Genomatica, Inc.

États‑Unis d’Amérique

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Type PI
        Brevet 439
        Marque 39
Juridiction
        États-Unis 293
        International 150
        Canada 29
        Europe 6
Date
Nouveautés (dernières 4 semaines) 3
2026 juillet 3
2026 mai 1
2026 avril 1
2026 (AACJ) 11
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Classe IPC
C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes 122
C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase 112
C12P 7/18 - Polyols 102
C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture 101
C12N 9/10 - Transférases (2.) 77
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Classe NICE
01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture 32
42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception 15
40 - Traitement de matériaux; recyclage, purification de l'air et traitement de l'eau 9
17 - Produits en caoutchouc ou en matières plastiques; matières à calfeutrer et à isoler 6
22 - Cordes; filets; tentes, auvents, voiles et sacs; matières de rembourrage 5
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Statut
En Instance 70
Enregistré / En vigueur 408
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1.

LIGASE AND DEHYDROGENASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application 19144382
Statut En instance
Date de dépôt 2023-12-28
Date de la première publication 2026-07-23
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Van Hove, Bob
  • Mcmurry, Jonathan Lewis
  • Carlin, Dylan Alexander
  • Qu, Fiona
  • Martinez Del Campo, Ana Elisa
  • Shah, Amit Mahendra
  • Nagarajan, Harish
  • Goormans, Anke René R.

Abrégé

The disclosure provides polypeptides and encoding nucleic acids of engineered acyl coenzyme-A ligases, engineered In acetylating aldehyde dehydrogenases or both. The disclosure also provides cells expressing an engineered form of the acyl coenzyme-A ligases, acetylating aldehyde dehydrogenases or both. The disclosure further provides methods for producing a bioderived compound, such as 6-hydroxyhexanoyl coenzyme-A, 6-hydroxy hexanal, 1,6 hexanediol, 6-aminocaproyl-CoA, 6-aminocaproate semialdehyde, hexamethylenediamine, and products derived therefrom comprising culturing cells expressing an engineered acyl coenzyme-A ligases, engineered acetylating aldehyde dehydrogenases or both.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12P 19/32 - Nucléotides avec un système cyclique condensé, contenant un cycle à six chaînons, comportant deux atomes d'azote dans le même cycle, p. ex. nucléotides puriques, dinucléotide de la nicotinamide-adénine

2.

MICROORGANISMS AND METHODS FOR IMPROVING PRODUCT YIELDS ON METHANOL USING ACETYL-COA SYNTHESIS

      
Numéro d'application 19429362
Statut En instance
Date de dépôt 2025-12-22
Date de la première publication 2026-07-23
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Osterhout, Robin E.
  • Burgard, Anthony P.
  • Pharkya, Priti
  • Andrae, Stefan

Abrégé

The invention provides non-naturally occurring microbial organisms containing enzymatic pathways and/or metabolic modifications for enhancing carbon flux through acetyl-CoA. In some embodiments, the microbial organisms of the invention having such pathways also include pathways for generating reducing equivalents, formaldehyde fixation and/or formate assimilation. The enhanced carbon flux through acetyl-CoA, in combination with pathways for generating reducing equivalents, formaldehyde fixation and/or formate assimilation can, in some embodiments, be used for production of a bioderived compound. Accordingly, in some embodiments, the microbial organisms of the invention can include a pathway capable of producing a bioderived compound of the invention. The invention still further provides a bioderived compound produced by a microbial organism of the invention, culture medium having the bioderived compound of the invention, compositions having the bioderived compound of the invention, a biobased product comprising the bioderived compound of the invention, and a process for producing a bioderived compound of the invention.

Classes IPC  ?

  • C12P 5/02 - Préparation des hydrocarbures acycliques
  • C12N 1/14 - ChampignonsLeurs milieux de culture
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12N 15/81 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour champignons pour levures
  • C12P 7/02 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle
  • C12P 7/04 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle acycliques
  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12P 7/40 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carboxyle
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques
  • C12P 7/44 - Acides polycarboxyliques
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 17/10 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle

3.

Enzymatic Biosynthesis Of Lactones

      
Numéro d'application 19562232
Statut En instance
Date de dépôt 2026-03-10
Date de la première publication 2026-07-09
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Schirmer, Andreas W.
  • Murphy, Katherine Ann
  • Bautista, Angelica Zabala

Abrégé

The disclosure relates to methods for the production of natural lactones by bacteria under physiological conditions. The methods employ ybgC proteins having lactonizing activity.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/06 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'oxygène comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons, p. ex. fluorescéine
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)

4.

VECORA

      
Numéro d'application 019367773
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2026-05-20
Date d'enregistrement 2026-06-05
Propriétaire Genomatica, Inc (USA)
Classes de Nice  ?
  • 01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture
  • 17 - Produits en caoutchouc ou en matières plastiques; matières à calfeutrer et à isoler
  • 18 - Cuir et imitations du cuir
  • 22 - Cordes; filets; tentes, auvents, voiles et sacs; matières de rembourrage
  • 23 - Fils à usage textile
  • 24 - Tissus et produits textiles
  • 25 - Vêtements; chaussures; chapellerie

Produits et services

Polymer compositions used in the manufacture of commercial, industrial and domestic goods; polymer precursors used in the manufacture of commercial, industrial and domestic goods; polymers, biopolymers, polymeric additives and biopolymeric additives for use in the manufacture of industrial products and consumer and household products; chemicals for use in industry; chemicals used in the manufacture of fabric or textiles; and polyamide. Resins in bars, blocks, pellets, rods, sheets and tubes for general industrial use; resins in extruded form for general industrial use; and semi-processed synthetic resins. Tote bags, all-purpose sports bags, all-purpose carrying bags, carry-on bags, weekend bags, sack packs, namely, drawstring bags used as backpacks, beach bags, toiletry bags sold empty, cosmetic bags sold empty, shopping bags, wheeled shopping bags, reusable shopping bags, sling bags for carrying infants, knitted bags not of precious metals, travel bags, school book bags, duffle bags, wheeled duffle bags, messenger bags, diaper bags, gym bags, purses, handbags, cross-body bags, drawstring bags, shoulder bags, waist bags, wristlet bags, backpacks, rucksacks, wallets, not of precious metal, briefcases, attaché cases, clutch bags, hip bags, umbrellas, credit card cases, business card cases, key cases, pocket wallets, haversacks, suitcases, daypacks, suit bags, garment bags for travel, and luggage, all made of bio-nylon as a component. Textile fibers; yarn fibers; synthetic fibers for textile use; raw textile fibers; woven fibers of bio-nylon for textile use; non-woven polymeric fibers for conversion into a variety of industrial and consumer goods, namely, non-woven polymeric fibers for textile use and industrial use; woven polymeric fibers for conversion into a variety of industrial and consumer goods, namely, woven polymeric fibers for textile use and industrial use; and synthetic fibers and filaments for use in the manufacture of fabrics, textiles, yarns, and carpets. Thread; yarn; synthetic thread; synthetic yarn; thread for textile use; yarn for textile use; synthetic fiber thread and yarn; and yarn and thread for textile purposes. Bio-nylon fabric for use as a textile in the manufacture of clothing; textile fabrics for use in the manufacture of garments, bags, jackets, gloves, and apparel; fabrics made of bio-nylon for textile use; fabrics for textile use. Clothing, headwear, footwear and outerwear for men, women and children, namely, shirts, t-shirts, sweat shirts, sweat pants, dresses, eveningwear, blouses, neckties, sweaters, cardigans, jerseys, overalls, suits, skirts, shorts, trousers, pants, yoga pants, jeans, bodysuits, leggings, leotards, tights, hosiery, swimwear, bathing trunks, bathing suits, pajamas, nightwear, robes, bras, underwear, panties, girdles, thermal underwear, socks, base layer tops and bottoms, coats, raincoats, jackets, vests, shawls, gloves, slippers, shoes, sneakers, athletic footwear, overshoes, sandals, boots, hats and caps being headwear, headbands being clothing, suspenders, scarves, knee warmers, neck tubes, hand warmers, gaiters, and clothing belts; and finished textile linings for garments, all made of bio-nylon as a component.

