.

Classes IPC  ?

  • C12N 5/0797 - Cellules souchesCellules progénitrices
  • C12N 5/00 - Cellules non différenciées humaines, animales ou végétales, p. ex. lignées cellulairesTissusLeur culture ou conservationMilieux de culture à cet effet
  • C12N 5/074 - Cellules souches adultes
  • C12N 5/0789 - Cellules souchesCellules progénitrices multipotentes
  • C12N 5/079 - Cellules neurales
  • C12N 5/07 - Cellules animales ou tissus animaux
  • G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique

39.

ENGINEERED DNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18628461
Statut En instance
Date de dépôt 2024-04-05
Date de la première publication 2024-08-08
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Miller, Mathew G.
  • Mitchell, Vesna
  • Nazor, Jovana
  • Baskerville, Donald S.
  • Dellas, Nikki
  • Elgart, David
  • Vroom, Jonathan
  • Gomes, Sandy M.
  • Subramanian, Nandhitha
  • Bermudez, Ericka

Abrégé

The present invention provides engineered DNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA polymerase polypeptides. The invention also provides methods for use of the compositions comprising the engineered DNA polymerase polypeptides for diagnostic and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

40.

ENGINEERED GLUCOCEREBROSIDASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024014039
Numéro de publication 2024/163765
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-02-01
Date de publication 2024-08-08
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Artz, Jacob, Hansen
  • Botham, Rachel, Cathleen
  • Chen, Xingxiu
  • Francisco, Victorino, Miguel
  • Hallows, William, Casey
  • Heredia, Jeremiah, Dallas
  • Johnson, Londen, Christine
  • Millar, Douglas, Chamberlain
  • Onguka, Ouma
  • Schmitt, Christopher, Edward
  • Silverman, Adam, P.

Abrégé

The present disclosure provides engineered glucocerebrosidases, polynucleotides encoding the engineered glucocerebrosidases, and methods of treating a deficiency in glucocerebroside activity using the engineered glucocerebrosidases or the recombinant polynucleotides encoding the engineered glucocerebrosidases.

Classes IPC  ?

  • A61K 38/47 - Hydrolases (3) agissant sur des composés glycosyliques (3.2), p. ex. cellulases, lactases
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C07K 14/00 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 9/24 - Hydrolases (3.) agissant sur les composés glycosyliques (3.2)
  • C12N 9/38 - Hydrolases (3.) agissant sur les composés glycosyliques (3.2) agissant sur les liaisons bêta-galactose-glycoside, p. ex. bêta-galactosidase
  • C12N 9/42 - Hydrolases (3.) agissant sur les composés glycosyliques (3.2) agissant sur les liaisons bêta-glucosidiques-1, 4, p. ex. cellulase
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux

41.

ENGINEERED AAV POLYPEPTIDES

      
Numéro d'application US2024014362
Numéro de publication 2024/163979
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-02-02
Date de publication 2024-08-08
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Akeefe, Hassibullah
  • Chng, Chinping
  • Del Greco, Elizabeth
  • Desautel, Sarah
  • Gebretsadik, Kahsay
  • Kruse, Nikki, D.
  • Kumar, Ambuj
  • Rivera-Velazquez, Mirella
  • Rohovie, Marcus
  • Schmitt, Christopher, Edward
  • Sedighi, Faezeh
  • Sero, Antoinette
  • Silverman, Adam, P.
  • Wong, Victoria

Abrégé

The present disclosure provides engineered AAV capsid polypeptides, engineered MAAP polypeptides, and engineered AAP polypeptides as well as recombinant polynucleotides encoding the engineered AAV polypeptides. The present disclosure further provides use of the engineered AAV polypeptides and recombinant polynucleotides for producing rAAV viruses or rAAV virions.

Classes IPC  ?

  • C07K 14/005 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de virus
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • C12N 7/00 - Virus, p. ex. bactériophagesCompositions les contenantLeur préparation ou purification
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique

42.

ENGINEERED DNA LIGASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024012543
Numéro de publication 2024/158764
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-01-23
Date de publication 2024-08-02
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Artz, Jacob Hansen
  • Copeland, Rachelle
  • Fell, Jason
  • Knight, Anders Matthew
  • Krawczyk, Mikayla Jianghongxia
  • Miller, Mathew G.
  • Nazor, Jovana
  • Shoubber, Amani
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure relates to engineered DNA ligase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA ligase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered DNA ligase polypeptides or compositions thereof in diagnostics and as a molecular biological tool.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

43.

ENGINEERED IMINE REDUCTASES AND METHODS FOR THE REDUCTIVE AMINATION OF KETONE AND AMINE COMPOUNDS

      
Numéro d'application 18638060
Statut En instance
Date de dépôt 2024-04-17
Date de la première publication 2024-08-01
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Borra-Garsek, Margie
  • Alvizo, Oscar
  • Mayo, Melissa
  • Jenne, Stephan
  • Sowell-Kantz, Auric Anthoney
  • Molinaro, Carmela

Abrégé

The present application provides engineered polypeptides having imine or oxime reductase activity, polynucleotides encoding the engineered polypeptides, host cells capable of expressing the engineered polypeptides, and methods of using these engineered polypeptides with a range of ketone and amine substrate compounds to prepare secondary and tertiary amine product compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase

44.

KETOREDUCTASE POLYPEPTIDES FOR THE PRODUCTION OF (R)-3-HYDROXYTHIOLANE

      
Numéro d'application 18614099
Statut En instance
Date de dépôt 2024-03-22
Date de la première publication 2024-07-11
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Liang, Jack S.
  • Jenne, Stephan
  • Mundorff, Emily
  • Voladri, Rama
  • Lalonde, James J.
  • Huisman, Gjalt W.

Abrégé

The present disclosure provides engineered ketoreductase enzymes having improved properties as compared to a naturally occurring wild-type ketoreductase enzyme. Also provided are polynucleotides encoding the engineered ketoreductase enzymes, host cells capable of expressing the engineered ketoreductase enzymes, and methods of using the engineered ketoreductase enzymes to synthesize chiral compounds.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/00 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12P 17/16 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant plusieurs hétérocycles

45.

ENGINEERED IMINE REDUCTASES AND METHODS FOR THE REDUCTIVE AMINATION OF KETONE AND AMINE COMPOUNDS

      
Numéro d'application 18471524
Statut En instance
Date de dépôt 2023-09-21
Date de la première publication 2024-07-11
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Mayo, Melissa Ann
  • Moore, Jeffrey C.

