Codexis, Inc.

États‑Unis d’Amérique

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Type PI
        Brevet 786
        Marque 31
Juridiction
        États-Unis 521
        International 239
        Canada 53
        Europe 4
Date
Nouveautés (dernières 4 semaines) 2
2026 juillet 2
2026 juin 1
2026 mai 2
2026 avril 1
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Classe IPC
C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase 147
C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1) 134
C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote 130
C12N 9/10 - Transférases (2.) 125
C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes 83
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Classe NICE
01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture 19
09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques 10
40 - Traitement de matériaux; recyclage, purification de l'air et traitement de l'eau 10
42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception 8
05 - Produits pharmaceutiques, vétérinaires et hygièniques 1
Statut
En Instance 116
Enregistré / En vigueur 701
  1     2     3     ...     9        Prochaine page

1.

ENGINEERED RNASE INHIBITOR VARIANTS

      
Numéro d'application 19142170
Statut En instance
Date de dépôt 2023-12-21
Date de la première publication 2026-07-30
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Knight, Anders Matthew
  • Ng, Simon

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNase inhibitor polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNase inhibitor polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNase inhibitor polypeptides or compositions thereof for molecular biological, diagnostic and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères
  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]

2.

CARBOXYESTERASE POLYPEPTIDES FOR KINETIC RESOLUTION

      
Numéro d'application 19571984
Statut En instance
Date de dépôt 2026-03-19
Date de la première publication 2026-07-09
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Voladri, Rama
  • Hurtak, Jessica Anna
  • Sowell-Kantz, Auric Anthony
  • Subramanian, Nandhitha
  • Bermudez, Ericka
  • Entwistle, David
  • Mayo, Melissa Ann
  • Riggins, James Nicholas

Abrégé

The present invention provides engineered carboxyesterase enzymes having improved properties as compared to a naturally occurring wild-type carboxyesterase enzymes, as well as polynucleotides encoding the engineered carboxyesterase enzymes, host cells capable of expressing the engineered carboxyesterase enzymes, and methods of using the engineered carboxyesterase enzymes in hydrolysis reactions.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/18 - Hydrolases agissant sur les esters d'acides carboxyliques

3.

DNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 19127897
Statut En instance
Date de dépôt 2023-11-08
Date de la première publication 2026-06-25
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Bermudez, Ericka
  • Elgart, David
  • Fell, Jason
  • Li, Michelle
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Miller, Mathew G.
  • Mitchell, Vesna
  • Nazor, Jovana
  • Nelson, Kevin S.
  • Walker, Scotty
  • Muerhoff, Anthony S.
  • Cheng, Shouqiang
  • Christensen, David
  • Case, Alicia
  • Marohnic, Christopher
  • Nahrjou, Nazanin

Abrégé

The present disclosure relates to engineered DNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered DNA polymerase polypeptides or compositions thereof for diagnostic and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12Q 1/686 - Réaction en chaine par polymérase [PCR]
  • C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage

4.

RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2025055168
Numéro de publication 2026/107080
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-11-12
Date de publication 2026-05-21
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Copeland, Rachelle
  • Duran, Aldo
  • Knight, Anders
  • Krishnamoorthy, Kalyan
  • Nguyen, James

Abrégé

The present disclosure provides engineered RNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of producing and using the engineered RNA polymerase polypeptides or compositions thereof for producing RNA.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

5.

USES OF PURINE NUCLEOSIDASE AND AMP PHOSPHORYLASE

      
Numéro d'application US2025054904
Numéro de publication 2026/102434
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-11-11
Date de publication 2026-05-15
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie, Marie
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure relates to methods of using purine nucleosidase and/or AMP phosphorylase for increasing product formation in enzymatic reactions that generate reaction product nucleoside-5'-monophosphate (NMP), particularly AMP.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/24 - Hydrolases (3.) agissant sur les composés glycosyliques (3.2)
  • C12P 19/38 - Nucléosides

6.

ENGINEERED ADENYLYL-SULFATE KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2025050530
Numéro de publication 2026/080865
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-10-10
Date de publication 2026-04-16
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bermudez, Ericka
  • Duran, Aldo
  • Forget, Stephanie, Marie
  • Krawczyk, Mikayla, Jianghongxia
  • Krishnamoorthy, Kalyanaraman
  • Kruse, Nikki, D.
  • Macavoy, Marissa, G.
  • Mayo, Melissa, Ann
  • Mcentee, Michele
  • Petkova, Aksiniya, Lyubenova
  • Porter, Nicholas
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present invention provides engineered adenylyl-sulfate kinase polypeptides capable of adding a phosphate group to the 3' position of the sugar of a natural or modified nucleoside diphosphate, as well as compositions and methods of utilizing these engineered polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 19/30 - Nucléotides
  • C07K 14/195 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12N 5/10 - Cellules modifiées par l'introduction de matériel génétique étranger, p. ex. cellules transformées par des virus
  • C12N 1/21 - BactériesLeurs milieux de culture modifiés par l'introduction de matériel génétique étranger

7.

TRANSAMINASE BIOCATALYSTS

      
Numéro d'application 19254921
Statut En instance
Date de dépôt 2025-06-30
Date de la première publication 2026-03-19
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Saville, Christopher K.
  • Mundorff, Emily
  • Moore, Jeffrey C.
  • Devine, Paul N.
  • Janey, Jacob M.

Abrégé

The present disclosure relates to polypeptides having transaminase activity, polynucleotides encoding the polypeptides, and methods of using the polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/18 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant plusieurs hétérocycles condensés entre eux ou condensés avec un système carbocyclique commun, p. ex. rifamycine
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/62 - Séquences d'ADN codant pour des protéines de fusion
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote

8.

BIOCATALYSTS AND METHODS FOR SYNTHESIZING DERIVATIVES OF TRYPTAMINE AND TRYPTAMINE ANALOGS

      
Numéro d'application 19278336
Statut En instance
Date de dépôt 2025-07-23
Date de la première publication 2026-02-26
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Nazor, Jovana
  • Smith, Derek J.
  • Crowe, Michael A.
  • Song, Shiwei
  • Collier, Steven J.

Abrégé

The present disclosure provides engineered transaminase polypeptides for the production of amines, polynucleotides encoding the engineered transaminases, host cells capable of expressing the engineered transaminases, and methods of using the engineered transaminases to prepare compounds useful in the production of active pharmaceutical agents.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12P 17/10 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle

9.

ENONE REDUCTASES

      
Numéro d'application 19272475
Statut En instance
Date de dépôt 2025-07-17
Date de la première publication 2026-02-12
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Savile, Christopher K.
  • Mitchell, Vesna
  • Zhang, Xiyun
  • Huisman, Gjalt

Abrégé

The disclosure relates to engineered enone reductase polypeptides having improved properties, polynucleotides encoding the engineered polypeptides, related vectors, host cells, and methods for making the engineered enone reductase polypeptides. The disclosure also provides methods of using the engineered enone reductase polypeptides for chemical transformations.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 15/00 - Techniques de mutation ou génie génétiqueADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p. ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purificationUtilisation d'hôtes pour ceux-ci
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12P 7/26 - Cétones
  • C12P 7/52 - Acide propioniqueAcides butyriques
  • C12P 7/62 - Esters d’acides carboxyliques
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote

10.

ENGINEERED GALACTOSE OXIDASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 19366048
Statut En instance
Date de dépôt 2025-10-22
Date de la première publication 2026-02-12
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Micklitsch, Christopher
  • Alvizo, Oscar
  • Nazor, Jovana
  • Maniar, Harvinder Chagger
  • Krawczyk, Mikayla Jianghongxia
  • Borra-Garske, Margie Tabuga
  • Subramanian, Nandhitha
  • Fryszkowska, Anna
  • Marshall, Nicholas M.
  • Rodriguez-Granillo, Agustina
  • Verma, Deeptak
  • Andrews, Dewan

Abrégé

The present invention provides engineered galactose oxidase (GOase) enzymes, polypeptides having GOase activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing GOase enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the GOase enzymes and methods of using the engineered GOase enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical and other compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 21/02 - Préparation de peptides ou de protéines comportant une séquence connue de plusieurs amino-acides, p. ex. glutathion

11.

ENGINEERED SUCROSE PHOSPHORYLASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 19364514
Statut En instance
Date de dépôt 2025-10-21
Date de la première publication 2026-02-05
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Vroom, Jonathan
  • Sivaramakrishnan, Santhosh
  • Subramanian, Nandhitha

Abrégé

The present invention provides engineered sucrose phosphorylase (SP) enzymes, polypeptides having SP activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing SP enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the SP enzymes and methods of using the engineered SP enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 15/72 - Systèmes d'expression utilisant des séquences régulatrices dérivées de l'opéron lac

12.

TRANSAMINASE POLYPEPTIDES

      
Numéro d'application 19352911
Statut En instance
Date de dépôt 2025-10-08
Date de la première publication 2026-01-29
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Dhawan, Ish K.
  • Miller, Gregory
  • Zhang, Xiyun

Abrégé

The present disclosure provides engineered transaminase enzymes having improved properties as compared to a naturally occurring wild-type transaminase enzyme. Also provided are polynucleotides encoding the engineered transaminase enzymes, host cells capable of expressing the engineered transaminase enzymes, and methods of using the engineered transaminase enzymes to synthesize a variety of chiral compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 41/00 - Procédés utilisant des enzymes ou des micro-organismes pour la séparation d'isomères optiques à partir d'un mélange racémique

13.