5.

METHODS AND ORGANISMS WITH INCREASED CARBON FLUX EFFICIENCIES

      
Numéro d'application 19325355
Statut En instance
Date de dépôt 2025-09-10
Date de la première publication 2026-04-16
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Burgard, Anthony P.
  • Osterhout, Robin E.
  • Van Dien, Stephen J.
  • Pharkya, Priti
  • Yang, Tae Hoon
  • Choi, Jungik

Abrégé

The invention is directed to a non-naturally occurring microbial organism comprising a first attenuation of a succinyl-CoA synthetase or transferase and at least a second attenuation of a succinyl-CoA converting enzyme or a gene encoding a succinate producing enzyme within a multi-step pathway having a net conversion of succinyl-CoA to succinate.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/18 - Polyols
  • C07K 14/245 - Escherichia (G)
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 9/52 - Protéinases provenant de bactéries
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques

6.

Multifunctional Fatty Acid Derivatives And Biosynthesis Thereof

      
Numéro d'application 19297245
Statut En instance
Date de dépôt 2025-08-12
Date de la première publication 2026-03-05
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Schirmer, Andreas W.
  • Bond, Risha Lindig
  • Perry, Erin Frances

Abrégé

The disclosure relates to the field of specialty chemicals and methods for their synthesis. In embodiments, the disclosure provides novel multifunctional fatty acid derivative molecules such as e.g., fatty triols, fatty tetrols, dihydroxy fatty acids, etc. The disclosure further provides derivatives of the disclosed multifunctional molecules which are useful e.g., in the production of personal care products, surfactants, detergents, polymers, paints, coatings, and as emulsifiers, emollients, and thickeners in cosmetics and foods, as industrial solvents and plasticizers, etc. The disclosure further provides biochemical pathways, recombinant microorganisms and methods for the biological production of various multifunctional fatty acid derivatives.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/18 - Polyols
  • C07C 68/00 - Préparation des esters de l'acide carbonique ou de l'acide formique halogéné
  • C07C 69/22 - Esters d'acides acycliques monocarboxyliques saturés dont le groupe carboxyle est lié à un atome de carbone acyclique ou à l'hydrogène avec au moins trois atomes de carbone dans la partie acide
  • C07C 69/30 - Esters d'acides acycliques monocarboxyliques saturés dont le groupe carboxyle est lié à un atome de carbone acyclique ou à l'hydrogène avec au moins trois atomes de carbone dans la partie acide estérifiés par des composés trihydroxylés
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

7.

METHOD OF PRODUCING & PROCESSING DIAMINES

      
Numéro de document 03297132
Statut En instance
Date de dépôt 2015-12-22
Date de disponibilité au public 2026-03-02
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Suominen, Lauri H.
  • Galleher, Connor J.
  • Japs, Michael
  • Burk, Mark J.
  • Tracewell, Cara

Abrégé

Provided is a method of producing and isolating a diamine produced by microbial fermentation that minimizes undesirable salt formation to provide a lower cost process.

Classes IPC  ?

  • C07C 209/62 - Préparation de composés contenant des groupes amino liés à un squelette carboné par clivage de liaisons carbone-azote, soufre-azote ou phosphore-azote, p. ex. hydrolyse d'amides, N-déalkylation d'amines ou de composés d'ammonium quaternaire
  • C08G 69/26 - Polyamides dérivés, soit des acides amino-carboxyliques, soit de polyamines et d'acides polycarboxyliques dérivés de polyamines et d'acides polycarboxyliques
  • C12N 5/10 - Cellules modifiées par l'introduction de matériel génétique étranger, p. ex. cellules transformées par des virus
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote

8.

ENGINEERED MICROORGANISMS WITH G3P ->3PG ENZYME AND/OR FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATASE INCLUDING THOSE HAVING SYNTHETIC OR ENHANCED METHYLOTROPHY

      
Numéro d'application 19043192
Statut En instance
Date de dépôt 2025-01-31
Date de la première publication 2026-02-05
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Nagarajan, Harish
  • Yang, Tae Hoon
  • Khodayari, Ali

Abrégé

Described herein are engineered cells including ones having synthetic methylotrophy which include an NADH-dependent enzyme capable of converting G3P to 3PG (e.g., B. methanolicus gapN) and/or fructose-1,6-bisphosphatase, along with hexulose-6-phosphate synthase, 6-phospho-3-hexuloisomerase, a phosphoketolase, or a combination thereof. Engineered cells of the disclosure beneficially maintain adequate pool sizes of phosphorylated C3 and/or C4 compounds, and/or provide increased levels of NADPH. As such, the modifications allow for the generation of C6 compounds from C1 (e.g., a methanol feedstod) and C5 compounds, the regeneration of C5 compounds from C6 compounds by carbon rearrangement, and an improved balance between regeneration of C5 compounds and lower glycolysis. In turn, this allows the engineered microorganism to generate sufficient quantities of metabolic precursors (e.g., acetyl-CoA) which can be used in a bioproduct pathway, and the engineered cells can include further modifications to those pathway enzymes allowing for production of a desired bioproduct.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 9/90 - Isomérases (5.)
  • C12P 5/00 - Préparation des hydrocarbures
  • C12P 5/02 - Préparation des hydrocarbures acycliques
  • C12P 7/16 - Butanols
  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques
  • C12P 7/46 - Acides dicarboxyliques ayant au plus quatre atomes de carbone, p. ex. acide fumarique, acide maléique
  • C12P 7/6409 - Acides gras
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote

9.