Abrégé

The present application provides engineered polypeptides having imine reductase activity, polynucleotides encoding the engineered imine reductases, host cells capable of expressing the engineered imine reductases, and methods of using these engineered polypeptides with a range of ketone and amine substrate compounds to prepare secondary and tertiary amine product compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote

46.

VARIANT LOVD POLYPEPTIDES AND THEIR USES

      
Numéro d'application 18432802
Statut En instance
Date de dépôt 2024-02-05
Date de la première publication 2024-07-04
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Gilson, Lynne
  • Collier, Steven J.
  • Sukumaran, Joly
  • Yeo, Wan Lin
  • Alvizo, Oscar
  • Teo, Ee Ling
  • Wilson, Robert J.
  • Xu, Junye

Abrégé

The present disclosure provides acyltransferases useful for synthesizing therapeutically important statin compound.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/06 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'oxygène comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons, p. ex. fluorescéine
  • C07K 14/00 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 7/62 - Esters d’acides carboxyliques

47.

ENGINEERED RNASE INHIBITOR VARIANTS

      
Numéro d'application US2023085570
Numéro de publication 2024/138074
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-12-21
Date de publication 2024-06-27
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Knight, Anders, Matthew
  • Ng, Simon

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNase inhibitor polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNase inhibitor polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNase inhibitor polypeptides or compositions thereof for molecular biological, diagnostic and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12N 15/74 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes procaryotes autres que E. coli, p. ex. Lactobacillus, Micromonospora
  • C12N 15/79 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes
  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]

48.

ENGINEERED RNA LIGASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2023085838
Numéro de publication 2024/138200
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-12-22
Date de publication 2024-06-27
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Copeland, Rachelle
  • Elgart, David
  • Fell, Jason
  • Nazor, Jovana
  • Wong, Leland, Ken
  • Rui, Zhe

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA ligase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA ligase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA ligase polypeptides or compositions thereof for molecular biological, diagnostic, and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées

49.

ENGINEERED RNA LIGASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18395294
Statut En instance
Date de dépôt 2023-12-22
Date de la première publication 2024-06-27
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Copeland, Rachelle
  • Elgart, David
  • Fell, Jason
  • Nazor, Jovana
  • Wong, Leland Ken
  • Rui, Zhe

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA ligase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA ligase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA ligase polypeptides or compositions thereof for molecular biological, diagnostic, and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12Q 1/6813 - Tests d’hybridation

50.

ENGINEERED 3-O-KINASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application 18485925
Statut En instance
Date de dépôt 2023-10-12
Date de la première publication 2024-06-27
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Entwistle, David
  • Forgel, Stephanie Marie
  • Knight, Anders Matthew
  • Krawczyk, Mikayla
  • Provencher, Philip
  • Shoubber, Amani
  • Vroom, Jonathan
  • Watts, David
  • Wong, Leland

Abrégé

The present invention provides engineered 3′O-kinase polypeptides useful for construction of materials used in template-independent polynucleotide synthesis, as well as compositions and methods of utilizing these engineered polypeptides. The present disclosure also describes one-pot methods for conversion of a natural or modified nucleoside to a nucleoside tetraphosphate or NQP.

Classes IPC  ?

  • C12P 19/38 - Nucléosides
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

51.

ENZYMATIC SYNTHESIS OF NTP AND NQP

      
Numéro d'application 18486140
Statut En instance
Date de dépôt 2023-10-12
Date de la première publication 2024-06-27
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Entwistle, David
  • Forget, Stephanie Marie
  • Knight, Anders Matthew
  • Krawczyk, Mikayla Jianghongxia
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Provencher, Philip
  • Shoubber, Amani
  • Teadt, Leann Quertinmont
  • Vroom, Jonathan
  • Watts, David
  • Wong, Leland Ken

Abrégé

The present disclosure provides enzymatic methods for the production of 3′-phosphate-nucleoside-5′-triphosphate (NQP). The present disclosure further provides enzymatic methods for the production of nucleotide-5′-triphosphates.

Classes IPC  ?

  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

52.

ENGINEERED 3'O-KINASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application US2023076694
Numéro de publication 2024/129232
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-10-12
Date de publication 2024-06-20
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Entwistle, David
  • Forget, Stephanie Marie
  • Knight, Anders Matthew
  • Krawczyk, Mikayla
  • Provencher, Philip
  • Shoubber, Amani
  • Vroom, Jonathan
  • Watts, David
  • Wong, Leland

Abrégé

The present invention provides engineered 3'O-kinase polypeptides useful for construction of materials used in template-independent polynucleotide synthesis, as well as compositions and methods of utilizing these engineered polypeptides. The present disclosure also describes one-pot methods for conversion of a natural or modified nucleoside to a nucleoside tetraphosphate or NQP.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C07K 14/32 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries provenant de Bacillus (G)
  • A61K 38/45 - Transférases (2)

53.

ENZYMATIC SYNTHESIS OF NTP AND NQP

      
Numéro d'application US2023076751
Numéro de publication 2024/129235
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-10-12
Date de publication 2024-06-20
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Entwistle, David
  • Forget, Stephanie, Marie
  • Knight, Anders, Matthew
  • Krawczyk, Mikayla, Jianghongxia
  • Macavoy, Marissa, Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Provencher, Philip
  • Shoubber, Amani
  • Teadt, Leann, Quertinmont
  • Vroom, Jonathan
  • Watts, David
  • Wong, Leland, Ken

Abrégé

The present disclosure provides enzymatic methods for the production of 3'-phosphate-nucleoside-5'-triphosphate (NQP). The present disclosure further provides enzymatic methods for the production of nucleotide-5'-triphosphates.

Classes IPC  ?

  • C07H 21/02 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le ribosyle comme radical saccharide
  • C12N 9/22 - Ribonucléases
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 9/30 - Alpha-amylase d'origine microbienne, p. ex. amylase bactérienne d'origine fongique
  • C12P 19/10 - Pullulane
  • C12P 19/38 - Nucléosides

54.

P450-BM3 VARIANTS WITH IMPROVED ACTIVITY

      
Numéro d'application 18516310
Statut En instance
Date de dépôt 2023-11-21
Date de la première publication 2024-06-13
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Borra-Garske, Margie Tabuga
  • Hurtak, Jessica Anna
  • Knight, Anders Matthew
  • Krishnamoorthy, Kalyanaraman
  • Nazor, Jovana
  • Riggins, James Nicholas
  • Subramanian, Nandhitha
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present invention provides improved P450-BM3 variants with improved activity. In some embodiments, the P450-BM3 variants exhibit improved activity on indanone substrates.