ENGINEERED NITROALDOLASES

      
Numéro d'application 18868597
Statut En instance
Date de dépôt 2023-06-06
Date de la première publication 2026-01-22
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Novick, Scott J.
  • Subramanian, Nandhitha
  • Schlama, Thierry

Abrégé

The present invention provides engineered nitroaldolase polypeptides useful for the production of the β-nitro alcohols, as well as polynucleotides, compositions, and methods utilizing these engineered polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12R 1/19 - Escherichia coli
  • C40B 40/10 - Bibliothèques comprenant des peptides ou des polypeptides ou leurs dérivés

14.

ENGINEERED PHOSPHOPENTOMUTASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 19328851
Statut En instance
Date de dépôt 2025-09-15
Date de la première publication 2026-01-08
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Novick, Scott J.
  • Yi, Xiang
  • Dellas, Nikki
  • Alvizo, Oscar
  • Nazor, Jovana
  • Duan, Da
  • Mitchell, Vesna
  • Vroom, Jonathan
  • Sivaramakrishnan, Santhosh
  • Subramanian, Nandhitha
  • Moore, Jeffrey C.
  • Huffman, Mark
  • Rodriguez-Granillo, Agustina
  • Verma, Deeptak
  • Murphy, Grant S.
  • Marshall, Nicholas
  • Russell, Jay
  • Canada, Keith A.

Abrégé

The present invention provides engineered phosphopentomutase (PPM) enzymes, polypeptides having PPM activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing PPM enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the PPM enzymes and methods of using the engineered PPM enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/90 - Isomérases (5.)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/74 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes procaryotes autres que E. coli, p. ex. Lactobacillus, Micromonospora
  • C12N 15/81 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour champignons pour levures

15.

ENGINEERED 3'O-KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2025034048
Numéro de publication 2025/264722
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-06-17
Date de publication 2025-12-26
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Duran, Aldo
  • Krawczyk, Mikayla, Jianghongxia
  • Krishnamoorthy, Kalyanaraman
  • Kruse, Nikki, D.
  • Mayo, Melissa, Ann
  • Riggins, James, Nicholas

Abrégé

The present invention provides engineered 3' O-kinase polypeptides capable of adding a phosphate group to the 3' position of the sugar of a natural or modified nucleoside triphosphate, as well as compositions and methods of utilizing these engineered polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12P 19/32 - Nucléotides avec un système cyclique condensé, contenant un cycle à six chaînons, comportant deux atomes d'azote dans le même cycle, p. ex. nucléotides puriques, dinucléotide de la nicotinamide-adénine
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
  • C12P 19/38 - Nucléosides

16.

ENZYMATIC SYNTHESIS OF NTP AND 3'-PHOSPHORYLATED NUCLEOTIDES

      
Numéro d'application US2025034294
Numéro de publication 2025/264882
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-06-18
Date de publication 2025-12-26
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bermudez, Ericka
  • Duran, Aldo
  • Entwistle, David
  • Forget, Stephanie, Marie
  • Knight, Anders, Matthew
  • Krawczyk, Mikayla, Jianghongxia
  • Krishnamoorthy, Kalyanaraman
  • Kruse, Nikki, D.
  • Mayo, Melissa, Ann
  • Mcentee, Michele
  • Ng, Simon
  • Petkova, Aksiniya, Lyubenova
  • Porter, Nicholas
  • Provencher, Philip
  • Shoubber, Amani
  • Teadt, Leann, Quertinmont
  • Vroom, Jonathan
  • Watts, David
  • Wong, Leland, Ken
  • Macavoy, Marissa, Greene

Abrégé

The present disclosure provides enzymatic methods for the production of 3'-phosphatenucleoside-5'-triphosphate (NQP). The present disclosure further provides enzymatic methods for the production of nucleotide-5'-triphosphates. In some embodiments, a method of producing a nucleotide triphosphate with a phosphate group at the 3' position of the sugar moiety (NQP), the method comprising at least: contacting a nucleoside diphosphate (NDP) with a nucleoside diphosphate kinase, a 3' -O-kinase, and a phosphate donor under reaction conditions such that a NTP with a phosphate group on the 3' position of the sugar moiety (NQP) is produced.

Classes IPC  ?

17.

ENGINEERED IMINE REDUCTASES AND METHODS FOR THE REDUCTIVE AMINATION OF KETONE AND AMINE COMPOUNDS

      
Numéro d'application 19317976
Statut En instance
Date de dépôt 2025-09-03
Date de la première publication 2025-12-25
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Chen, Haibin
  • Collier, Steven J.
  • Nazor, Jovana
  • Sukumaran, Joly
  • Smith, Derek
  • Moore, Jeffrey C.
  • Hughes, Gregory
  • Janey, Jacob
  • Huisman, Gjalt W.
  • Novick, Scott J.
  • Agard, Nicholas J.
  • Alvizo, Oscar
  • Cope, Gregory A.
  • Yeo, Wan Lin
  • Minor, Stefanie Ng

Abrégé

The present disclosure provides engineered polypeptides having imine reductase activity, polynucleotides encoding the engineered imine reductases, host cells capable of expressing the engineered imine reductases, and methods of using these engineered polypeptides with a range of ketone and amine substrate compounds to prepare secondary and tertiary amine product compounds.

Classes IPC  ?

  • C12P 13/02 - Amides, p. ex. chloramphénicol
  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 13/04 - Alpha- ou bêta-amino-acides
  • C12P 13/06 - AlanineLeucineIsoleucineSérineHomosérine
  • C12P 17/10 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle
  • C12P 17/12 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons
  • C12P 17/16 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant plusieurs hétérocycles
  • C12P 17/18 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant plusieurs hétérocycles condensés entre eux ou condensés avec un système carbocyclique commun, p. ex. rifamycine

18.

KETOREDUCTASE POLYPEPTIDES FOR THE REDUCTION OF ACETOPHENONES

      
Numéro d'application 19306129
Statut En instance
Date de dépôt 2025-08-21
Date de la première publication 2025-12-04
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Liang, Jack
  • Jenne, Stephane J.
  • Mundorff, Emily
  • Ching, Charlene
  • Gruber, John M.
  • Krebber, Anke
  • Huisman, Gjalt W.

Abrégé

The present disclosure provides engineered ketoreductase enzymes having improved properties as compared to a naturally occurring wild-type ketoreductase enzyme. Also provided are polynucleotides encoding the engineered ketoreductase enzymes, host cells capable of expressing the engineered ketoreductase enzymes, and methods of using the engineered ketoreductase enzymes to synthesize a variety of chiral compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli

19.

LIGATION OF POLYNUCLEOTIDES BY LIGASES AND SCREENING METHODS THEREOF

      
Numéro d'application US2025029185
Numéro de publication 2025/240509
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-05-13
Date de publication 2025-11-20
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bimm, Alexander, Jacob
  • Dorigatti, Jonathan, Dewayne
  • Jenne, Stephan
  • Kadam, Supriya, Vijaykumar
  • Miller, Mathew, G.

Abrégé

The present disclosure provides a method of predicting a reaction condition activity profile of a ligase for a ligase substrate by Gaussian Process Regression using activity data obtained for different reaction conditions. Further provided is a method of screening a plurality of ligases for activity on a ligase substrate for identifying ligases active on the ligase substrate.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/25 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des enzymes qui ne peuvent pas être classées dans les groupes
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • G16C 20/10 - Analyse ou conception des réactions, des synthèses ou des procédés chimiques
  • G16C 20/30 - Prévision des propriétés des composés, des compositions ou des mélanges chimiques

20.

PENICILLIN-G ACYLASES

      
Numéro d'application 19276625
Statut En instance
Date de dépôt 2025-07-22
Date de la première publication 2025-11-13
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Banerjee, Goutami
  • Yang, Jie
  • Zhang, Xiyun
  • Milczek, Erika M.
  • Mayo, Melissa Ann
  • Jenne, Stephan

Abrégé

The present disclosure relates to engineered penicillin G acylase (PGA) enzymes having improved properties, polynucleotides encoding such enzymes, compositions including the enzymes, and methods of using the enzymes.

Classes IPC  ?

21.

KETOREDUCTASE POLYPEPTIDES FOR THE PRODUCTION OF (R)-3-HYDROXYTHIOLANE

      
Numéro d'application 19278269
Statut En instance
Date de dépôt 2025-07-23
Date de la première publication 2025-11-13
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Liang, Jack S.
  • Jenne, Stephan
  • Mundorff, Emily
  • Voladri, Rama
  • Lalonde, James J.
  • Huisman, Gjalt W.

Abrégé

The present disclosure provides engineered ketoreductase enzymes having improved properties as compared to a naturally occurring wild-type ketoreductase enzyme. Also provided are polynucleotides encoding the engineered ketoreductase enzymes, host cells capable of expressing the engineered ketoreductase enzymes, and methods of using the engineered ketoreductase enzymes to synthesize chiral compounds.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/00 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12P 17/16 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant plusieurs hétérocycles

22.

ENGINEERED IMINE REDUCTASES AND METHODS FOR THE REDUCTIVE AMINATION OF KETONE AND AMINE COMPOUNDS

      
Numéro d'application 19237906
Statut En instance
Date de dépôt 2025-06-13
Date de la première publication 2025-11-13
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Mayo, Melissa Ann
  • Moore, Jeffrey C.

Abrégé

The present application provides engineered polypeptides having imine reductase activity, polynucleotides encoding the engineered imine reductases, host cells capable of expressing the engineered imine reductases, and methods of using these engineered polypeptides with a range of ketone and amine substrate compounds to prepare secondary and tertiary amine product compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)
  • C07K 14/195 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote

23.

DNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2025028112
Numéro de publication 2025/235589
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-05-07
Date de publication 2025-11-13
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bakhtina, Marina Mikhailovna
  • Bermudez, Ericka
  • Kruse, Nikki D.
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Mitchell, Vesna
  • Nazor, Jovana
  • Christensen, David
  • Marohnic, Christopher C.
  • Muerhoff, Anthony S.
  • Walker, Scotty
  • Woolery, Andrew
  • Zhang, Qingbei

Abrégé

The present disclosure relates to engineered DNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered DNA polymerase polypeptides or compositions thereof for diagnostic and molecular biological applications.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/54 - Transférases (2)

24.

ENGINEERED TRANSAMINASE POLYPEPTIDES FOR INDUSTRIAL BIOCATALYSIS

      
Numéro d'application 19272619
Statut En instance
Date de dépôt 2025-07-17
Date de la première publication 2025-11-06
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Quintanar-Audelo, Martina
  • Eberhard, Ellen
  • Nazor, Jovana
  • Smith, Derek
  • Wang, Cuixia

Abrégé

The present disclosure provides engineered transaminase polypeptides useful for the synthesis of chiral amine compounds under industrially relevant conditions. The disclosure also provides polynucleotides encoding the engineered transaminase polypeptides, host cells capable of expressing the engineered transaminases, and methods of using the engineered transaminases for the production of chiral amine compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C07D 487/04 - Systèmes condensés en ortho
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 17/18 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant plusieurs hétérocycles condensés entre eux ou condensés avec un système carbocyclique commun, p. ex. rifamycine

25.

NOVEL P450-BM3 VARIANTS WITH IMPROVED ACTIVITY

      
Numéro d'application 19249225
Statut En instance
Date de dépôt 2025-06-25
Date de la première publication 2025-10-23
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Osborne, Robert
  • Mitchell, Vesna
  • Htwe, Khin Yu Naing
  • Zhang, Xiyun
  • Milczek, Erika M.
  • Moore, Jeffrey C.

Abrégé

The present invention provides improved P450-BM3 variants with improved activity. In some embodiments. the P450-BM3 variants exhibit improved activity over a wide range of substrates.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C07K 14/80 - Cytochromes
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote

26.

COMPOSITIONS AND METHODS OF REDUCING CONVERSION OF PHOSPHOROTHIOATE BONDS

      
Numéro d'application US2025024806
Numéro de publication 2025/221814
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-04-15
Date de publication 2025-10-23
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Gauntlett, Derek, James Clifford
  • Hunter, Mckenzie
  • Hurlburt, Tyler
  • Reeves, Ryan, D.
  • Velzy, Wynne
  • Watts, David
  • Bernt, Sebastien

Abrégé

In some embodiments, the present disclosure is directed to compositions and methods of reducing conversion of phosphorothioate bonds during the synthesis and storage of oligonucleotides. In some related embodiments, the present disclosure is directed to compositions and methods of reducing conversion of thio-NTPs. In some embodiments, the methods or compositions of the present disclosure find use in reducing phosphorothioate to phosphodiester impurities in an oligonucleotide or therapeutic oligonucleotide.

Classes IPC  ?

  • A61K 31/7125 - Acides nucléiques ou oligonucléotides ayant des liaisons internucléosides modifiées, c.-à-d. autres que des liaisons 3'-5' phosphodiester
  • A61P 39/06 - Antiradicaux libres ou antioxydants
  • B01D 19/00 - Dégazage de liquides

27.

IMMOBILIZED TERMINAL NUCLEOTIDYL TRANSFERASES

      
Numéro d'application US2025024818
Numéro de publication 2025/221822
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-04-15
Date de publication 2025-10-23
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Chen, Pei Ju
  • Gauntlett, Derek, James Clifford
  • Hurlburt, Tyler
  • Reeves, Ryan
  • Watts, David

Abrégé

The present invention provides methods of preparing immobilized engineered terminal nucleotidyl transferase (TnT) polypeptides, and compositions and methods for using these immobilized enzymes in processes for template-independent oligonucleotide synthesis.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/22 - Ribonucléases
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C07H 3/10 - Anhydrosucres, p. ex. époxides
  • C07C 217/50 - Éthers d'hydroxyamines de structure indéterminée, p. ex. obtenus par réaction d'époxydes avec des hydroxyamines
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides

28.

RECOMBINANT PHOSPHATASES

      
Numéro d'application US2025024919
Numéro de publication 2025/221860
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-04-16
Date de publication 2025-10-23
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bakhtina, Marina
  • Forget, Stephanie
  • Shoubber, Amani
  • Vojcic, Ljubica
  • Vroom, Jonathan
  • Watts, David
  • Kruse, Nikki D.

Abrégé

The present disclosure relates to recombinant phosphatases and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the recombinant phosphatases. The present disclosure also provides methods of using the recombinant phosphatases or compositions thereof for molecular biological, diagnostic, and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C07K 14/195 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries
  • C07K 14/32 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries provenant de Bacillus (G)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

29.

USES OF TYPE II AND TYPE I INORGANIC PYROPHOSPHATASES

      
Numéro d'application US2025024998
Numéro de publication 2025/221909
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-04-16
Date de publication 2025-10-23
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie, Marie
  • Li, Michelle
  • Shoubber, Amani
  • Vojcic, Ljubica
  • Vroom, Jonathan
  • Watts, David

Abrégé

The present disclosure provides uses of type II and variant type I and type II inorganic pyrophosphatases under nonnatural conditions present in industrial applications. In another aspect, the present disclosure describes compositions and methods of using inorganic pyrophosphatases with nucleoside triphosphates and in coupled reactions with a second enzyme.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/68 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des acides nucléiques
  • C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
  • B01J 19/00 - Procédés chimiques, physiques ou physico-chimiques en généralAppareils appropriés
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

30.

ENGINEERED TERMINAL NUCLEOTIDYL TRANSFERASE VARIANTS AND USES THEREOF

      
Numéro d'application US2025025040
Numéro de publication 2025/221943
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-04-16
Date de publication 2025-10-23
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie, Marie
  • Li, Michelle
  • Vroom, Jonathan
  • Wong, Leland, Ken

Abrégé

The present disclosure provides engineered terminal nucleotidyl transferase (TnT) polypeptides useful in template-independent polynucleotide synthesis, as well as compositions, methods of utilizing these engineered polypeptides, and polynucleotides encoding the engineered terminal nucleotidyl transferases.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]

31.

ALKALINE PHOSPHATASE IMMOBILIZATION

      
Numéro d'application US2025024787
Numéro de publication 2025/221802
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-04-15
Date de publication 2025-10-23
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Gauntlett, Derek, James Clifford
  • Hurlburt, Tyler
  • Reeves, Ryan
  • Watts, David

Abrégé

Alkaline phosphatases immobilized on an epoxide functionalized solid support such as polyacrylate, phenolate, polystyrene, polysaccharide, or silica, are provided herein. Methods of synthesizing the immobilized alkaline phosphatases, utilizing an epoxide quenching reagent to deactivate the unreacted epoxide groups on the solid support, are disclosed. These immobilized alkaline phosphatases may be used in various processes for cleaving a phosphate group.

Classes IPC  ?

  • C12N 11/08 - Enzymes ou cellules microbiennes immobilisées sur ou dans un support organique le support étant un polymère synthétique
  • A61K 38/46 - Hydrolases (3)
  • C12N 11/10 - Enzymes ou cellules microbiennes immobilisées sur ou dans un support organique le support étant un hydrate de carbone
  • C12N 11/14 - Enzymes ou cellules microbiennes immobilisées sur ou dans un support inorganique

32.

RECOMBINANT PRIMASES AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application US2025024970
Numéro de publication 2025/221892
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-04-16
Date de publication 2025-10-23
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Borra-Garske, Margie
  • Garcia, Ravi
  • Hallows, William Casey
  • Knight, Anders Matthew
  • Kruse, Nikki
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure relates to recombinant primase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the recombinant primase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the recombinant primase polypeptides or compositions thereof for molecular biological, diagnostic, and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 19/30 - Nucléotides
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides

33.

RNA LIGASE MEDIATED OLIGONUCLEOTIDE SYNTHESIS

      
Numéro d'application US2025025017
Numéro de publication 2025/221925
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-04-16
Date de publication 2025-10-23
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie, Marie
  • Knight, Anders, Matthew
  • Kruse, Nikki, D.
  • Porter, Nicholas
  • Shoubber, Amani
  • Vojcic, Ljubica
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure relates to methods of using single-stranded RNA ligase for synthesis of oligonucleotides, including oligonucleotides containing a conjugate moiety. In some embodiments, the present disclosure further provides recombinant single-stranded RNA ligases, polynucleotides encoding the recombinant single-stranded RNA ligases, and compositions of the single-stranded RNA ligases.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

34.

ENGINEERED TERMINAL NUCLEOTIDYL TRANSFERASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2025025032
Numéro de publication 2025/221936
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-04-16
Date de publication 2025-10-23
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie, Marie
  • Li, Michelle
  • Mayo, Melissa, Ann
  • Vroom, Jonathan
  • Wong, Leland, Ken
  • Elgart, David
  • Knight, Anders, Matthew

Abrégé

The present invention provides engineered terminal nucleotidyl transferase (TnT) polypeptides useful in template-independent polynucleotide synthesis, as well as compositions, methods of utilizing these engineered polypeptides, and polynucleotides encoding the engineered terminal nucleotidyl transferases.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
  • C12Q 1/6806 - Préparation d’acides nucléiques pour analyse, p. ex. pour test de réaction en chaîne par polymérase [PCR]

35.