METHOD OF PRODUCING & PROCESSING DIAMINES

      
Numéro d'application 19353369
Statut En instance
Date de dépôt 2025-10-08
Date de la première publication 2026-01-29
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Suominen, Lauri H.
  • Galleher, Connor J.
  • Japs, Michael
  • Burk, Mark J.
  • Tracewell, Cara

Abrégé

Provided is a method of producing and isolating a diamine produced by microbial fermentation that minimizes undesirable salt formation to provide a lower cost process.

Classes IPC  ?

  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12N 1/02 - Séparation des micro-organismes de leurs milieux de culture
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 9/96 - Stabilisation d'une enzyme par formation d'un adduct ou d'une compositionFormation de conjugaisons d'enzymes
  • C12N 11/16 - Enzymes ou cellules microbiennes immobilisées sur ou dans une cellule biologique
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

10.

Production Of Non-Native Monounsaturated Fatty Acids In Bacteria

      
Numéro d'application 19008032
Statut En instance
Date de dépôt 2025-01-02
Date de la première publication 2026-01-08
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Schirmer, Andreas W.
  • Murphy, Katherine Ann
  • Perry, Erin Frances

Abrégé

The disclosure relates to the field of specialty chemicals and methods for their synthesis. In embodiments, the disclosure provides viable bacterial cells which comprise heterologous dual 3-hydroxy-acyl-ACP dehydratase/isomerases, etc. The disclosure further provides monounsaturated fatty acid derivative molecules produced by the viable bacterial cells which are non-native to the bacterial cells. The disclosure further provides methods for the preparation and production of non-native monounsaturated fatty acid derivative molecules such as e.g., an ω3-monounsaturated fatty acid derivative, an ω5-monounsaturated fatty acid derivative, an ω9-monounsaturated fatty acid derivative, an ω11-monounsaturated fatty acid fatty acid derivative, etc.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/6481 - Phosphoglycérides
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12P 7/6418 - Acides gras par hydrolyse d'esters d'acides gras

11.

CARBOXYLIC ACID REDUCTASE AND ALCOHOL DEHYDROGENASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application US2025036331
Numéro de publication 2026/011089
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-07-02
Date de publication 2026-01-08
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Carlin, Dylan, Alexander
  • Cook, Taylor, Bryan
  • Florez, Sergio, L.
  • Goormans, Anke, René, R.
  • Martinez Del Campo, Ana, Elisa
  • Nagarajan, Harish
  • Prabhu, Rupal, Shirish
  • Qu, Fiona
  • Rivera, Izarys
  • Schmidt, Nathan
  • Shah, Amit, Mahendra
  • Taylor, Michael, Evan
  • Van Hove, Bob
  • Vue, Jeremiah, Matthew
  • Wasinger, Sarah

Abrégé

The disclosure provides polypeptides and encoding nucleic acids of engineered carboxylic acid reductases and/or engineered alcohol dehydrogenases. The disclosure also provides cells expressing an engineered form of the carboxylic acid reductases and/or engineered alcohol dehydrogenases. The disclosure further provides methods for producing a bioderived compound, such as 1,6 hexanediol (HDO), hexamethylenediamine (HMD), upstream precursors (e.g., adipate semi-aldehyde, 6-aminocaproic acid, 6-aminocaproate semialdehyde, 6-hydroxyhexanoic acid, 6-aminohexanol, caprolactone, caprolactam, and/or 6- hydroxyhexanal), and products derived therefrom comprising culturing cells expressing an engineered carboxylic acid reductase and/or engineered alcohol dehydrogenases.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C07K 14/195 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries
  • C12P 7/6409 - Acides gras

12.

METHODS FOR ENHANCING MICROBIAL PRODUCTION OF SPECIFIC LENGTH FATTY ALCOHOLS IN THE PRESENCE OF METHANOL

      
Numéro d'application 19207233
Statut En instance
Date de dépôt 2025-05-13
Date de la première publication 2025-12-25
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Osterhout, Robin E.
  • Burgard, Anthony P.
  • Pharkya, Priti
  • Andrae, Stefan

Abrégé

The invention provides non-naturally occurring microbial organisms having a formaldehyde fixation pathway, a formate assimilation pathway, and/or a methanol metabolic pathway in combination with a fatty alcohol, fatty aldehyde, fatty acid or isopropanol pathway, wherein the microbial organisms selectively produce a fatty alcohol, fatty aldehyde or fatty acid of a specified length or isopropanol. The microbial organisms provided advantageously enhance the production of substrates and/or pathway intermediates for the production of chain length specific fatty alcohols, fatty aldehydes, fatty acids or isopropanol. In some aspects, the microbial organisms of the invention have select gene disruptions or enzyme attenuations that increase production of fatty alcohols, fatty aldehydes or fatty acids. The invention additionally provides methods of using the above microbial organisms to produce a fatty alcohol, a fatty aldehyde, a fatty acid or isopropanol.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 9/90 - Isomérases (5.)
  • C12P 7/04 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle acycliques

13.

ALDEHYDE DEHYDROGENASE VARIANTS AND METHODS OF USING SAME

      
Numéro d'application 19252918
Statut En instance
Date de dépôt 2025-06-27
Date de la première publication 2025-12-18
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Shah, Amit
  • Warner, Joseph

Abrégé

The invention provides polypeptides and encoding nucleic acids of aldehyde dehydrogenase variants. The invention also provides cells expressing aldehyde dehydrogenase variants. The invention further provides methods for producing 3-hydroxybutyraldehyde (3-HBal) and/or 1,3-butanediol (1,3-BDO), or an ester or amide thereof, comprising culturing cells expressing an aldehyde dehydrogenase variant or using lysates of such cells. The invention additional provides methods for producing 4-hydroxybutyraldehyde (4-HBal) and/or 1,4-butanediol (1,4-BDO), or an ester or amide thereof, comprising culturing cells expressing an aldehyde dehydrogenase variant or using lysates of such cells.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 15/90 - Introduction stable d'ADN étranger dans le chromosome
  • C12P 7/04 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle acycliques
  • C12P 7/62 - Esters d’acides carboxyliques
  • C12P 13/02 - Amides, p. ex. chloramphénicol

14.

ALDEHYDE DEHYDROGENASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application 18702714
Statut En instance
Date de dépôt 2022-10-18
Date de la première publication 2025-12-04
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Shah, Amit Mahendra
  • Colquitt, Justin Robert
  • Warner, Joseph Roy
  • Zhang, Deqiang

Abrégé

The disclosure provides polypeptides and encoding nucleic acids of engineered aldehyde dehydrogenases. The disclosure also provides cells expressing an engineered form of the aldehyde dehydrogenase. The disclosure further provides methods for producing a bioderived compound, such as 3-hydroxybutyraldehyde, 1,3-butanediol, 4-hydroxybutyraldehyde, 1,4-butanediol, comprising culturing cells expressing an engineered aldehyde dehydrogenase.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12P 13/02 - Amides, p. ex. chloramphénicol
  • C12R 1/19 - Escherichia coli

15.