Classes IPC  ?

  • C07K 14/195 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries

55.

Engineered Terminal Deoxynucleotidyl Transferase Variants

      
Numéro d'application 18485855
Statut En instance
Date de dépôt 2023-10-12
Date de la première publication 2024-06-06
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Entwistle, David
  • Forget, Stephanie
  • Li, Michelle
  • Mahmoodi, Niusha
  • Reeves, Ryan
  • Vojcic, Ljubica
  • Vroom, Jonathan
  • Watts, David
  • Wong, Leland Ken

Abrégé

The present invention provides engineered terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) polypeptides useful in template-independent polynucleotide synthesis, as well as compositions, methods of utilizing these engineered polypeptides, and polynucleotides encoding the engineered terminal deoxynucleotidyl transferases.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

56.

P450-BM3 VARIANTS WITH IMPROVED ACTIVITY

      
Numéro d'application US2023080728
Numéro de publication 2024/112781
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-11-21
Date de publication 2024-05-30
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Borra-Garske, Margie Tabuga
  • Hurtak, Jessica Anna
  • Knight, Anders Matthew
  • Krishnamoorthy, Kalyanaraman
  • Nazor, Jovana
  • Riggins, James Nicholas
  • Subramanian, Nandhitha
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present invention provides improved P450-BM3 variants with improved activity. In some embodiments, the P450-BM3 variants exhibit improved activity on indanone substrates.

Classes IPC  ?

  • C07K 14/80 - Cytochromes
  • A61K 38/41 - Peptides contenant des cycles porphyrine ou corrine
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes

57.

ENGINEERED ADENYLATE KINASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18413338
Statut En instance
Date de dépôt 2024-01-16
Date de la première publication 2024-05-16
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Duan, Da
  • Sowell-Kantz, Auric Anthony
  • Petkova, Aksiniya Lyubenova
  • Alvizo, Oscar

Abrégé

The present invention provides engineered adenylate kinase (AdK) enzymes, polypeptides having AdK activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing AdK enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the AdK enzymes and methods of using the engineered AdK enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

58.

DNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2023079158
Numéro de publication 2024/102861
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-11-08
Date de publication 2024-05-16
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bermudez, Ericka
  • Elgart, David
  • Fell, Jason
  • Li, Michelle
  • Macavoy, Marissa, Greene
  • Miller, Mathew, G.
  • Mitchell, Vesna
  • Nazor, Jovana
  • Nelson, Kevin, S.
  • Walker, Scotty
  • Muerhoff, Anthony, S.
  • Cheng, Shouqiang
  • Christensen, David
  • Case, Alicia
  • Marohnic, Christopher

Abrégé

The present disclosure relates to engineered DNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered DNA polymerase polypeptides or compositions thereof for diagnostic and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12Q 1/48 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une transférase
  • C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs

59.

ENGINEERED VACCINIA CAPPING ENZYME VARIANTS

      
Numéro d'application US2023078328
Numéro de publication 2024/097739
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-11-01
Date de publication 2024-05-10
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bakhtina, Marina, Mikhailovna
  • Borra-Garske, Margie, Tabuga
  • Fell, Jason
  • Jenne, Stephan
  • Krishnamoorthy, Kalyanaraman
  • Kruse, Nikki, D.
  • Mayo, Melissa, Ann
  • Nazor, Jovana
  • Petkova, Aksiniya, Lyubenova
  • Rohovie, Marcus

Abrégé

The present invention provides engineered vaccina capping enzyme and vaccinia virus capping enzyme polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered vaccinia capping enzyme and vaccinia virus capping enzyme subunit polypeptides. The disclosure also provides methods for use of the engineered vaccina capping enzymes and vaccinia virus capping enzyme subunits, as well as compositions thereof for diagnostic, molecular biological tools, and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C07K 14/005 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de virus
  • C12N 15/33 - Gènes codant pour des protéines virales
  • C12N 15/72 - Systèmes d'expression utilisant des séquences régulatrices dérivées de l'opéron lac
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

60.

TRANSAMINASE POLYPEPTIDES

      
Numéro d'application 18409699
Statut En instance
Date de dépôt 2024-01-10
Date de la première publication 2024-05-09
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Dhawan, Ish K.
  • Miller, Gregory
  • Zhang, Xiyun

Abrégé

The present disclosure provides engineered transaminase enzymes having improved properties as compared to a naturally occurring wild-type transaminase enzyme. Also provided are polynucleotides encoding the engineered transaminase enzymes, host cells capable of expressing the engineered transaminase enzymes, and methods of using the engineered transaminase enzymes to synthesize a variety of chiral compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 41/00 - Procédés utilisant des enzymes ou des micro-organismes pour la séparation d'isomères optiques à partir d'un mélange racémique

61.

ENGINEERED ACETATE KINASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18420071
Statut En instance
Date de dépôt 2024-01-23
Date de la première publication 2024-05-09
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Borra-Garske, Margie Tabuga
  • Alvizo, Oscar
  • Miller, Lillian Jasmine
  • Petkova, Aksiniya Lyubenova

Abrégé

The present invention provides engineered acetate kinase (AcK) enzymes, polypeptides having AcK activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing AcK enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the AcK enzymes and methods of using the engineered AcK enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

62.

KETOREDUCTASE POLYPEPTIDES FOR THE PRODUCTION OF AZETIDINONE

      
Numéro d'application 18472540
Statut En instance
Date de dépôt 2023-09-22
Date de la première publication 2024-05-02
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Campopiano, Onorato
  • Mundorff, Emily
  • Borup, Birthe
  • Voladri, Rama

Abrégé

The present disclosure provides engineered ketoreductase enzymes having improved properties as compared to a naturally occurring wild-type ketoreductase enzyme. Also provided are polynucleotides encoding the engineered ketoreductase enzymes, host cells capable of expressing the engineered ketoreductase enzymes, and methods of using the engineered ketoreductase enzymes to synthesize a variety of chiral compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12P 17/10 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle

63.

ENGINEERED URIDINE PHOSPHORYLASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18403265
Statut En instance
Date de dépôt 2024-01-03
Date de la première publication 2024-04-25
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Vroom, Jonathan
  • Hurtak, Jessica Anna
  • Knight, Anders Matthew

Abrégé

The present invention provides engineered uridine phosphorylase (UP) enzymes, polypeptides having UP activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing UP enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the UP enzymes and methods of using the engineered UP enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

64.