ENGINEERED TRANSAMINASE POLYPEPTIDES

      
Numéro d'application 19203721
Statut En instance
Date de dépôt 2025-05-09
Date de la première publication 2025-10-16
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Novick, Scott J.
  • Dellas, Nikki

Abrégé

The present disclosure provides engineered transaminase polypeptides useful for the synthesis of chiral amine compounds under industrially relevant conditions. The disclosure also provides polynucleotides encoding the engineered transaminase polypeptides, host cells capable of expressing the engineered transaminases, and methods of using the engineered transaminases for the production of chiral amine compounds.

Classes IPC  ?

36.

SYSTEMS AND METHODS FOR ENZYMATIC OLIGONUCLEOTIDE SYNTHESIS

      
Numéro d'application US2025024415
Numéro de publication 2025/217610
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-04-11
Date de publication 2025-10-16
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Entwistle, David
  • Gauntlett, Derek, James Clifford
  • Miller, Michael
  • Reeves, Ryan, D.
  • Watts, David

Abrégé

The present invention provides for methods and systems for template-free synthesis of an oligonucleotide, and methods of using the systems as disclosed herein for template-free synthesis of an oligonucleotide.

Classes IPC  ?

  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
  • C40B 50/08 - Synthèse en phase liquide, c.-à-d. dans laquelle tous les blocs servant à créer la bibliothèque sont en phase liquide ou en solution au cours de la création de la bibliothèqueProcédés particuliers de clivage à partir du support liquide
  • C07K 1/02 - Procédés généraux de préparation de peptides en solution
  • C07K 1/06 - Procédés généraux de préparation de peptides utilisant des groupes protecteurs ou des agents d'activation
  • C07K 1/16 - ExtractionSéparationPurification par chromatographie
  • C07K 7/00 - Peptides ayant de 5 à 20 amino-acides dans une séquence entièrement déterminéeLeurs dérivés
  • C12Q 2521/501 -
  • C12Q 2521/525 -

37.

ENGINEERED IMINE REDUCTASES AND METHODS FOR THE REDUCTIVE AMINATION OF KETONE AND AMINE COMPOUNDS

      
Numéro d'application 19217210
Statut En instance
Date de dépôt 2025-05-23
Date de la première publication 2025-10-02
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Agard, Nicholas J.
  • Alvizo, Oscar
  • Mayo, Melissa Ann
  • Minor, Stefanie Ng
  • Riggins, James Nicholas
  • Moore, Jeffrey C.

Abrégé

The present application provides engineered polypeptides having imine reductase activity, polynucleotides encoding the engineered imine reductases, host cells capable of expressing the engineered imine reductases, and methods of using these engineered polypeptides with a range of ketone and amine substrate compounds to prepare secondary and tertiary amine product compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 17/10 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle

38.

BIOCATALYSTS AND METHODS FOR HYDROXYLATION OF CHEMICAL COMPOUNDS

      
Numéro d'application 19227949
Statut En instance
Date de dépôt 2025-06-04
Date de la première publication 2025-09-18
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Vroom, Jonathan
  • Ortega Guerra, Alberto
  • Liang, Jack
  • Cope, Gregory A.
  • Dellas, Nikki
  • Prier, Christopher Keltie

Abrégé

The present invention provides engineered proline hydroxylase polypeptides for the production of hydroxylated compounds, polynucleotides encoding the engineered proline hydroxylases, host cells capable of expressing the engineered proline hydroxylases, and methods of using the engineered proline hydroxylases to prepare compounds useful in the production of active pharmaceutical agents.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12P 13/24 - ProlineHydroxyprolineHistidine

39.

MAXFI

      
Numéro de série 99385366
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2025-09-10
Date d'enregistrement 2026-02-17
Propriétaire Codexis, Inc. ()
Classes de Nice  ? 01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture

Produits et services

Enzymes for scientific and research purposes

40.

ENGINEERED DNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 19083377
Statut En instance
Date de dépôt 2025-03-18
Date de la première publication 2025-08-07
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Miller, Mathew G.
  • Mitchell, Vesna
  • Nazor, Jovana
  • Baskerville, Donald S.
  • Dellas, Nikki
  • Elgart, David
  • Vroom, Jonathan
  • Gomes, Sandy M.
  • Subramanian, Nandhitha
  • Bermudez, Ericka

Abrégé

The present invention provides engineered DNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA polymerase polypeptides. The invention also provides methods for use of the compositions comprising the engineered DNA polymerase polypeptides for diagnostic and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

41.

ENGINEERED TRANSAMINASE POLYPEPTIDES FOR INDUSTRIAL BIOCATALYSIS

      
Numéro d'application 19183477
Statut En instance
Date de dépôt 2025-04-18
Date de la première publication 2025-08-07
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Novick, Scott J.
  • Dellas, Nikki
  • Alivizo, Oscar
  • Garcia, Ravi David
  • Ching, Charlene
  • Entwistle, David

Abrégé

The present invention provides engineered transaminase polypeptides useful for the synthesis of chiral amine compounds under industrially relevant conditions. The invention also provides polynucleotides encoding the engineered transaminase polypeptides, host cells capable of expressing the engineered transaminases, and methods of using the engineered transaminases for the production of chiral amine compounds.

Classes IPC  ?

42.

BIOCATALYSTS AND METHODS FOR HYDROXYLATION OF CHEMICAL COMPOUNDS

      
Numéro d'application 19172267
Statut En instance
Date de dépôt 2025-04-07
Date de la première publication 2025-07-24
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Nazor, Jovana
  • Osbome, Robert
  • Liang, Jack
  • Vroom, Jonathan
  • Zhang, Xiyun
  • Entwistle, David
  • Voladri, Rama
  • Garcia, Ravi David
  • Moore, Jeffrey C.
  • Grosser, Shane
  • Kosjek, Birgit
  • Truppo, Matthew

Abrégé

The present invention provides engineered proline hydroxylase polypeptides for the production of hydroxylated compounds, polynucleotides encoding the engineered proline hydroxylases, host cells capable of expressing the engineered proline hydroxylases, and methods of using the engineered proline hydroxylases to prepare compounds useful in the production of active pharmaceutical agents.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12P 17/12 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons

43.

ECO SYNTHESIS

      
Numéro de série 99284356
Statut En instance
Date de dépôt 2025-07-15
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Classes de Nice  ? 01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture

Produits et services

Reagents and enzymes for use in the manufacture of enzymatic catalyzed oligonucleotides for scientific and research use

44.

ENGINEERED RNA LIGASES

      
Numéro de document 03317072
Statut En instance
Date de dépôt 2025-01-03
Date de disponibilité au public 2025-07-10
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Elgart, David
  • Garcia, Ravi David
  • Kruse, Nikki D.
  • Miller, Mathew G.
  • Nazor, Jovana
  • Rui, Zhe
  • Srivastava, Arya

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA ligase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA ligase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA ligase polypeptides or compositions thereof for molecular biological, diagnostic, and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

45.

ENGINEERED RNA LIGASES

      
Numéro d'application 19009695
Statut En instance
Date de dépôt 2025-01-03
Date de la première publication 2025-07-10
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Elgart, David
  • Garcia, Ravi David
  • Kruse, Nikki D.
  • Miller, Mathew G.
  • Nazor, Jovana
  • Rui, Zhe
  • Srivastava, Arya

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA ligase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA ligase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA ligase polypeptides or compositions thereof for molecular biological, diagnostic, and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes

46.

ENGINEERED RNA LIGASES

      
Numéro d'application US2025010294
Numéro de publication 2025/147655
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-01-03
Date de publication 2025-07-10
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Elgart, David
  • Garcia, Ravi, David
  • Kruse, Nikki, D.
  • Miller, Mathew, G.
  • Nazor, Jovana
  • Rui, Zhe
  • Srivastava, Arya

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA ligase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA ligase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA ligase polypeptides or compositions thereof for molecular biological, diagnostic, and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

47.

ENGINEERED ACETATE KINASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 19081728
Statut En instance
Date de dépôt 2025-03-17
Date de la première publication 2025-07-03
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Vroom, Jonathan
  • Ortega Guerra, Alberto
  • Nazor, Jovana
  • Krawczyk, Mikayla Jianghongxia

Abrégé

The present invention provides engineered acetate kinase (AcK) enzymes, polypeptides having AcK activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing AcK enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the AcK enzymes and methods of using the engineered AcK enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

48.

KETOREDUCTASE POLYPEPTIDES AND POLYNUCLEOTIDES

      
Numéro d'application 19079931
Statut En instance
Date de dépôt 2025-03-14
Date de la première publication 2025-06-26
Propriétaire Codexis, Inc. (La Reunion)
Inventeur(s)
  • Moore, Jeffrey C.
  • Liang, Jack
  • Penfield, Jonathan
  • Nazor, Jovana
  • Dellas, Nikki
  • Mitchell, Vesna
  • Duan, Da
  • Farasat, Iman
  • Rodriguez-Granillo, Agustina
  • Murphy, Grant
  • Marshall, Nicholas

Abrégé

The present invention provides engineered ketoreductase and phosphite dehydrogenase enzymes having improved properties as compared to a naturally occurring wild-type ketoreductase and phosphite dehydrogenase enzymes, as well as polynucleotides encoding the engineered ketoreductase and phosphite dehydrogenase enzymes, host cells capable of expressing the engineered ketoreductase and phosphite dehydrogenase enzymes, and methods of using the engineered ketoreductase and phosphite dehydrogenase enzymes to synthesize a chiral catalyst used in the synthesis of antiviral compounds, such as nucleoside inhibitors. The present invention further provides methods of using the engineered enzymes to deracemize a chiral alcohol in a one-pot, multi-enzyme system.

Classes IPC  ?

  • C12P 41/00 - Procédés utilisant des enzymes ou des micro-organismes pour la séparation d'isomères optiques à partir d'un mélange racémique
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli

49.