MICROORGANISMS AND METHODS FOR PRODUCTION OF 4-HYDROXYBUTYRATE, 1,4-BUTANEDIOL AND RELATED COMPOUNDS

      
Numéro d'application 19187905
Statut En instance
Date de dépôt 2025-04-23
Date de la première publication 2025-11-27
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Pharkya, Priti
  • Burgard, Anthony P.
  • Van Dien, Stephen J.
  • Osterhout, Robin E.
  • Burk, Mark J.
  • Trawick, John D.
  • Kuchinskas, Michael P.
  • Steer, Brian
  • Andrae, Stefan
  • Shah, Amit

Abrégé

The invention provides non-naturally occurring microbial organisms having a 4-hydroxybutyrate, gamma-butyrolactone, 1,4-butanediol, 4-hydroxybutanal, 4-hydroxybutyryl-CoA and/or putrescine pathway and being capable of producing 4-hydroxybutyrate, wherein the microbial organism comprises one or more genetic modifications. The invention additionally provides methods of producing 4-hydroxybutyrate, gamma-butyrolactone, 1,4-butanediol, 4-hydroxybutanal, 4-hydroxybutyryl-CoA and/or putrescine or related products using the microbial organisms.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/18 - Polyols
  • C07C 31/20 - Alcools dihydroxyliques
  • C07C 47/19 - Composés saturés comportant des groupes —CHO liés à des atomes de carbone acycliques ou à de l'hydrogène contenant des groupes hydroxyle
  • C07C 211/09 - Diamines
  • C07D 307/33 - Atomes d'oxygène en position 2, l'atome d'oxygène étant sous la forme céto ou énol non substituée
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques
  • C12P 7/62 - Esters d’acides carboxyliques
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 17/04 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'oxygène comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à cinq chaînons, p. ex. griséofulvine
  • C12P 19/32 - Nucléotides avec un système cyclique condensé, contenant un cycle à six chaînons, comportant deux atomes d'azote dans le même cycle, p. ex. nucléotides puriques, dinucléotide de la nicotinamide-adénine

16.

1,3-BUTYLENE GLYCOL COMPOSITIONS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application 18853360
Statut En instance
Date de dépôt 2023-04-10
Date de la première publication 2025-10-23
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Tadesse, Fasil A.
  • Parikh, Aakash

Abrégé

Provided herein are methods, compositions, and uses for a bioderived 1,3 butylene glycol (1,3-BG) characterized by one or more odor-active regions on a chromatograph. Various methods of producing and characterizing an odorless and a fragrant bioderived 1,3-BG for cosmetic uses are also provided.

Classes IPC  ?

17.

ALDEHYDE DEHYDROGENASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application 18701533
Statut En instance
Date de dépôt 2022-10-18
Date de la première publication 2025-10-23
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Shah, Amit Mahendra
  • Colquitt, Justin Robert
  • Warner, Joseph Roy
  • Schmidt, Nathan
  • Praveschotinunt, Pichet

Abrégé

The disclosure provides polypeptides and encoding nucleic acids of engineered aldehyde dehydrogenases. The disclosure also provides cells expressing an engineered form of the aldehyde dehydrogenase. The disclosure further provides methods for producing a bioderived compound, such as 3-hydroxybutyraldehyde, 1,3-butanediol, 4-hydroxybutyraldehyde, 1,4-butanediol, comprising culturing cells expressing an engineered aldehyde dehydrogenase.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12P 7/18 - Polyols

18.

MICROORGANISMS AND METHODS FOR ENHANCING THE AVAILABILITY OF REDUCING EQUIVALENTS IN THE PRESENCE OF METHANOL, AND FOR PRODUCING 1,4-BUTANEDIOL RELATED THERETO

      
Numéro d'application 19096503
Statut En instance
Date de dépôt 2025-03-31
Date de la première publication 2025-10-16
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Burgard, Anthony P.
  • Osterhout, Robin E.
  • Van Dien, Stephen J.
  • Tracewell, Cara Ann
  • Pharkya, Priti
  • Andrae, Stefan

Abrégé

Provided herein is a non-naturally occurring microbial organism having a methanol metabolic pathway that can enhance the availability of reducing equivalents in the presence of methanol. Such reducing equivalents can be used to increase the product yield of organic compounds produced by the microbial organism, such as 1,4-butanediol (BDO). Also provided herein are methods for using such an organism to produce BDO.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/18 - Polyols
  • C07D 207/12 - Atomes d'oxygène ou de soufre
  • C08G 18/32 - Composés polyhydroxylésPolyaminesHydroxyamines
  • C08G 63/06 - Polyesters dérivés soit d'acides hydroxycarboxyliques, soit d'acides polycarboxyliques et de composés polyhydroxylés dérivés des acides hydroxycarboxyliques
  • C08G 63/12 - Polyesters dérivés soit d'acides hydroxycarboxyliques, soit d'acides polycarboxyliques et de composés polyhydroxylés dérivés d'acides polycarboxyliques et de composés polyhydroxylés
  • C08G 63/66 - Polyesters contenant de l'oxygène sous forme de groupes éther
  • C08G 69/26 - Polyamides dérivés, soit des acides amino-carboxyliques, soit de polyamines et d'acides polycarboxyliques dérivés de polyamines et d'acides polycarboxyliques
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12P 19/02 - Monosaccharides

19.

Methods and Compositions for Making Amide Compounds

      
Numéro d'application 18260225
Statut En instance
Date de dépôt 2022-01-15
Date de la première publication 2025-10-02
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Nagarajan, Harish
  • Yang, Tae Hoon
  • Khodayari, Ali
  • Bachan, Shawn
  • Ghatak, Sankha
  • Eakley, Nicholas
  • Shah, Amit
  • Shah, Jinel
  • Zhang, Bo

Abrégé

Disclosed are biosynthetic methods and engineered microorganisms that enhance or improve the biosynthesis of 6-aminocaproate, hexamethylenediamine, caproic acid, caprolactone, or caprolactam. The engineered microorganisms are modified to include, for example, upredulated and/or exogenous transporters for 6-aminocaproate, deletions and/or downregulated importers for 6-aminocaproate, upregulated and/or exogenous glutamate dehydrogenase, and/or deletions and/or downregulation of rcsA and/or cpsBG. Other engineered microorganisms may have disruptions of endogenous transporters for 6-aminocaproate.

Classes IPC  ?

  • C12P 13/02 - Amides, p. ex. chloramphénicol
  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

20.