ENGINEERED TERMINAL DEOXYNUCLEOTIDYL TRANSFERASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2023076667
Numéro de publication 2024/081770
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-10-12
Date de publication 2024-04-18
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Entwistle, David
  • Forget, Stephanie
  • Li, Michelle
  • Mahmoodi, Niusha
  • Reeves, Ryan
  • Vojcic, Ljubica
  • Vroom, Jonathan
  • Watts, David
  • Wong, Leland

Abrégé

The present invention provides engineered terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) polypeptides useful in template-independent polynucleotide synthesis, as well as compositions, methods of utilizing these engineered polypeptides, and polynucleotides encoding the engineered terminal deoxynucleotidyl transferases.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
  • C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
  • C12P 19/30 - Nucléotides

65.

ENGINEERED DNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2023073948
Numéro de publication 2024/059547
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-09-12
Date de publication 2024-03-21
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Bermudez, Ericka
  • Cai, Le
  • Dorigatti, Jonathan, Dewayne
  • Elgart, David
  • Fell, Jason
  • Gomes, Sandy, M.
  • Kadam, Supriya, Vijaykumar
  • Kumar, Ambuj
  • Li, Michelle
  • Macavoy, Marissa, Greene
  • Miller, Mathew, G.
  • Mitchell, Vesna
  • Nazor, Jovana

Abrégé

The present invention relates to engineered DNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA polymerase polypeptides. The present invention also provides methods of using the engineered DNA polymerase polypeptides or compositions thereof for diagnostic and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12Q 1/48 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une transférase
  • C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs

66.

ENGINEERED DNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2023073997
Numéro de publication 2024/059581
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-09-12
Date de publication 2024-03-21
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Fell, Jason
  • Gomes, Sandy, M.
  • Kadam, Supriya, Vijaykumar
  • Knight, Anders, Matthew
  • Matzdorff, Larson, Lyle
  • Miller, Mathew, G.
  • Rui, Zhe

Abrégé

The present disclosure relates to engineered DNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered DNA polymerase polypeptides or compositions thereof for diagnostic and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12Q 1/48 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une transférase
  • C12Q 1/6897 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques faisant intervenir des gènes rapporteurs liés de façon fonctionnelle à des promoteurs

67.

ENGINEERED DEOXYRIBOSE-PHOSPHATE ALDOLASES

      
Numéro d'application 18503542
Statut En instance
Date de dépôt 2023-11-07
Date de la première publication 2024-03-07
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Duan, Da
  • Alvizo, Oscar
  • Nazor, Jovana
  • Maniar, Harvinder Chagger
  • Riggins, James Nicholas
  • Vroom, Jonathan
  • Sivaramakrishnan, Santhosh
  • Yang, Hao
  • Fryszkowska, Anna
  • Huffman, Mark A.
  • Kolev, Joshua N.
  • Farasat, Iman
  • Rodriguez-Granillo, Agustina
  • Verma, Deeptak

Abrégé

The present invention provides engineered deoxyribose-phosphate aldolase polypeptides useful under industrial process conditions for the production of pharmaceutical and fine chemical compounds.

Classes IPC  ?

68.

Ketoreductase polypeptides and polynucleotides

      
Numéro d'application 18352899
Numéro de brevet 12252723
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-07-14
Date de la première publication 2024-02-29
Date d'octroi 2025-03-18
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Moore, Jeffrey C.
  • Liang, Jack
  • Penfield, Jonathan
  • Nazor, Jovana
  • Dellas, Nikki
  • Mitchell, Vesna
  • Duan, Da
  • Farasat, Iman
  • Rodriguez-Granillo, Agustina
  • Murphy, Grant
  • Marshall, Nicholas

Abrégé

The present invention provides engineered ketoreductase and phosphite dehydrogenase enzymes having improved properties as compared to a naturally occurring wild-type ketoreductase and phosphite dehydrogenase enzymes, as well as polynucleotides encoding the engineered ketoreductase and phosphite dehydrogenase enzymes, host cells capable of expressing the engineered ketoreductase and phosphite dehydrogenase enzymes, and methods of using the engineered ketoreductase and phosphite dehydrogenase enzymes to synthesize a chiral catalyst used in the synthesis of antiviral compounds, such as nucleoside inhibitors. The present invention further provides methods of using the engineered enzymes to deracemize a chiral alcohol in a one-pot, multi-enzyme system.

Classes IPC  ?

  • C12P 41/00 - Procédés utilisant des enzymes ou des micro-organismes pour la séparation d'isomères optiques à partir d'un mélange racémique
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli

69.

ENGINEERED PHOSPHOPENTOMUTASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18467259
Statut En instance
Date de dépôt 2023-09-14
Date de la première publication 2024-02-22
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Novick, Scott J.
  • Yi, Xiang
  • Dellas, Nikki
  • Alvizo, Oscar
  • Nazor, Jovana
  • Duan, Da
  • Mitchell, Vesna
  • Vroom, Jonathan
  • Sivaramakrishnan, Santhosh
  • Subramanian, Nandhitha
  • Moore, Jeffrey C.
  • Huffman, Mark
  • Rodriguez-Granillo, Agustina
  • Verma, Deeptak
  • Murphy, Grant S.
  • Marshall, Nicholas
  • Russell, Jay
  • Canada, Keith A.

Abrégé

The present invention provides engineered phosphopentomutase (PPM) enzymes, polypeptides having PPM activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing PPM enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the PPM enzymes and methods of using the engineered PPM enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/90 - Isomérases (5.)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/74 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes procaryotes autres que E. coli, p. ex. Lactobacillus, Micromonospora
  • C12N 15/81 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour champignons pour levures

70.

ENGINEERED BETA- GALACTOSIDASE POLYPEPTIDES

      
Numéro d'application US2023072531
Numéro de publication 2024/040258
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-08-19
Date de publication 2024-02-22
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Akeefe, Hassibullah
  • Artz, Jacob, Hansen
  • Chen, Joseph
  • Desautel, Sarah
  • Hallows, William, Casey
  • Kruse, Nikki, D.
  • Onguka, Ouma
  • Reddy, Charu, Shukla
  • Rivera-Velazquez, Mirella
  • Schmitt, Christopher, Edward
  • Silverman, Adam, P.
  • Wong, Victoria

Abrégé

GM1 gangliosidosis, also referred to as beta-galactosidase- 1 deficiency, is a lysosomal storage disorder (LSD) arising from defects in beta-galactosidase activity. The enzyme is normally localized to lysosomes where the enzyme breaks down several different molecules, including GM1 -ganglioside. The present disclosure provides engineered beta-galactosidase polypeptides, recombinant polynucleotides encoding the engineered beta-galactosidases, and methods of using the engineered beta-galactosidases and recombinant polynucleotides for treating conditions or diseases associated with a deficiency in beta-galactosidase.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/24 - Hydrolases (3.) agissant sur les composés glycosyliques (3.2)
  • A61K 38/47 - Hydrolases (3) agissant sur des composés glycosyliques (3.2), p. ex. cellulases, lactases
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique

71.