BIOCATALYSTS AND METHODS FOR HYDROXYLATION OF CHEMICAL COMPOUNDS

      
Numéro d'application 19054277
Statut En instance
Date de dépôt 2025-02-14
Date de la première publication 2025-06-05
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Chen, Haibin
  • Bong, Yong Koy
  • Cabirol, Fabien L.
  • Gohel Prafulchandra, Anupam
  • Li, Tao
  • Moore, Jeffrey C.
  • Quintanar-Audelo, Martina
  • Hong, Yang
  • Collier, Steven J.
  • Smith, Derek

Abrégé

The present disclosure provides engineered proline hydroxylase polypeptides for the production of hydroxylated compounds, polynucleotides encoding the engineered proline hydroxylases, host cells capable of expressing the engineered proline hydroxylases, and methods of using the engineered proline hydroxylases to prepare compounds useful in the production of active pharmaceutical agents.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/12 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12P 13/04 - Alpha- ou bêta-amino-acides
  • C12P 13/24 - ProlineHydroxyprolineHistidine
  • C12P 17/18 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant plusieurs hétérocycles condensés entre eux ou condensés avec un système carbocyclique commun, p. ex. rifamycine

50.

ENGINEERED RNA LIGASES

      
Numéro de document 03311392
Statut En instance
Date de dépôt 2024-11-21
Date de disponibilité au public 2025-05-30
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bakhtina, Marina Mikhailovna
  • Elgart, David
  • Kruse, Nikki D.
  • Miller, Mathew G.
  • Nazor, Jovana
  • Novick, Scott J.
  • Shoubber, Amani
  • Vojcic, Ljubica

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12N 15/74 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes procaryotes autres que E. coli, p. ex. Lactobacillus, Micromonospora
  • C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales

51.

ENGINEERED RNA LIGASES

      
Numéro d'application US2024056979
Numéro de publication 2025/111510
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-11-21
Date de publication 2025-05-30
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bakhtina, Marina, Mikhailovna
  • Elgart, David
  • Kruse, Nikki, D.
  • Miller, Mathew, G.
  • Nazor, Jovana
  • Novick, Scott, J.
  • Shoubber, Amani
  • Vojcic, Ljubica

Abrégé

The present disclosure provides engineered RNA ligases, recombinant polynucleotides encoding the engineered RNA ligases, and compositions of the engineered RNA ligases. The present disclosure further provides uses of the engineered RNA ligases for ligation of polynucleotide substrates.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 15/10 - Procédés pour l'isolement, la préparation ou la purification d'ADN ou d'ARN
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12N 15/74 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes procaryotes autres que E. coli, p. ex. Lactobacillus, Micromonospora
  • C12N 15/85 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules animales

52.

ENGINEERED RNA LIGASES

      
Numéro d'application 18955904
Statut En instance
Date de dépôt 2024-11-21
Date de la première publication 2025-05-22
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bakhtina, Marina Mikhailovna
  • Elgart, David
  • Kruse, Nikki D.
  • Miller, Mathew G.
  • Nazor, Jovana
  • Novick, Scott J.
  • Shoubber, Amani
  • Vojcic, Ljubica

Abrégé

The present disclosure provides engineered RNA ligases, recombinant polynucleotides encoding the engineered RNA ligases, and compositions of the engineered RNA ligases. The present disclosure further provides uses of the engineered RNA ligases for ligation of polynucleotide substrates.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12P 21/02 - Préparation de peptides ou de protéines comportant une séquence connue de plusieurs amino-acides, p. ex. glutathion

53.

ENGINEERED NUCLEOSIDE DEOXYRIBOSYLTRANSFERASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18683245
Statut En instance
Date de dépôt 2022-08-10
Date de la première publication 2025-05-01
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Borra-Garske, Margie Tabuga
  • Alvizo, Oscar
  • Miller, Lillian Jasmine
  • Petkova, Aksiniya Lyubenova
  • Huffman, Mark
  • Rodriguez-Granillo, Agustina

Abrégé

The present invention provides engineered nucleoside deoxyribosyltransferase (NDT) enzymes, polypeptides having NDT activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing NDT enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the NDT enzymes and methods of using the engineered NDT enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli

54.

ENGINEERED IMINE REDUCTASES AND METHODS FOR THE REDUCTIVE AMINATION OF KETONE AND AMINE COMPOUNDS

      
Numéro d'application 18976769
Statut En instance
Date de dépôt 2024-12-11
Date de la première publication 2025-05-01
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Yi, Xiang
  • Alvizo, Oscar
  • Garcia, Ravi David
  • Entwistle, David
  • Ching, Charlene
  • Riggins, James Nicholas

Abrégé

The present application provides engineered polypeptides having imine reductase activity, polynucleotides encoding the engineered polypeptides, host cells capable of expressing the engineered polypeptides, and methods of using these engineered polypeptides with a range of ketone and amine substrate compounds to prepare secondary and tertiary amine product compounds.

Classes IPC  ?

  • C12P 13/04 - Alpha- ou bêta-amino-acides
  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)

55.

ENGINEERED GLUCOSE DEHYDROGENASES AND METHODS FOR THE REDUCTIVE AMINATION OF KETONE AND AMINE COMPOUNDS

      
Numéro d'application 18999352
Statut En instance
Date de dépôt 2024-12-23
Date de la première publication 2025-04-24
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Yi, Xiang
  • Alvizo, Oscar
  • Garcia, Ravi David
  • Entwistle, David
  • Ching, Charlene
  • Riggins, James Nicholas
  • Subramanian, Nandhitha

Abrégé

The present application provides engineered glucose dehydrogenase polypeptides having imine reductase activity, polynucleotides encoding the engineered polypeptides, host cells capable of expressing the engineered polypeptides, and methods of using these engineered polypeptides with a range of ketone and amine substrate compounds to prepare secondary and tertiary amine product compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 15/72 - Systèmes d'expression utilisant des séquences régulatrices dérivées de l'opéron lac

56.

ENGINEERED ADENOSINE KINASE VARIANTS

      
Numéro de document 03307884
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-11
Date de disponibilité au public 2025-04-17
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie Marie
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Teadt, Leann Quertinmont
  • Vroom, Jonathan

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12P 19/30 - Nucléotides

57.

ENGINEERED ADENYLATE KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18913751
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-11
Date de la première publication 2025-04-17
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie Marie
  • Knight, Anders Matthew
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure provides engineered adenylate kinases, and recombinant polynucleotides encoding the engineered adenylate kinases. The present disclosure further provides uses of the engineered adenylate kinases for converting NMP to NDP.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 9/08 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur le peroxyde d'hydrogène comme accepteur (1.11)
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées

58.

ENGINEERED ADENOSINE KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18913982
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-11
Date de la première publication 2025-04-17
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie Marie
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Teadt, Leann Quertinmont
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure provides engineered adenosine kinase polypeptides, and recombinant polynucleotides encoding the engineered adenosine kinases. The present disclosure further provides method of using the engineered adenosine kinases.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

59.

ENGINEERED ADENOSINE KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024051139
Numéro de publication 2025/081113
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-10-11
Date de publication 2025-04-17
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie, Marie
  • Macavoy, Marissa, Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Teadt, Leann, Quertinmont
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure provides engineered adenosine kinase polypeptides, and recombinant polynucleotides encoding the engineered adenosine kinases. The present disclosure further provides method of using the engineered adenosine kinases.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12P 19/30 - Nucléotides

60.

ENGINEERED ADENYLATE KINASE VARIANTS

      
Numéro de document 03305540
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-11
Date de disponibilité au public 2025-04-17
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie Marie
  • Knight, Anders Matthew
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Vroom, Jonathan

Classes IPC  ?

  • C07H 21/02 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le ribosyle comme radical saccharide
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 19/30 - Nucléotides
  • C12Q 1/22 - Test des conditions de stérilité
  • C12Q 1/48 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une transférase

61.

ENGINEERED ACETATE KINASE VARIANTS

      
Numéro de document 03306174
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-11
Date de disponibilité au public 2025-04-17
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie Marie
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Vroom, Jonathan

Classes IPC  ?

  • C07K 14/195 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli

62.

ENGINEERED ACETATE KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18913845
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-11
Date de la première publication 2025-04-17
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie Marie
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure relates to engineered acetate kinase enzymes and compositions thereof, recombinant polynucleotides encoding the engineered acetate kinase enzymes, and method of using the engineered acetate kinase enzymes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 11/00 - Enzymes fixées sur un support ou immobiliséesCellules microbiennes fixées sur un support ou immobiliséesLeur préparation
  • C12P 19/38 - Nucléosides

63.

ENGINEERED ADENYLATE KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024051084
Numéro de publication 2025/081067
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-10-11
Date de publication 2025-04-17
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie, Marie
  • Knight, Anders, Matthew
  • Macavoy, Marissa, Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure provides engineered adenylate kinases, and recombinant polynucleotides encoding the engineered adenylate kinases. The present disclosure further provides uses of the engineered adenylate kinases for converting NMP to NDP.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/48 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une transférase
  • C07H 21/02 - Composés contenant au moins deux unités mononucléotide comportant chacune des groupes phosphate ou polyphosphate distincts liés aux radicaux saccharide des groupes nucléoside, p. ex. acides nucléiques avec le ribosyle comme radical saccharide
  • C12Q 1/22 - Test des conditions de stérilité
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 19/30 - Nucléotides

64.