NEUTRAL TASTE 1,3-BUTYLENE GLYCOL PRODUCTS AND COMPOSITIONS THEREOF

      
Numéro d'application 18853349
Statut En instance
Date de dépôt 2023-04-10
Date de la première publication 2025-09-25
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Tadesse, Fasil A.
  • Parikh, Aakash

Abrégé

The disclosure provides embodiments directed to a 1,3-butylene glycol (BG) product that has a neutral taste, a composition comprising the BG product described here, and methods of using the BG product and compositions comprising the BG products. BG products described here demonstrate exemplary qualities and characteristics of being natural, sustainable, and having a neutral taste for use in food products (including beverages). Such BG compositions of the description provide a BG product that does not mask or alter the taste of the food products. The BG products and compositions comprising such BG products as disclosed here provide advantageous properties while maintaining a neutral taste.

Classes IPC  ?

21.

METHOD FOR SEPARATING HEXAMETHYLENE DIAMINE FROM AN AQUEOUS SOLUTION OBTAINED FROM A MICROBIAL FERMENTATION PROCESS

      
Numéro d'application EP2025052801
Numéro de publication 2025/176454
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-02-04
Date de publication 2025-08-28
Propriétaire
  • COVESTRO DEUTSCHLAND AG (Allemagne)
  • GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Leimbrink, Mathias
  • Krause, Jonas
  • Altuntepe, Emrah
  • Bausa, Jürgen
  • Waltermann, Thomas
  • Galleher, Connor
  • Chen, Bo
  • Safari, Iman

Abrégé

The present invention provides a method for separating hexamethylene diamine (HMDA) from an aqueous solution, comprising the steps: a) providing an HMDA- containing aqueous solution, wherein said aqueous solution is a fermentation broth, b) extracting the HMDA-containing aqueous solution with a monovalent alcohol having 4 to 8 carbon atoms, c) obtaining an HMDA-containing alcoholic phase, and d) distilling the HMDA-containing alcoholic phase at a pressure of 1-1000 mbar and separating the HMDA from the monovalent alcohol.

Classes IPC  ?

22.

USE OF TWO DIFFERENT SOLVENTS FOR THE EXTRACTION OF 1,6-HEXAMETHYLENEDIAMINE PRODUCED BY MICROBIAL FERMENTATION

      
Numéro d'application EP2025053701
Numéro de publication 2025/176527
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2025-02-12
Date de publication 2025-08-28
Propriétaire
  • COVESTRO DEUTSCHLAND AG (Allemagne)
  • GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Krause, Jonas
  • Altuntepe, Emrah
  • Faecke, Thomas
  • Gamez, Jose
  • Waltermann, Thomas

Abrégé

Method for separating 1,6-hexamethylenediamine (HMDA) from an aqueous solution, comprising the steps: a) providing HMDA-containing aqueous solution, wherein said aqueous solution is a fermentation broth, b) extracting the HMDA-containing aqueous solution with a solvent mixture (i) at least one monovalent alcohol having 4 to 7 carbon atoms and (ii) at least one alkane having 5 to 7 carbon atoms, wherein the alkane content of the solvent mixture is in the range from 2 wt% to 50 wt% based on the total weight of all alcohols and alkanes present in the solvent mixture; c) obtaining an HMDA- containing solvent mixture as separatephase, and d) distilling the HMDA-containing solvent mixture and separating the HMDA from the solvent mixture.

Classes IPC  ?

23.

1,3-Fatty Diol Compounds And Derivatives Thereof

      
Numéro d'application 19184068
Statut En instance
Date de dépôt 2025-04-21
Date de la première publication 2025-07-31
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Wang, Haibo
  • Bond, Risha Lindig

Abrégé

The disclosure relates to the field of specialty chemicals. In particular, the disclosure provides novel 1,3-fatty-diol compounds and derivatives thereof which are useful e.g., in the production of personal care products, surfactants, detergents, polymers, paints, coatings, and as emulsifiers, emollients, and thickeners in cosmetics and foods, as industrial solvents and plasticizers, etc.

Classes IPC  ?

  • C07C 33/035 - Alcènediols
  • C07H 15/10 - Radicaux acycliques non substitués par des structures cycliques liés à un atome d'oxygène d'un radical saccharide contenant des liaisons non saturées carbone-carbone

24.

VECORA

      
Numéro de série 99295838
Statut En instance
Date de dépôt 2025-07-22
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Classes de Nice  ?
  • 01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture
  • 17 - Produits en caoutchouc ou en matières plastiques; matières à calfeutrer et à isoler
  • 22 - Cordes; filets; tentes, auvents, voiles et sacs; matières de rembourrage
  • 23 - Fils à usage textile
  • 24 - Tissus et produits textiles
  • 25 - Vêtements; chaussures; chapellerie

Produits et services

Polymer base compositions used in the manufacture of commercial, industrial and domestic goods; Polymer compositions used in the manufacture of commercial and industrial goods; Polymer base compositions used in the manufacture of goods, namely, clothing, exercise apparel, compression garments, home furnishing; Polymers, biopolymers, polymeric additives and biopolymeric additives for use in the manufacture of industrial products, consumer and household products, sealants or packaging; Chemicals for use in industry; Chemicals used in the manufacture of fabric or textiles; Polyamide Resins in bars, blocks, pellets, rods, sheets and tubes for general industrial use; Resins in extruded form for general industrial use; Semi-processed synthetic resins Textile fibers; Yarn fibers; Synthetic fibers for textile use; Raw textile fibers; Woven fibers of nylon and bio-nylon for textile use; Non-woven polymeric fibers for conversion into a variety of industrial and consumer goods; Woven polymeric fibers for conversion into a variety of industrial and consumer goods; Synthetic fibers and filaments for use in the manufacture of fabrics, textiles, yarns, and carpets Thread; Yarn; Synthetic thread; Synthetic yarn; Thread for textile use; Yarn for textile use; Synthetic fiber thread and yarn; Yarn and thread for textile purposes; Yarn made of nylon, bio-nylon, and biofabricated materials for textile use Nylon fabric; Nylon and Bio-nylon fabric for use as a textile in the manufacture of clothing; Textile fabrics for use in the manufacture of garments, bags, jackets, gloves, and apparel; Fabrics made of nylon and bio-nylon for textile use; Fabrics for textile use; Nylon and Bio-nylon fabric for use as a textile in the manufacture of tote bags, all-purpose sports bags, all-purpose carrying bags, carry-on bags, weekend bags, sack packs, namely, drawstring bags used as backpacks, beach bags, toiletry bags sold empty, cosmetic bags sold empty, shopping bags, wheeled shopping bags, reusable shopping bags, sling bags for carrying infants, knitted bags not of precious metals, travel bags, school book bags, duffle bags, wheeled duffle bags, messenger bags, diaper bags, gym bags, purses, handbags, cross-body bags, drawstring bags; Nylon and Bio-nylon fabric for use as a textile in the manufacture of shoulder bags, waist bags, wristlet bags, backpacks, rucksacks, wallets, not of precious metal, briefcases, attaché cases, clutch bags, hip bags, umbrellas, credit card cases, business card cases, key cases, pocket wallets, haversacks, suitcases, daypacks, suit bags, garment bags for travel, and luggage Fabric sold as an integral component of finished clothing items, namely, headwear, footwear and outerwear for men, women and children, namely, shirts, t-shirts, sweat shirts, sweat pants, dresses, eveningwear being gowns, blouses, neckties, sweaters, cardigans, jerseys, overalls, suits, skirts, shorts, trousers, pants, yoga pants, jeans, bodysuits, leggings, leotards, tights, hosiery, swimwear, bathing trunks, bathing suits, pajamas, nightwear, robes, bras, underwear, panties, shapewear, namely, girdles, thermal underwear, socks, base layer tops and bottoms, coats, raincoats, jackets, vests; Fabric sold as an integral component of finished clothing items, namely, shawls, gloves, slippers, shoes, sneakers, athletic footwear, overshoes, sandals, boots, hats and caps being headwear, headbands being clothing, suspenders, scarves, knee warmers, neck tubes, hand warmers, gaiters, and clothing belts; Finished textile linings for garments