Engineered amylase variants

      
Numéro d'application 18462237
Numéro de brevet 12071642
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-09-06
Date de la première publication 2024-01-25
Date d'octroi 2024-08-27
Propriétaire
  • Codexis, Inc. (USA)
  • Société des Produits Nestlé S.A. (Suisse)
Inventeur(s)
  • Chng, Chinping
  • Dellas, Nikki
  • Duan, Da
  • Garcia, Ravi David
  • Maniar, Harvinder Chagger

Abrégé

The present invention provides engineered amylase polypeptides and compositions thereof. The engineered amylase polypeptides have been optimized to provide improved thermostability, protease stability, and stability under a range of pH conditions, including acidic (pH<7) conditions. The invention also relates to the use of the compositions comprising the engineered amylase polypeptides for therapeutic and/or nutritional purposes. The present invention also provides polynucleotides encoding the engineered amylase polypeptides, as well as methods for making the engineered polynucleotides and amylase polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/26 - Hydrolases (3.) agissant sur les composés glycosyliques (3.2) agissant sur les liaisons alpha-glucosidiques-1, 4, p. ex. hyaluronidase, invertase, amylase
  • A61K 38/47 - Hydrolases (3) agissant sur des composés glycosyliques (3.2), p. ex. cellulases, lactases
  • A61P 1/18 - Médicaments pour le traitement des troubles du tractus alimentaire ou de l'appareil digestif des troubles pancréatiques, p. ex. enzymes pancréatiques
  • C12N 15/09 - Technologie d'ADN recombinant
  • C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12N 15/74 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes procaryotes autres que E. coli, p. ex. Lactobacillus, Micromonospora

72.

ENGINEERED BIOCATALYSTS AND METHODS FOR SYNTHESIZING CHIRAL AMINES

      
Numéro d'application 18024942
Statut En instance
Date de dépôt 2021-09-17
Date de la première publication 2024-01-25
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Sivaramakrishnan, Santhosh
  • Bermudez, Ericka
  • Subramanian, Nandhitha
  • Entwistle, David
  • Forget, Stephanie Marie

Abrégé

The present disclosure provides engineered transaminase polypeptides for the production of amines, polynucleotides encoding the engineered transaminases, host cells capable of expressing the engineered transaminases, and methods of using the engineered transaminases to prepare compounds useful in the production of active pharmaceutical agents.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/18 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant plusieurs hétérocycles condensés entre eux ou condensés avec un système carbocyclique commun, p. ex. rifamycine
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)

73.

NOVEL P450-BM3 VARIANTS WITH IMPROVED ACTIVITY

      
Numéro d'application 18476753
Statut En instance
Date de dépôt 2023-09-28
Date de la première publication 2024-01-25
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Osborne, Robert
  • Mitchell, Vesna
  • Htwe, Khin Yu Naing
  • Zhang, Xiyun
  • Milczek, Erika M.
  • Moore, Jeffrey C.

Abrégé

The present invention provides improved P450-BM3 variants with improved activity. In some embodiments, the P450-BM3 variants exhibit improved activity over a wide range of substrates.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C07K 14/80 - Cytochromes
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote

74.

RECOMBINANT NEPROSIN POLYPEPTIDES AND METHODS OF EXPRESSION

      
Numéro d'application 18315466
Statut En instance
Date de dépôt 2023-05-10
Date de la première publication 2024-01-25
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Celis Luna, Arianna I.
  • Duan, Da
  • Jordan, Paul Campion
  • Molnar, Kathleen Susan
  • Silverman, Adam P.
  • Windgassen, Tricia

Abrégé

The present disclosure relates to methods of expressing recombinant neprosin polypeptide, host cells and expression vectors for expressing the recombinant neprosin polypeptide, and methods of using the expressed neprosin polypeptide for therapeutic and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/50 - Protéinases
  • A61P 1/14 - Eupeptiques, p. ex. acides, enzymes, orexigènes, antidyspeptiques, toniques, antiflatulants

75.

Biocatalysts for the preparation of hydroxy substituted carbamates

      
Numéro d'application 18333393
Numéro de brevet 12241093
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-06-12
Date de la première publication 2024-01-18
Date d'octroi 2025-03-04
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Cabirol, Fabien Louis
  • Chen, Haibin
  • Gohel, Anupam
  • Collier, Steven J.
  • Smith, Derek J.
  • Kosjek, Birgit
  • Janey, Jacob

Abrégé

The present disclosure relates to engineered ketoreductase polypeptides for the preparation of hydroxyl substituted carbamate compounds, and polynucleotides, vectors, host cells, and methods of making and using the ketoreductase polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 13/02 - Amides, p. ex. chloramphénicol
  • C12P 41/00 - Procédés utilisant des enzymes ou des micro-organismes pour la séparation d'isomères optiques à partir d'un mélange racémique
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli

76.

ENGINEERED TRANSAMINASE POLYPEPTIDES

      
Numéro d'application 18459797
Statut En instance
Date de dépôt 2023-09-01
Date de la première publication 2024-01-04
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Novick, Scott J.
  • Dellas, Nikki

Abrégé

The present disclosure provides engineered transaminase polypeptides useful for the synthesis of chiral amine compounds under industrially relevant conditions. The disclosure also provides polynucleotides encoding the engineered transaminase polypeptides, host cells capable of expressing the engineered transaminases, and methods of using the engineered transaminases for the production of chiral amine compounds.

Classes IPC  ?

77.

ENGINEERED PANTOTHENATE KINASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18247054
Statut En instance
Date de dépôt 2021-09-29
Date de la première publication 2024-01-04
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Nazor, Jovana
  • Krawczyk, Mikayla Jianghongxia
  • Seibel, Zara Maxine
  • Subramanian, Nandhitha
  • Kolev, Joshua

Abrégé

The present invention provides engineered pantothenate kinase (PanK) enzymes, polypeptides having PanK activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing PanK enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the PanK enzymes and methods of using the engineered PanK enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

78.