ENGINEERED ACETATE KINASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024051118
Numéro de publication 2025/081095
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-10-11
Date de publication 2025-04-17
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Forget, Stephanie Marie
  • Macavoy, Marissa Greene
  • Ng, Simon
  • Porter, Nicholas
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure relates to engineered acetate kinase enzymes and compositions thereof, recombinant polynucleotides encoding the engineered acetate kinase enzymes, and method of using the engineered acetate kinase enzymes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C07K 14/195 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli

65.

BIOCATALYSTS AND METHODS FOR THE SYNTHESIS OF SUBSTITUTED LACTAMS

      
Numéro d'application 18971755
Statut En instance
Date de dépôt 2024-12-06
Date de la première publication 2025-03-27
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Cabirol, Fabien Louis
  • Chen, Haibin
  • Gohel, Anupam
  • Salim, Paulina Elena
  • Smith, Derek J.
  • Janey, Jacob
  • Kosjek, Birgit
  • Tang, Weng Lin
  • Hsieh, Helen
  • Pham, Son Q.

Abrégé

The present disclosure relates to transaminase polypeptides capable of aminating a dicarbonyl substrate, and polynucleotides, vectors, host cells, and methods of making and using the transaminase polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C07D 211/76 - Atomes d'oxygène liés en position 2 ou 6
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 17/12 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons

66.

ENGINEERED CYCLIC GMP-AMP SYNTHASE (cGAS) VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18953518
Statut En instance
Date de dépôt 2024-11-20
Date de la première publication 2025-03-13
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Borra-Garske, Margie Tabuga
  • Alvizo, Oscar
  • Miller, Lillian Jasmine
  • Petkova, Aksiniya Lyubenova

Abrégé

Cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) enzymes have been engineered to produce polypeptides having increased cGAS activity in the cyclization of modified nucleoside triphosphates, including thiolated or fluorinated nucleoside triphosphates, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing cGAS enzymes, compositions comprising the cGAS enzymes and methods of using the engineered cGAS enzymes are useful for the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

67.

IGM PROTEASES

      
Numéro d'application US2024044871
Numéro de publication 2025/050045
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-08-30
Date de publication 2025-03-06
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Ferrer, Brian
  • Kruse, Nikki, D.
  • Silverman, Adam, P.
  • Windgassen, Tricia

Abrégé

The present disclosure relates to proteases that exhibit activity against immunoglobulins, particularly IgM antibodies, and uses of the proteases for analysis of IgM, for generation of IgM antibody fragments, diagnostics related to IgM antibodies, and for treating and/or preventing diseases mediated by IgM antibodies.

Classes IPC  ?

  • C07K 16/12 - Immunoglobulines, p. ex. anticorps monoclonaux ou polyclonaux contre du matériel provenant de bactéries
  • C07K 14/315 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries provenant de Streptococcus (G), p. ex. Enterocoques
  • A61K 39/00 - Préparations médicinales contenant des antigènes ou des anticorps
  • A61P 35/00 - Agents anticancéreux

68.

PENICILLIN-G ACYLASES

      
Numéro d'application 18612248
Statut En instance
Date de dépôt 2024-03-21
Date de la première publication 2025-01-30
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Nazor, Jovana
  • Mitchell, Vesna
  • Elgart, David
  • Lexa, Katrina W.
  • Dellas, Nikki
  • Orr, Robert Kevin
  • Alvizo, Oscar
  • Garcia, Ravi David
  • Viduya, Judy Victoria Antonio
  • Moffett, Courtney Dianne

Abrégé

The present invention provides engineered penicillin G acylase (PGA) enzymes having improved properties, polynucleotides encoding such enzymes, compositions including the enzymes, and methods of using the enzymes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/84 - Penicillinamidase
  • C07K 14/62 - Insulines
  • C12P 21/02 - Préparation de peptides ou de protéines comportant une séquence connue de plusieurs amino-acides, p. ex. glutathion

69.

ENGINEERED THREONINE ALDOLASES AND AMINO ACID DECARBOXYLASES

      
Numéro d'application 18714030
Statut En instance
Date de dépôt 2022-12-01
Date de la première publication 2025-01-30
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Novick, Scott J.
  • Subramanian, Nandhitha
  • Schlama, Thierry

Abrégé

The present invention provides engineered threonine aldolase and amino acid decarboxylase polypeptides useful for the production of the chiral tertiary amino alcohols, as well as polynucleotides, compositions, and methods utilizing these engineered polypeptides.

Classes IPC  ?

70.

ENGINEERED DNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18903185
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-01
Date de la première publication 2025-01-23
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Bermudez, Ericka
  • Elgart, David
  • Kruse, Nikki D.
  • Miller, Mathew G.
  • Mitchell, Vesna
  • Nazor, Jovana
  • Subramanian, Nandhitha

Abrégé

The present disclosure relates to engineered DNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered DNA polymerase polypeptides or compositions thereof for diagnostic and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

71.

ENGINEERED PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18906502
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-04
Date de la première publication 2025-01-23
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Novick, Scott J.
  • Dellas, Nikki
  • Mitchell, Vesna
  • Duan, Da
  • Nazor, Jovana
  • Alvizo, Oscar
  • Sowell-Kantz, Auric Anthony
  • Moore, Jeffrey C.
  • Huffman, Mark A.
  • Rodriguez-Granillo, Agustina
  • Verma, Deeptak
  • Marshall, Nicholas M.
  • Russell, Jay H.
  • Canada, Keith A.

Abrégé

The present invention provides engineered purine nucleoside phosphorylase (PNP) enzymes, polypeptides having PNP activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing PNP enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the PNP enzymes and methods of using the engineered PNP enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

72.

T7 RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18909833
Statut En instance
Date de dépôt 2024-10-08
Date de la première publication 2025-01-23
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Miller, Mathew G.
  • Chng, Chinping
  • Alvizo, Oscar
  • Mayo, Melissa Ann
  • Riggins, James Nicholas
  • Yi, Xiang
  • Penfield, Jonathan S.
  • Huisman, Gjalt W.
  • Davis, Jared
  • Saotome, Yasushi

Abrégé

The present invention provides engineered RNA polymerase variants and compositions comprising these variants. The present invention further provides engineered T7 RNA polymerase variants and compositions comprising these variants. These variants have been evolved for selective incorporation of the m7G(5′)ppp(5′)m7G cap analog over GTP at the initiation of in vitro transcription. The present invention also provides methods for selective capping of RNA transcripts.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/00 - Techniques de mutation ou génie génétiqueADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p. ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purificationUtilisation d'hôtes pour ceux-ci
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides

73.

BIOCATALYSTS FOR EZETIMIBE SYNTHESIS

      
Numéro d'application 18886292
Statut En instance
Date de dépôt 2024-09-16
Date de la première publication 2025-01-09
Propriétaire Codexis Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Crowe, Michael A.
  • Alvizo, Oscar
  • Behrouzian, Behnaz
  • Bong, Yong Koy
  • Collier, Steven J.
  • Gohel, Anupam
  • Mavinahalli, Jagedeesh
  • Modukuru, Naga K.
  • Mundorff, Emily
  • Smith, Derek J.
  • Song, Shiwei
  • Yeo, Wan Lin

Abrégé

The present disclosure relates to non-naturally occurring polypeptides useful for preparing Ezetimibe, polynucleotides encoding the polypeptides, and methods of using the polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • A61K 38/00 - Préparations médicinales contenant des peptides
  • C07K 14/47 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'animauxPeptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant d'humains provenant de vertébrés provenant de mammifères
  • C12P 17/10 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle
  • C12P 17/14 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote ou l'oxygène comme hétéro-atome du cycle et dans le même cycle au moins un autre hétéro-atome différent

74.

ENGINEERED PANTOTHENATE KINASE VARIANT ENZYMES

      
Numéro d'application 18822990
Statut En instance
Date de dépôt 2024-09-03
Date de la première publication 2024-12-26
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Borra-Garske, Margie Tabuga
  • Alvizo, Oscar
  • Miller, Lillian Jasmine
  • Slaton, Jesse B.
  • Petkova, Aksiniya Lyubenova
  • Subramanian, Nandhitha
  • Kolev, Joshua
  • Fryszkowska, Anna
  • Rodriguez-Granillo, Agustina
  • Murphy, Grant

Abrégé

The present invention provides engineered pantothenate kinase (PanK) enzymes, polypeptides having PanK activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing PanK enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the PanK enzymes and methods of using the engineered PanK enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

75.

PENICILLIN-G ACYLASES

      
Numéro d'application 18813482
Statut En instance
Date de dépôt 2024-08-23
Date de la première publication 2024-12-12
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Elgart, David
  • Orr, Robert Kevin
  • Riggins, James Nicholas
  • Fryszkowska, Anna
  • Lexa, Katrina W.
  • Yi, Xiang
  • Duan, Da
  • Moffett, Courtney Dianne
  • Dellas, Nikki
  • Mitchell, Vesna

Abrégé

The present invention provides engineered penicillin G acylase (PGA) enzymes, polynucleotides encoding the enzymes, compositions comprising the enzymes, and methods of using the engineered PGA enzymes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/84 - Penicillinamidase
  • C07K 14/62 - Insulines
  • C12P 21/02 - Préparation de peptides ou de protéines comportant une séquence connue de plusieurs amino-acides, p. ex. glutathion

76.

ENGINEERED PROTEASE POLYPEPTIDES

      
Numéro d'application 18679281
Statut En instance
Date de dépôt 2024-05-30
Date de la première publication 2024-12-12
Propriétaire
  • Codexis, Inc. (USA)
  • Société des Produits Nestlé S.A. (Suisse)
Inventeur(s)
  • Chng, Chinping
  • Cong, Ruth L.
  • Duan, Da
  • Ferrer, Brian
  • Garcia, Ravi David
  • Kruse, Nikki D.
  • Kumar, Hirdesh
  • Millet, Stephen Joshua Macaso
  • Windgassen, Trica
  • Zhu, Liang

Abrégé

The present disclosure provides engineered protease polypeptides, recombinant polynucleotides encoding the engineered protease polypeptides, and uses of the engineered protease polypeptides in therapeutic applications.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/54 - Protéinases provenant de bactéries les bactéries étant du genre Bacillus
  • C12N 9/96 - Stabilisation d'une enzyme par formation d'un adduct ou d'une compositionFormation de conjugaisons d'enzymes

77.