25.

NEUTRAL ODOR 1,3-BUTYLENE GLYCOL COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF

      
Numéro d'application 18853340
Statut En instance
Date de dépôt 2023-04-10
Date de la première publication 2025-07-10
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Tadesse, Fasil A.
  • Parikh, Aakash

Abrégé

The disclosure provides embodiments directed to a 1,3-butylene glycol (BG) product that has a neutral odor, a composition comprising the BG product described here, and methods of using the BG product and compositions comprising the BG products. BG products described here demonstrate exemplary qualities and characteristics of being natural, sustainable, and having a neutral odor for use in cosmetics, cosmeceuticals, and personal care products. Such BG compositions of the description provide a BG product that does not mask or alter the fragrance notes of the cosmetics, cosmeceuticals, and personal care products. The BG products and compositions comprising such BG products as disclosed here are cost-effective while maintaining a neutral odor.

Classes IPC  ?

26.

Microorganisms And Methods For Production Of Fatty Acid Derivatives With Reduced Levels Of Byproducts

      
Numéro d'application 18846710
Statut En instance
Date de dépôt 2023-03-15
Date de la première publication 2025-06-26
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s) Schirmer, Andreas W.

Abrégé

Recombinant microbes comprising a novel pathway for producing fatty acid derivatives, such as fatty acid methyl esters, fatty acid ethyl esters, fatty alcohols, and fatty alcohol acetates, while generating low levels of 3-hydroxy fatty acid byproducts are provided herein. The addition of a heterologous R-3-hydroxy-acyl-CoA dehydratase or a heterologous R-specific enoyl-CoA hydratase and optionally a heterologous trans-2-enoyl-CoA reductase to a recombinant microbe reduces the amount of 3-hydroxy fatty acid byproducts produced by the acyl-ACP dependent fatty acid biosynthesis pathway of the recombinant microbe. Methods of producing the fatty acid derivatives are also provided, in addition to cell cultures and fatty acid derivative compositions produced by the recombinant microbes. The fatty acid derivatives produced by the recombinant microbes may be used to produce fragrances, pheromones, pharmaceutical agents, nutraceuticals or precursors thereof.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/6436 - Esters d'acides gras
  • C07C 57/03 - Acides monocarboxyliques
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)

27.

SEMISYNTHETIC ROUTES TO ORGANIC COMPOUNDS

      
Numéro d'application 18953693
Statut En instance
Date de dépôt 2024-11-20
Date de la première publication 2025-06-12
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Del Cardayre, Stephen B.
  • Schirmer, Andreas W.
  • Ko, Myong
  • Wang, Haibo

Abrégé

The present disclosure relates to processes that combine microbial production of organic intermediates and subsequent synthetic transformation to provide compounds of industrial value, including compounds used in fragrances.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/08 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'oxygène comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle d'au moins sept chaînons, p. ex. zéaraléone, aglycones de macrolides
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques
  • C12P 7/44 - Acides polycarboxyliques
  • C12P 17/04 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'oxygène comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à cinq chaînons, p. ex. griséofulvine

28.

3-HYDROXYBUTYRYL-COA DEHYDROGENASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application 18979283
Statut En instance
Date de dépôt 2024-12-12
Date de la première publication 2025-06-05
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Hoff, Kevin
  • Tracewell, Cara Ann
  • Chan, Kui
  • Kuchinskas, Michael P.
  • Nagarajan, Harish

Abrégé

The present disclosure provides thiolases and polypeptide variants of 3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase, nucleic acids encoding the same, vectors comprising the nucleic acids, and cells comprising the polypeptide variants and/or thiolase, the nucleic acids, and/or the vectors. The present disclosure also provides methods of making and using the same, including methods for culturing cells, and for the production of various products, including 3-hydroxybutyryl-CoA (3-HB-CoA), 3-hydroxybutyraldehyde (3-HBal), 3-hydroxybutyrate (3-HB), 1,3-butanediol (1,3-BDO), and esters and amides thereof, and products made from any of these.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12P 7/52 - Acide propioniqueAcides butyriques
  • C12P 19/32 - Nucléotides avec un système cyclique condensé, contenant un cycle à six chaînons, comportant deux atomes d'azote dans le même cycle, p. ex. nucléotides puriques, dinucléotide de la nicotinamide-adénine

29.

DESATURASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application US2024053097
Numéro de publication 2025/090952
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-10-25
Date de publication 2025-05-01
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Cao, Yangxiaolu
  • Cohen, Jacob, William
  • Gleizer, Shmuel
  • Martinez Del Campo, Ana, Elisa
  • Prabhu, Rupal, Shirish
  • Schirmer, Andreas, Walter
  • Schmidt, Nathan
  • Wasinger, Sarah

Abrégé

The disclosure provides polypeptides and encoding nucleic acids of engineered desaturases. The disclosure also provides cells expressing an engineered form of the desaturase or a desaturase as described herein. The disclosure further provides methods for producing a bioderived compound, such as fatty acid precursors, fatty acids, and/or derivatives thereof, comprising culturing cells expressing an engineered desaturase or a desaturase provided herein. The disclosure further provides methods for producing pheromones or pheromone precursors, comprising culturing cells expressing an engineered desaturase or a desaturase provided herein and obtaining the fatty acid precursors, fatty acids, and/or derivatives thereof bioderived therefrom. The disclosure further provides methods for producing fragrances or fragrance precursors, comprising culturing cells expressing an engineered desaturase or a desaturase provided herein and obtaining the fatty acid precursors, fatty acids, and/or derivatives thereof bioderived therefrom.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/82 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour cellules végétales
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase

30.