ENGINEERED NITROALDOLASES

      
Numéro d'application US2023067997
Numéro de publication 2023/240083
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-06-06
Date de publication 2023-12-14
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Novick, Scott, J.
  • Subramanian, Nandhitha
  • Schlama, Thierry

Abrégé

The present invention provides engineered nitroaldolase polypeptides useful for the production of the β-nitro alcohols, as well as polynucleotides, compositions, and methods utilizing these engineered polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli

79.

ENGINEERED NITROALDOLASES

      
Numéro de document 03258737
Statut En instance
Date de dépôt 2023-06-06
Date de disponibilité au public 2023-12-14
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Novick, Scott J.
  • Alvizo, Oscar
  • Schlama, Thierry
  • Subramanian, Nandhitha

Classes IPC  ?

  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques

80.

ENGINEERED GALACTOSE OXIDASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18247863
Statut En instance
Date de dépôt 2021-10-01
Date de la première publication 2023-11-23
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Borra-Garske, Margie Tabuga
  • Nazor, Jovana
  • Subramanian, Nandhitha
  • Alvizo, Oscar
  • Fryszkowska, Anna

Abrégé

The present invention provides engineered galactose oxidase (GOase) enzymes, polypeptides having GOase activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing GOase enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the GOase enzymes and methods of using the engineered GOase enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical and other compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli

81.

ENGINEERED PHOSPHOPENTOMUTASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18247866
Statut En instance
Date de dépôt 2021-10-05
Date de la première publication 2023-11-23
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Vroom, Jonathan
  • Sivaramakrishnan, Santhosh
  • Hurtak, Jessica Anna

Abrégé

The present invention provides engineered phosphopentomutase (PPM) enzymes, polypeptides having PPM activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing PPM enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the PPM enzymes and methods of using the engineered PPM enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

82.

RECOMBINANT NEPROSIN POLYPEPTIDES AND METHODS OF EXPRESSION

      
Numéro de document 03257140
Statut En instance
Date de dépôt 2023-05-10
Date de disponibilité au public 2023-11-16
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Celis Luna, Arianna I.
  • Duan, Da
  • Jordan, Paul Campion
  • Molnar, Kathleen Susan
  • Silverman, Adam P.
  • Windgassen, Tricia

Classes IPC  ?

  • A61K 38/48 - Hydrolases (3) agissant sur des liaisons peptidiques (3.4)
  • C12N 9/50 - Protéinases
  • C12N 15/79 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes

83.

RECOMBINANT NEPROSIN POLYPEPTIDES AND METHODS OF EXPRESSION

      
Numéro d'application US2023066853
Numéro de publication 2023/220658
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-05-10
Date de publication 2023-11-16
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Celis Luna, Arianna, I.
  • Duan, Da
  • Jordan, Paul, Campion
  • Molnar, Kathleen, Susan
  • Silverman, Adam, P.
  • Windgassen, Tricia

Abrégé

The present disclosure relates to methods of expressing recombinant neprosin polypeptide, host cells and expression vectors for expressing the recombinant neprosin polypeptide, and methods of using the expressed neprosin polypeptide for therapeutic and other purposes.

Classes IPC  ?

  • A61K 38/48 - Hydrolases (3) agissant sur des liaisons peptidiques (3.4)
  • C12N 9/50 - Protéinases
  • C12N 15/79 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes
  • A61P 3/00 - Médicaments pour le traitement des troubles du métabolisme

84.

RECOMBINANT FACTOR VIII VARIANTS

      
Numéro d'application 18150761
Statut En instance
Date de dépôt 2023-01-05
Date de la première publication 2023-10-26
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Heredia, Jeremiah Dallas
  • Kruse, Nikki D.
  • Petkova, Aksiniya Lyubenova
  • Rohovie, Marcus
  • Silverman, Adam P.

Abrégé

The present disclosure provides recombinant factor VIII polypeptides, polynucleotides encoding the recombinant factor VIII polypeptides, and compositions thereof, wherein the recombinant factor VIII polypeptides have been engineered to provide improved expression, activity/potency, clotting activity/potency, serum/plasma stability, and/or reduced immunogenicity. The present disclosure also relates to the use of the compositions comprising the recombinant factor VIII polypeptides or polynucleotides encoding the recombinant factor VIII polypeptides for therapeutic purposes.

Classes IPC  ?

  • C07K 14/755 - Facteurs VIII
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • A61P 7/04 - AntihémorragiquesProfacteurs de coagulationAgents hémostatiquesAgents antifibrinolytiques

85.

Engineered biocatalysts and methods for synthesizing chiral amines

      
Numéro d'application 18344690
Numéro de brevet 12305201
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-06-29
Date de la première publication 2023-10-19
Date d'octroi 2025-05-20
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Tang, Weng Lin
  • Hsieh, Helen
  • Pham, Son
  • Smith, Derek
  • Collier, Steven J.

Abrégé

The present disclosure provides engineered transaminase polypeptides for the production of amines, polynucleotides encoding the engineered transaminases, host cells capable of expressing the engineered transaminases, and methods of using the engineered transaminases to prepare compounds useful in the production of active pharmaceutical agents.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 15/00 - Préparation de composés contenant au moins trois carbocycles condensés
  • C12P 17/12 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons
  • C12P 17/18 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant plusieurs hétérocycles condensés entre eux ou condensés avec un système carbocyclique commun, p. ex. rifamycine
  • C12P 33/00 - Préparation de stéroïdes

86.

Biocatalysts and methods for the synthesis of substituted lactams

      
Numéro d'application 18164522
Numéro de brevet 12163162
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-02-03
Date de la première publication 2023-10-05
Date d'octroi 2024-12-10
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Cabirol, Fabien Louis
  • Chen, Haibin
  • Gohel, Anupam
  • Salim, Paulina Elena
  • Smith, Derek J.
  • Janey, Jacob
  • Kosjek, Birgit
  • Tang, Weng Lin
  • Hsieh, Helen
  • Pham, Son Q.

Abrégé

The present disclosure relates to transaminase polypeptides capable of aminating a dicarbonyl substrate, and polynucleotides, vectors, host cells, and methods of making and using the transaminase polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C07D 211/76 - Atomes d'oxygène liés en position 2 ou 6
  • C12N 1/21 - BactériesLeurs milieux de culture modifiés par l'introduction de matériel génétique étranger
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 17/12 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons

87.