ENGINEERED PROTEASE POLYPEPTIDES

      
Numéro d'application US2024031771
Numéro de publication 2024/249694
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-05-30
Date de publication 2024-12-05
Propriétaire
  • CODEXIS, INC. (USA)
  • SOCIETE DES PRODUITS NESTLE S.A. (Suisse)
Inventeur(s)
  • Chng, Chinping
  • Cong, Ruth, L.
  • Duan, Da
  • Ferrer, Brian
  • Garcia, Ravi, David
  • Kruse, Nikki, D.
  • Kumar, Hirdesh
  • Millet, Stephen, Joshua, Macaso
  • Windgassen, Tricia
  • Zhu, Liang

Abrégé

The present disclosure provides engineered protease polypeptides, recombinant polynucleotides encoding the engineered protease polypeptides, and uses of the engineered protease polypeptides in therapeutic applications.

Classes IPC  ?

  • C11D 3/386 - Préparations contenant des enzymes
  • C12N 9/54 - Protéinases provenant de bactéries les bactéries étant du genre Bacillus
  • C12N 9/64 - Protéinases provenant de tissu animal, p. ex. rennine

78.

ENGINEERED RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024028783
Numéro de publication 2024/238327
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-05-10
Date de publication 2024-11-21
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Camacho Hernandez, Martha
  • Miller, Mathew, G.
  • Nazor, Jovana
  • Nguyen, James, D.
  • Patel, Anand
  • Rui, Zhe

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA polymerase polypeptides or compositions thereof for producing RNA.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides

79.

ENGINEERED RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024028987
Numéro de publication 2024/238409
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-05-10
Date de publication 2024-11-21
Propriétaire
  • CODEXIS, INC. (USA)
  • PFIZER INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Artz, Jacob, Hansen
  • Camacho Hernandez, Martha
  • Fell, Jason
  • Miller, Mathew, G.
  • Nazor, Jovana
  • Nguyen, James, D.
  • Patel, Anand
  • Rui, Zhe

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA polymerase polypeptides or compositions thereof for producing RNA.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides

80.

ENGINEERED AMYLASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18789167
Statut En instance
Date de dépôt 2024-07-30
Date de la première publication 2024-11-21
Propriétaire
  • Codexis, Inc. (USA)
  • Societe des Produits Nestle S.A. (Suisse)
Inventeur(s)
  • Chng, Chinping
  • Dellas, Nikki
  • Duan, Da
  • Garcia, Ravi David
  • Maniar, Harvinder Chagger

Abrégé

The present invention provides engineered amylase polypeptides and compositions thereof. The engineered amylase polypeptides have been optimized to provide improved thermostability, protease stability, and stability under a range of pH conditions, including acidic (pH<7) conditions. The invention also relates to the use of the compositions comprising the engineered amylase polypeptides for therapeutic and/or nutritional purposes. The present invention also provides polynucleotides encoding the engineered amylase polypeptides, as well as methods for making the engineered polynucleotides and amylase polypeptides.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/26 - Hydrolases (3.) agissant sur les composés glycosyliques (3.2) agissant sur les liaisons alpha-glucosidiques-1, 4, p. ex. hyaluronidase, invertase, amylase
  • A61K 38/47 - Hydrolases (3) agissant sur des composés glycosyliques (3.2), p. ex. cellulases, lactases
  • A61P 1/18 - Médicaments pour le traitement des troubles du tractus alimentaire ou de l'appareil digestif des troubles pancréatiques, p. ex. enzymes pancréatiques

81.

RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024028884
Numéro de publication 2024/238367
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-05-10
Date de publication 2024-11-21
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bakhtina, Marina, Mikhailovna
  • Copeland, Rachelle
  • Duran, Aldo
  • Knight, Anders, Matthew
  • Mayo, Melissa, Ann

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA polymerase polypeptides or compositions thereof for producing RNA.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides

82.

ECO SYNTHESIS

      
Numéro de série 98863642
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2024-11-20
Date d'enregistrement 2025-08-12
Propriétaire Codexis, Inc. ()
Classes de Nice  ? 40 - Traitement de matériaux; recyclage, purification de l'air et traitement de l'eau

Produits et services

RNA manufacturing services for others utilizing proprietary enzymatic technologies to enable nucleic acid therapeutics development

83.

ENGINEERED RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18660729
Statut En instance
Date de dépôt 2024-05-10
Date de la première publication 2024-11-14
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Camacho Hernandez, Martha
  • Miller, Mathew G.
  • Nazor, Jovana
  • Nguyen, James D.
  • Patel, Anand
  • Rui, Zhe

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA polymerase polypeptides or compositions thereof for producing RNA.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 9/14 - Hydrolases (3.)
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

84.

RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18660851
Statut En instance
Date de dépôt 2024-05-10
Date de la première publication 2024-11-14
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Bakhtina, Marina Mikhailovna
  • Copeland, Rachelle
  • Duran, Aldo
  • Knight, Anders Matthew
  • Mayo, Melissa Ann

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA polymerase polypeptides or compositions thereof for producing RNA.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 9/14 - Hydrolases (3.)

85.

ENGINEERED RNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18661523
Statut En instance
Date de dépôt 2024-05-10
Date de la première publication 2024-11-14
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Artz, Jacob Hansen
  • Camacho Hernandez, Martha
  • Fell, Jason
  • Miller, Mathew G.
  • Nazor, Jovana
  • Nguyen, James D.
  • Patel, Anand
  • Rui, Zhe
  • Abyad, Jenna Tawil
  • Juhn, Hugo
  • Lotvin, Jason Arnold
  • Liu, Qi
  • Sztuba-Solinska, Joanna

Abrégé

The present disclosure relates to engineered RNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered RNA polymerase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered RNA polymerase polypeptides or compositions thereof for producing RNA.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

86.

LOV-D ACYLTRANSFERASE MEDIATED ACYLATION

      
Numéro d'application 18781007
Statut En instance
Date de dépôt 2024-07-23
Date de la première publication 2024-11-07
Propriétaire Codexis Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Collier, Steven J.
  • Teo, Ee Ling
  • Sukumaran, Joly
  • Wilson, Robert J.
  • Xu, Junye

Abrégé

Methods for the improved acylation of chemical substrates using LovD acyltransferases, thioesters having acyl groups, and (i) thiol scavengers and/or (ii) precipitating agents are presented. An improved method for the production of simvastatin using (i) activated charcoal as a thiol scavenger and/or (ii) ammonium hydroxide as a precipitating agent is also presented.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/06 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'oxygène comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons, p. ex. fluorescéine
  • C07K 14/00 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 7/62 - Esters d’acides carboxyliques

87.

P450-BM3 VARIANTS WITH IMPROVED ACTIVITY

      
Numéro d'application US2023080715
Numéro de publication 2024/196434
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-11-21
Date de publication 2024-09-26
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Entwistle, David
  • Fell, Jason
  • Jenne, Stephan
  • Knight, Anders Matthew
  • Ng, Simon
  • Reeves, Ryan D.
  • Seibel, Zara Maxine
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

terttert-Butoxycarbonylaminocyclopentanoic acid substrate.

Classes IPC  ?

  • A61K 38/41 - Peptides contenant des cycles porphyrine ou corrine
  • C07K 14/80 - Cytochromes
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes

88.

P450-BM3 VARIANTS WITH IMPROVED ACTIVITY

      
Numéro d'application 18516054
Statut En instance
Date de dépôt 2023-11-21
Date de la première publication 2024-09-26
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Entwistle, David
  • Fell, Jason
  • Jenne, Stephan
  • Knight, Anders Matthew
  • Ng, Simon
  • Reeves, Ryan D.
  • Seibel, Zara Maxine
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present invention provides improved P450-BM3 variants with improved activity. In some embodiments, the P450-BM3 variants exhibit improved activity on a 1-tert-Butoxycarbonylaminocyclopentanoic acid substrate.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase

89.

ENGINEERED DNA LIGASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18420040
Statut En instance
Date de dépôt 2024-01-23
Date de la première publication 2024-09-19
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Artz, Jacob Hansen
  • Copeland, Rachelle
  • Fell, Jason
  • Knight, Anders Matthew
  • Krawczyk, Mikayla Jianghongxia
  • Miller, Mathew G.
  • Nazor, Jovana
  • Shoubber, Amani
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure relates to engineered DNA ligase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA ligase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered DNA ligase polypeptides or compositions thereof in diagnostics and as a molecular biological tool.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes

90.

Peroxidase activity towards 10-acetyl-3,7-dihydroxyphenoxazine

      
Numéro d'application 18655701
Numéro de brevet 12540314
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-05-06
Date de la première publication 2024-09-12
Date d'octroi 2026-02-03
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Duan, Da
  • Sowell-Kantz, Auric Anthony
  • Petkova, Aksiniya Lyubenova
  • Nazor, Jovana
  • Subramanian, Nandhitha
  • Alvizo, Oscar

Abrégé

The present invention provides engineered peroxidase enzymes, polypeptides having peroxidase activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing peroxidase enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the peroxidase enzymes and methods of using the engineered peroxidase enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical and other compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/08 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur le peroxyde d'hydrogène comme accepteur (1.11)

91.