CARBOXYLIC ACID REDUCTASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application US2024053031
Numéro de publication 2025/090914
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-10-25
Date de publication 2025-05-01
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • De Jesus-Kim, Lorraine
  • Martinez Del Campo, Ana, Elisa
  • Ritter, Seth, C.
  • Rivera, Izarys
  • Schirmer, Andreas, Walter

Abrégé

The disclosure provides polypeptides and encoding nucleic acids of engineered carboxylic acid reductases. The disclosure also provides cells expressing an engineered form of the carboxylic acid reductase or a carboxylic acid reductase as described herein. The disclosure further provides methods for producing a bioderived compound, such as fatty acid derivatives and/or products thereof, comprising culturing cells expressing an engineered carboxylic acid reductase or a carboxylic acid reductase provided herein. The disclosure further provides methods for producing pheromones or pheromone precursors, comprising culturing cells expressing an engineered carboxylic acid reductase or a carboxylic acid reductase provided herein and obtaining the fatty acid derivatives and/or products thereof bioderived therefrom.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12P 7/6409 - Acides gras
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

31.

Enzyme variants with improved ester synthase properties

      
Numéro d'application 18662446
Numéro de brevet 12398383
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-05-13
Date de la première publication 2025-03-27
Date d'octroi 2025-08-26
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Shumaker, Andrew M.
  • Da Costa, Bernardo M. T.
  • Holden, Kevin
  • Hom, Louis G.
  • Baron, Tarah S.
  • Helman, Noah

Abrégé

The disclosure relates to enzyme variants with improved ester synthase properties for the production of fatty acid esters. Further contemplated are recombinant host cells that express such variants, cell cultures comprising the recombinant host cells and fatty acid ester compositions produced by such recombinant host cells.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/18 - Hydrolases agissant sur les esters d'acides carboxyliques
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12P 7/64 - GraissesHuilesCires de type esterAcides gras supérieurs, c.-à-d. ayant une chaîne continue d'au moins sept atomes de carbone liée à un groupe carboxyleHuiles ou graisses oxydées
  • C12P 7/6436 - Esters d'acides gras

32.

Microbial Production Of Fatty Diols

      
Numéro d'application 18800482
Statut En instance
Date de dépôt 2024-08-12
Date de la première publication 2025-03-27
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Schirmer, Andreas W.
  • Helman, Noah
  • Wang, Haibo
  • Hu, Zhihao
  • Arlagadda, Vikranth
  • Ramos-Solis, Alma Itzel
  • Clarke, Elizabeth J.

Abrégé

The disclosure relates to fatty diols and recombinant microorganisms for producing them. More particularly, the disclosure relates to recombinant microorganisms engineered to produce fatty diols via fermentation. Further encompassed is a process that uses the microorganisms to produce fatty diols from a simple carbon source.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

33.

Methods And Compositions For Improved Production Of Fatty Acids And Derivatives Thereof

      
Numéro d'application 18816019
Statut En instance
Date de dépôt 2024-08-27
Date de la première publication 2025-03-20
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Greenfield, Derek L.
  • Hom, Louis G.
  • Sanchez-Riera, Fernando A.
  • Hu, Zhihao
  • Arlagadda, Vikranth
  • Groban, Eli S.
  • Frykman, Scott A.

Abrégé

The invention relates to compositions and methods, including polynucleotide sequences, amino acid sequences, and engineered host cells for producing fatty acids and derivates of fatty acids such as acyl-CoA, terminal olefins, fatty aldehydes, fatty alcohols, alkanes, alkenes, wax esters, ketones and internal olefins through altered expression of the transcription factor, fadR.

Classes IPC  ?

  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C07C 31/125 - Alcools monohydroxyliques acycliques contenant de cinq à vingt-deux atomes de carbone
  • C07C 33/02 - Alcools acycliques à liaisons doubles carbone-carbone
  • C07C 53/126 - Acides contenant au moins cinq atomes de carbone
  • C07K 14/195 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries
  • C07K 14/24 - Peptides ayant plus de 20 amino-acidesGastrinesSomatostatinesMélanotropinesLeurs dérivés provenant de bactéries provenant d'Entérobacteriaceae (F), p. ex. Citrobacter, Serratia, Proteus, Providencia, Morganella, Yersinia
  • C07K 14/245 - Escherichia (G)
  • C07K 14/255 - Salmonella (G)
  • C07K 14/26 - Klebsiella (G)
  • C12P 7/6409 - Acides gras

34.

FORMATE DEHYDROGENASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application 18580585
Statut En instance
Date de dépôt 2022-08-29
Date de la première publication 2025-03-13
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Shah, Amit Mahendra
  • Colquitt, Justin Robert
  • Napolitano, Michael Gregory
  • Schmidt, Nathan
  • Praveschotinunt, Pichet
  • Warner, Joseph Roy

Abrégé

The disclosure provides polypeptides and encoding nucleic acids of engineered formate dehydrogenases. The disclosure also provides cells expressing an engineered formate dehydrogenase. The disclosure further provides methods for producing a bioderived compound comprising culturing cells expressing an engineered formate dehydrogenase. Where the engineered formate dehydrogenase is capable of catalyzing a conversion.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 1/26 - Procédés utilisant des hydrocarbures ou milieux de culture en contenant
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12P 7/18 - Polyols

35.

THIOESTERASE VARIANTS HAVING IMPROVED ACTIVITY FOR THE PRODUCTION OF MEDIUM-CHAIN FATTY ACID DERIVATIVES

      
Numéro d'application 18937302
Statut En instance
Date de dépôt 2024-11-05
Date de la première publication 2025-02-20
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Bautista, Angelica Zabala
  • Park, Min Sun
  • Ramos-Solis, Alma Itzel
  • Torres Da Costa, Bernardo Moura
  • Behrouzian, Behnaz
  • Trimbur, Donald E.
  • Popova, Emanuela
  • Hu, Qijun
  • Del Cardayre, Stephen Bralley

Abrégé

The disclosure relates to engineered plant acyl-ACP thioesterases having improved activity for the production of medium-chain fatty acid derivatives including e.g., eight carbon and ten carbon fatty acids and fatty acid derivatives. The disclosure further relates to recombinant host cells comprising the engineered plant acyl-ACP thioesterases having improved activity for the production of medium-chain fatty acid derivatives. The disclosure also relates to methods of decreasing toxicity and improving production of medium-chain fatty acids and derivatives.

Classes IPC  ?

36.