ECO SYNTHESIS

      
Numéro de série 98198117
Statut En instance
Date de dépôt 2023-09-26
Propriétaire Codexis, Inc. ()
Classes de Nice  ?
  • 01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture
  • 45 - Services juridiques; services de sécurité; services personnels pour individus

Produits et services

Reagents and enzymes for use in the manufacture of enzymatic catalyzed oligonucleotides for scientific and research use Licensing of technology for the manufacture and enzymatic synthesis of oligonucleotides

88.

ECORNA

      
Numéro de série 98198083
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2023-09-26
Date d'enregistrement 2025-03-11
Propriétaire Codexis, Inc. ()
Classes de Nice  ? 01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture

Produits et services

Reagents and enzymes for use in the manufacture of enzymatic catalyzed oligonucleotides for scientific and research use

89.

ENGINEERED IMINE REDUCTASES AND METHODS FOR THE REDUCTIVE AMINATION OF KETONE AND AMINE COMPOUNDS

      
Numéro d'application 18171272
Statut En instance
Date de dépôt 2023-02-17
Date de la première publication 2023-09-21
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Chen, Haibin
  • Collier, Steven J.
  • Nazor, Jovana
  • Sukumaran, Joly
  • Smith, Derek
  • Moore, Jeffrey C.
  • Hughes, Gregory
  • Janey, Jacob
  • Huisman, Gjalt W.
  • Novick, Scott J.
  • Agard, Nicholas J.
  • Alvizo, Oscar
  • Cope, Gregory A.
  • Yeo, Wan Lin
  • Minor, Stefanie Ng

Abrégé

The present disclosure provides engineered polypeptides having imine reductase activity, polynucleotides encoding the engineered imine reductases, host cells capable of expressing the engineered imine reductases, and methods of using these engineered polypeptides with a range of ketone and amine substrate compounds to prepare secondary and tertiary amine product compounds.

Classes IPC  ?

  • C12P 13/02 - Amides, p. ex. chloramphénicol
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 17/18 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant plusieurs hétérocycles condensés entre eux ou condensés avec un système carbocyclique commun, p. ex. rifamycine
  • C12P 13/04 - Alpha- ou bêta-amino-acides
  • C12P 13/06 - AlanineLeucineIsoleucineSérineHomosérine
  • C12P 17/10 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle
  • C12P 17/12 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons
  • C12P 17/16 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant plusieurs hétérocycles
  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)

90.

KETOREDUCTASE POLYPEPTIDES AND POLYNUCLEOTIDES

      
Numéro d'application 17761126
Statut En instance
Date de dépôt 2020-09-24
Date de la première publication 2023-09-14
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Liang, Jack
  • Subramanian, Nandhitha
  • Ching, Charlene
  • Homan, David William
  • Whalen, Katie
  • Jones, Matthew Blake

Abrégé

The present invention provides engineered ketoreductase enzymes having improved properties as compared to a naturally occurring wild-type ketoreductase enzyme, as well as polynucleotides encoding the engineered ketoreductase enzymes, host cells capable of expressing the engineered ketoreductase enzymes, and methods of using the engineered ketoreductase enzymes to synthesize a chiral alcohol. The present invention further provides methods of using the engineered enzymes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)

91.

ENGINEERED MONOAMINE OXIDASES FOR THE PREPARATION OF STEREOMERICALLY PURE FUSED BICYCLIC PROLINE COMPOUNDS

      
Numéro de document 03245185
Statut En instance
Date de dépôt 2023-03-10
Date de disponibilité au public 2023-09-14
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Watts, David
  • Vroom, Jonathan
  • Hurtak, Jessica Anna

Abrégé

The present invention provides novel biocatalysts and associated methods of use for the oxidative desymmetrization of fused bicyclic proline analogues to produce APIs and intermediates. The novel biocatalysts of the present disclosure are engineered monoamine oxidase enzymes with improved solubility, thermostability, and activity on fused bicyclic proline compounds, as compared to a reference monoamine oxidase. In particular, the engineered monoamine oxidase enzymes of the present disclosure require reduced enzyme loading for the manufacturing of APIs and intermediates, as compared to a reference monoamine oxidase enzyme.

Classes IPC  ?

  • A23K 20/189 - Enzymes
  • C07D 209/52 - Composés hétérocycliques contenant des cycles à cinq chaînons condensés avec d'autres cycles, ne comportant qu'un atome d'azote comme unique hétéro-atome du cycle condensés avec un carbocycle condensés avec un cycle autre qu'un cycle à six chaînons
  • C07D 403/04 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles, comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle, non prévus par le groupe contenant deux hétérocycles liés par une liaison directe de chaînon cyclique à chaînon cyclique
  • C07D 487/04 - Systèmes condensés en ortho
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase

92.

ENGINEERED MONOAMINE OXIDASES FOR THE PREPARATION OF STEREOMERICALLY PURE FUSED BICYCLIC PROLINE COMPOUNDS

      
Numéro d'application 18181760
Statut En instance
Date de dépôt 2023-03-10
Date de la première publication 2023-09-14
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Hurtak, Jessica Anna
  • Vroom, Jonathan
  • Watts, David

Abrégé

The present invention provides novel biocatalysts and associated methods of use for the oxidative desymmetrization of fused bicyclic proline analogues to produce APIs and intermediates. The novel biocatalysts of the present disclosure are engineered monoamine oxidase enzymes with improved solubility, thermostability, and activity on fused bicyclic proline compounds, as compared to a reference monoamine oxidase. In particular, the engineered monoamine oxidase enzymes of the present disclosure require reduced enzyme loading for the manufacturing of APIs and intermediates, as compared to a reference monoamine oxidase enzyme.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)
  • C12P 17/18 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant plusieurs hétérocycles condensés entre eux ou condensés avec un système carbocyclique commun, p. ex. rifamycine

93.