Ketoreductase polypeptides for the preparation of phenylephrine

      
Numéro d'application 18671324
Numéro de brevet 12480100
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-05-22
Date de la première publication 2024-09-12
Date d'octroi 2025-11-25
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Alvizo, Oscar
  • Collier, Steven J.
  • Hennemann, Hans-Georg Joerg
  • Oh, Seong Ho
  • Zha, Wenjuan

Abrégé

The disclosure relates to engineered ketoreductase polypeptides and processes of using the polypeptides for production of phenylephrine.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • A61K 31/137 - Arylalkylamines, p. ex. amphétamine, épinéphrine, salbutamol, éphédrine
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote

92.

Engineered galactose oxidase variant enzymes

      
Numéro d'application 18657101
Numéro de brevet 12480099
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-05-07
Date de la première publication 2024-08-29
Date d'octroi 2025-11-25
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Micklitsch, Christopher
  • Alvizo, Oscar
  • Nazor, Jovana
  • Maniar, Harvinder Chagger
  • Krawczyk, Mikayla Jianghongxia
  • Borra-Garske, Margie Tabuga
  • Subramanian, Nandhitha
  • Fryszkowska, Anna
  • Marshall, Nicholas M.
  • Rodriguez-Granillo, Agustina
  • Verma, Deeptak
  • Andrews, Dewan

Abrégé

The present invention provides engineered galactose oxidase (GOase) enzymes, polypeptides having GOase activity, and polynucleotides encoding these enzymes, as well as vectors and host cells comprising these polynucleotides and polypeptides. Methods for producing GOase enzymes are also provided. The present invention further provides compositions comprising the GOase enzymes and methods of using the engineered GOase enzymes. The present invention finds particular use in the production of pharmaceutical and other compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12P 21/02 - Préparation de peptides ou de protéines comportant une séquence connue de plusieurs amino-acides, p. ex. glutathion

93.

NEURAL SPHEROIDS

      
Numéro d'application US2024015808
Numéro de publication 2024/173561
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-02-14
Date de publication 2024-08-22
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Lee, Grace, Sohee
  • Schmitt, Christopher, Edward

Abrégé

The present disclosure provides a method of preparing neural spheroids, the neural spheroid prepared by the method, and uses of the neural spheroids. In some embodiments, the present disclosure provides a method of forming neural spheroids, a three dimensional network of cells comprising neural and glial cells, where the method comprises culturing differentiated fore brain progenitor cells in a cell culture well having an ultra-low attachment surface and shaped to promote self-assembly of cells into neural spheroids.

Classes IPC  ?

  • C12N 5/0797 - Cellules souchesCellules progénitrices
  • C12N 5/00 - Cellules non différenciées humaines, animales ou végétales, p. ex. lignées cellulairesTissusLeur culture ou conservationMilieux de culture à cet effet
  • C12N 5/074 - Cellules souches adultes
  • C12N 5/0789 - Cellules souchesCellules progénitrices multipotentes
  • C12N 5/079 - Cellules neurales
  • C12N 5/07 - Cellules animales ou tissus animaux
  • G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique

94.

ENGINEERED DNA POLYMERASE VARIANTS

      
Numéro d'application 18628461
Statut En instance
Date de dépôt 2024-04-05
Date de la première publication 2024-08-08
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Miller, Mathew G.
  • Mitchell, Vesna
  • Nazor, Jovana
  • Baskerville, Donald S.
  • Dellas, Nikki
  • Elgart, David
  • Vroom, Jonathan
  • Gomes, Sandy M.
  • Subramanian, Nandhitha
  • Bermudez, Ericka

Abrégé

The present invention provides engineered DNA polymerase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA polymerase polypeptides. The invention also provides methods for use of the compositions comprising the engineered DNA polymerase polypeptides for diagnostic and other purposes.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

95.

ENGINEERED GLUCOCEREBROSIDASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024014039
Numéro de publication 2024/163765
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-02-01
Date de publication 2024-08-08
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Artz, Jacob, Hansen
  • Botham, Rachel, Cathleen
  • Chen, Xingxiu
  • Francisco, Victorino, Miguel
  • Hallows, William, Casey
  • Heredia, Jeremiah, Dallas
  • Johnson, Londen, Christine
  • Millar, Douglas, Chamberlain
  • Onguka, Ouma
  • Schmitt, Christopher, Edward
  • Silverman, Adam, P.

Abrégé

The present disclosure provides engineered glucocerebrosidases, polynucleotides encoding the engineered glucocerebrosidases, and methods of treating a deficiency in glucocerebroside activity using the engineered glucocerebrosidases or the recombinant polynucleotides encoding the engineered glucocerebrosidases.

Classes IPC  ?

  • A61K 38/47 - Hydrolases (3) agissant sur des composés glycosyliques (3.2), p. ex. cellulases, lactases
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique
  • C07K 14/00 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 9/24 - Hydrolases (3.) agissant sur les composés glycosyliques (3.2)
  • C12N 9/38 - Hydrolases (3.) agissant sur les composés glycosyliques (3.2) agissant sur les liaisons bêta-galactose-glycoside, p. ex. bêta-galactosidase
  • C12N 9/42 - Hydrolases (3.) agissant sur les composés glycosyliques (3.2) agissant sur les liaisons bêta-glucosidiques-1, 4, p. ex. cellulase
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux

96.

ENGINEERED AAV POLYPEPTIDES

      
Numéro d'application US2024014362
Numéro de publication 2024/163979
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-02-02
Date de publication 2024-08-08
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Akeefe, Hassibullah
  • Chng, Chinping
  • Del Greco, Elizabeth
  • Desautel, Sarah
  • Gebretsadik, Kahsay
  • Kruse, Nikki, D.
  • Kumar, Ambuj
  • Rivera-Velazquez, Mirella
  • Rohovie, Marcus
  • Schmitt, Christopher, Edward
  • Sedighi, Faezeh
  • Sero, Antoinette
  • Silverman, Adam, P.
  • Wong, Victoria

Abrégé

The present disclosure provides engineered AAV capsid polypeptides, engineered MAAP polypeptides, and engineered AAP polypeptides as well as recombinant polynucleotides encoding the engineered AAV polypeptides. The present disclosure further provides use of the engineered AAV polypeptides and recombinant polynucleotides for producing rAAV viruses or rAAV virions.

Classes IPC  ?

  • C07K 14/005 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de virus
  • C12N 15/86 - Vecteurs viraux
  • C12N 7/00 - Virus, p. ex. bactériophagesCompositions les contenantLeur préparation ou purification
  • A61K 48/00 - Préparations médicinales contenant du matériel génétique qui est introduit dans des cellules du corps vivant pour traiter des maladies génétiquesThérapie génique

97.

ENGINEERED DNA LIGASE VARIANTS

      
Numéro d'application US2024012543
Numéro de publication 2024/158764
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-01-23
Date de publication 2024-08-02
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Artz, Jacob Hansen
  • Copeland, Rachelle
  • Fell, Jason
  • Knight, Anders Matthew
  • Krawczyk, Mikayla Jianghongxia
  • Miller, Mathew G.
  • Nazor, Jovana
  • Shoubber, Amani
  • Vroom, Jonathan

Abrégé

The present disclosure relates to engineered DNA ligase polypeptides and compositions thereof, as well as polynucleotides encoding the engineered DNA ligase polypeptides. The present disclosure also provides methods of using the engineered DNA ligase polypeptides or compositions thereof in diagnostics and as a molecular biological tool.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

98.

ENGINEERED DNA LIGASE VARIANTS

      
Numéro de document 03280789
Statut En instance
Date de dépôt 2024-01-23
Date de disponibilité au public 2024-08-02
Propriétaire CODEXIS, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Artz, Jacob Hansen
  • Copeland, Rachelle
  • Fell, Jason
  • Knight, Anders Matthew
  • Krawczyk, Mikayla Jianghongxia
  • Miller, Mathew G.
  • Nazor, Jovana
  • Shoubber, Amani
  • Vroom, Jonathan

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression

99.

ENGINEERED IMINE REDUCTASES AND METHODS FOR THE REDUCTIVE AMINATION OF KETONE AND AMINE COMPOUNDS

      
Numéro d'application 18638060
Statut En instance
Date de dépôt 2024-04-17
Date de la première publication 2024-08-01
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Borra-Garsek, Margie
  • Alvizo, Oscar
  • Mayo, Melissa
  • Jenne, Stephan
  • Sowell-Kantz, Auric Anthoney
  • Molinaro, Carmela

Abrégé

The present application provides engineered polypeptides having imine or oxime reductase activity, polynucleotides encoding the engineered polypeptides, host cells capable of expressing the engineered polypeptides, and methods of using these engineered polypeptides with a range of ketone and amine substrate compounds to prepare secondary and tertiary amine product compounds.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase

100.

Ketoreductase polypeptides for the production of (R)-3-hydroxythiolane

      
Numéro d'application 18614099
Numéro de brevet 12378585
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-03-22
Date de la première publication 2024-07-11
Date d'octroi 2025-08-05
Propriétaire Codexis, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Liang, Jack S.
  • Jenne, Stephan
  • Mundorff, Emily
  • Voladri, Rama
  • Lalonde, James J.
  • Huisman, Gjalt W.

Abrégé

The present disclosure provides engineered ketoreductase enzymes having improved properties as compared to a naturally occurring wild-type ketoreductase enzyme. Also provided are polynucleotides encoding the engineered ketoreductase enzymes, host cells capable of expressing the engineered ketoreductase enzymes, and methods of using the engineered ketoreductase enzymes to synthesize chiral compounds.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/00 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12P 17/16 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle contenant plusieurs hétérocycles
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