ENGINEERED MONOAMINE OXIDASES FOR THE PREPARATION OF STEREOMERICALLY PURE FUSED BICYCLIC PROLINE COMPOUNDS

      
Numéro d'application US2023064092
Numéro de publication 2023/173058
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-03-10
Date de publication 2023-09-14
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Hurtak, Jessica, Anna
  • Vroom, Jonathan
  • Watts, David

Abrégé

The present invention provides novel biocatalysts and associated methods of use for the oxidative desymmetrization of fused bicyclic proline analogues to produce APIs and intermediates. The novel biocatalysts of the present disclosure are engineered monoamine oxidase enzymes with improved solubility, thermostability, and activity on fused bicyclic proline compounds, as compared to a reference monoamine oxidase. In particular, the engineered monoamine oxidase enzymes of the present disclosure require reduced enzyme loading for the manufacturing of APIs and intermediates, as compared to a reference monoamine oxidase enzyme.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C07D 209/52 - Composés hétérocycliques contenant des cycles à cinq chaînons condensés avec d'autres cycles, ne comportant qu'un atome d'azote comme unique hétéro-atome du cycle condensés avec un carbocycle condensés avec un cycle autre qu'un cycle à six chaînons
  • C07D 403/04 - Composés hétérocycliques contenant plusieurs hétérocycles, comportant des atomes d'azote comme uniques hétéro-atomes du cycle, non prévus par le groupe contenant deux hétérocycles liés par une liaison directe de chaînon cyclique à chaînon cyclique
  • C07D 487/04 - Systèmes condensés en ortho
  • A23K 20/189 - Enzymes

94.

ENGINEERED OXALATE DECARBOXYLASES

      
Numéro d'application 18167614
Statut En instance
Date de dépôt 2023-02-10
Date de la première publication 2023-09-07
Propriétaire
  • Codexis, Inc. (USA)
  • Societe des Produits Nestle S.A. (Suisse)
Inventeur(s)
  • Chng, Chinping
  • Kruse, Nikki D.
  • Liu, Joyce
  • Silverman, Adam P.
  • Thibodeau, Rebecca Hong
  • Windgassen, Tricia

Abrégé

The present disclosure provides engineered oxalate decarboxylase (ODC) polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered oxalate decarboxylase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered enzymes and compositions thereof for treating diseases or conditions associated with abnormal metabolism of oxalate.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • A61P 3/00 - Médicaments pour le traitement des troubles du métabolisme
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli

95.

PENICILLIN-G ACYLASES

      
Numéro d'application 18189091
Statut En instance
Date de dépôt 2023-03-23
Date de la première publication 2023-08-31
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Voladri, Rama
  • Micklitsch, Christopher Michael
  • Alvizo, Oscar
  • Nazor, Jovana
  • Duan, Da
  • Viduya, Judy Victoria Antonio
  • Jenne, Stephan
  • An, Chihui
  • Canada, Keith Allen
  • Devine, Paul N.
  • Farasat, Iman
  • Fryszkowska, Anna
  • Lexa, Katrina W.
  • Orr, Robert Kevin

Abrégé

The present invention provides engineered penicillin G acylase (PGA) enzymes, polynucleotides encoding the enzymes, compositions comprising the enzymes, and methods of using the engineered PGA enzymes.

Classes IPC  ?

96.

Engineered proline hydroxylase biocatalysts for hydroxylation of chemical compounds

      
Numéro d'application 18180711
Numéro de brevet 12286648
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-03-08
Date de la première publication 2023-08-31
Date d'octroi 2025-04-29
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Nazor, Jovana
  • Osborne, Robert
  • Liang, Jack
  • Vroom, Jonathan
  • Zhang, Xiyun
  • Entwistle, David
  • Voladri, Rama
  • Garcia, Ravi David
  • Moore, Jeffrey C.
  • Grosser, Shane
  • Kosjek, Birgit
  • Truppo, Matthew

Abrégé

The present invention provides engineered proline hydroxylase polypeptides for the production of hydroxylated compounds, polynucleotides encoding the engineered proline hydroxylases, host cells capable of expressing the engineered proline hydroxylases, and methods of using the engineered proline hydroxylases to prepare compounds useful in the production of active pharmaceutical agents.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12P 17/12 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons

97.

KETOREDUCTASE POLYPEPTIDES FOR THE REDUCTION OF ACETOPHENONES

      
Numéro d'application 17932420
Statut En instance
Date de dépôt 2022-09-15
Date de la première publication 2023-08-17
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Liang, Jack
  • Jenne, Stephane J.
  • Mundorff, Emily
  • Ching, Charlene
  • Gruber, John M.
  • Krebber, Anke
  • Huisman, Gjalt W.

Abrégé

The present disclosure provides engineered ketoreductase enzymes having improved properties as compared to a naturally occurring wild-type ketoreductase enzyme. Also provided are polynucleotides encoding the engineered ketoreductase enzymes, host cells capable of expressing the engineered ketoreductase enzymes, and methods of using the engineered ketoreductase enzymes to synthesize a variety of chiral compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12P 7/22 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle aromatiques

98.

ENGINEERED OXALATE DECARBOXYLASES

      
Numéro d'application US2023062408
Numéro de publication 2023/154879
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-02-10
Date de publication 2023-08-17
Propriétaire
  • CODEXIS, INC. (USA)
  • SOCIETE DES PRODUITS NESTLE S.A. (Suisse)
Inventeur(s)
  • Chng, Chinping
  • Kruse, Nikki, D.
  • Liu, Joyce
  • Silverman, Adam, P.
  • Thibodeau, Rebecca, Hong
  • Windgassen, Tricia

Abrégé

The present disclosure provides engineered oxalate decarboxylase (ODC) polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered oxalate decarboxylase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered enzymes and compositions thereof for treating diseases or conditions associated with abnormal metabolism of oxalate.

Classes IPC  ?

99.

ENGINEERED ENONE REDUCTASE AND KETOREDUCTASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro de document 03248807
Statut En instance
Date de dépôt 2023-02-01
Date de disponibilité au public 2023-08-10
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Seibel, Zara Maxine
  • Ching, Charlene
  • Jenne, Stephan
  • Elgart, David
  • Nazor, Jovana
  • Matzdorff, Larson Lyle
  • Rohovie, Marcus

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 15/00 - Techniques de mutation ou génie génétiqueADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p. ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purificationUtilisation d'hôtes pour ceux-ci

100.

NOVEL P450-BM3 VARIANTS WITH IMPROVED ACTIVITY

      
Numéro d'application 18153620
Statut En instance
Date de dépôt 2023-01-12
Date de la première publication 2023-08-10
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Osborne, Robert
  • Mitchell, Vesna
  • Htwe, Khin Yu Naing
  • Zhang, Xiyun
  • Milczek, Erika M.
  • Moore, Jeffrey C.

Abrégé

The present invention provides improved P450-BM3 variants with improved activity. In some embodiments, the P450-BM3 variants exhibit improved activity over a wide range of substrates.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 1/16 - LevuresLeurs milieux de culture
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
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