Methods of producing omega-hydroxylated fatty acid derivatives

      
Numéro d'application 18595947
Numéro de brevet 12595495
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-03-05
Date de la première publication 2025-01-16
Date d'octroi 2026-04-07
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Schirmer, Andreas W.
  • Wang, Haibo
  • Del Cardayre, Stephen B.
  • Hu, Zhihao
  • Hom, Louis G.
  • Zhu, Baolong
  • Chang, Cindy
  • Popova, Emanuela E.

Abrégé

The disclosure relates to omega-hydroxylated fatty acid derivatives and methods of producing them. Herein, the disclosure encompasses a novel and environmentally friendly production method that provides omega-hydroxylated fatty acid derivatives at high purity and yield. Further encompassed are recombinant microorganisms that produce omega-hydroxylated fatty acid derivatives through selective fermentation.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/6409 - Acides gras
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/62 - Séquences d'ADN codant pour des protéines de fusion
  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques
  • C12P 7/6436 - Esters d'acides gras

37.

MICROORGANISMS AND METHODS FOR INCREASED DIAMINE PRODUCTION

      
Numéro d'application US2024030558
Numéro de publication 2024/243302
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-05-22
Date de publication 2024-11-28
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Khodayari, Ali
  • Shah, Amit, Mahendra
  • Griffin, Benjamin, Matthew
  • Nagarajan, Harish
  • Thweatt, Jennifer
  • Shah, Jinel
  • Warner, Joseph, Roy
  • Ghatak, Sankha
  • Bachan, Shawn

Abrégé

The disclosure provides polypeptides and encoding nucleic acids of engineered diamine exporters. The disclosure also provides cells expressing engineered diamine exporter or exogenous diamine exporters. The disclosure further provides methods for diamine bioproduction.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12N 15/11 - Fragments d'ADN ou d'ARNLeurs formes modifiées
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote

38.

Obtaining Aliphatic Amines from Compositions

      
Numéro d'application 18294024
Statut En instance
Date de dépôt 2022-09-19
Date de la première publication 2024-10-17
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Merkel, Michael
  • Leimbrink, Mathias
  • Steffens, Friedhelm

Abrégé

The invention relates to a method for obtaining an amine from a composition by means of distillation and a composition obtainable by that method. The invention also relates to a method for the production of an isocyanate from the composition obtainable.

Classes IPC  ?

  • C07C 209/86 - Séparation
  • B01D 3/14 - Distillation fractionnée
  • B01D 5/00 - Condensation de vapeursRécupération de solvants volatils par condensation
  • C07C 263/10 - Préparation de dérivés d'acide isocyanique par réaction d'amines avec des halogénures de carbonyle, p. ex. avec du phosgène

39.

Method for the Removal of Water from and Transport of Aliphatic Diamines

      
Numéro d'application 18294035
Statut En instance
Date de dépôt 2022-09-19
Date de la première publication 2024-10-10
Propriétaire
  • COVESTRO DEUTSCHLAND AG (Allemagne)
  • Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Merkel, Michael
  • Leimbrink, Mathias
  • Steffens, Friedhelm

Abrégé

The invention relates to a method for the removal of water from and transport of at least one aliphatic diamine comprising the following steps: a) providing a first composition including 60 to 98 wt.-% water and 2 to 40 wt.-% of the at least one aliphatic diamine with two —NH2 groups per molecule, each of them bound to a primary or secondary carbon atom, b) removing water at least partially from said first composition by distillation at a first production location in a distillation apparatus comprising at least two distillation columns operating at different head pressures, thus generating a second composition comprising the diamine and ≤55 wt.-% water, wherein the vapours emerging from the distillation column operating at the higher head pressure are used to evaporate the liquid in the bottoms and/or the feed of a distillation column operating at the lower head pressure at least partially, c) transporting said second composition during a span of time t from the first production location to a second production location, wherein the span of time t including times for optional temporary storage is at least 6 h.

Classes IPC  ?

  • C07C 209/84 - Purification
  • C07C 263/10 - Préparation de dérivés d'acide isocyanique par réaction d'amines avec des halogénures de carbonyle, p. ex. avec du phosgène
  • C08G 69/28 - Procédés de préparation

40.

Method for the Processing and Transport of Hexane-1,6-Diamine or Pentane-1,5-Diamine

      
Numéro d'application 18294009
Statut En instance
Date de dépôt 2022-09-19
Date de la première publication 2024-10-10
Propriétaire
  • COVESTRO DEUTSCHLAND AG (Allemagne)
  • Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s) Merkel, Michael

Abrégé

The invention relates to a method for the processing and transport of hexane-1,6-diamine or pentane-1,5-diamine comprising the steps of: a) Providing a first composition including 60 to 98 wt.-% water and 2 to 40 wt.-% hexane-1,6-diamine or pentane-1,5-diamine, b) partially removing water from the first composition by distillation at a first production location, whereby a second composition is generated, said second composition including the hexane-1,6-diamine or pentane-1,5-diamine and 1 wt.-% to 35 wt.-% water, and c) transporting said second composition during a span of time t from the first production location to a second production location, wherein the span of time t including times for optional temporary storage is at least 6 h.

Classes IPC  ?

  • C07C 211/12 - Diamino-1,6 hexanes
  • C07C 263/10 - Préparation de dérivés d'acide isocyanique par réaction d'amines avec des halogénures de carbonyle, p. ex. avec du phosgène

41.

MULTIFUNCTIONAL FATTY ACID DERIVATIVES AND BIOSYNTHESIS THEREOF

      
Numéro d'application 18339397
Statut En instance
Date de dépôt 2023-06-22
Date de la première publication 2024-09-19
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Schirmer, Andreas W.
  • Bond, Risha Lindig
  • Perry, Erin Frances

Abrégé

The disclosure relates to the field of specialty chemicals and methods for their synthesis. In embodiments, the disclosure provides novel multifunctional fatty acid derivative molecules such as e.g., fatty triols, fatty tetrols, dihydroxy fatty acids, etc. The disclosure further provides derivatives of the disclosed multifunctional molecules which are useful e.g., in the production of personal care products, surfactants, detergents, polymers, paints, coatings, and as emulsifiers, emollients, and thickeners in cosmetics and foods, as industrial solvents and plasticizers, etc. The disclosure further provides biochemical pathways, recombinant microorganisms and methods for the biological production of various multifuctional fatty acid derivatives.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/18 - Polyols
  • C07C 68/00 - Préparation des esters de l'acide carbonique ou de l'acide formique halogéné
  • C07C 69/22 - Esters d'acides acycliques monocarboxyliques saturés dont le groupe carboxyle est lié à un atome de carbone acyclique ou à l'hydrogène avec au moins trois atomes de carbone dans la partie acide
  • C07C 69/30 - Esters d'acides acycliques monocarboxyliques saturés dont le groupe carboxyle est lié à un atome de carbone acyclique ou à l'hydrogène avec au moins trois atomes de carbone dans la partie acide estérifiés par des composés trihydroxylés
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

42.

ENGINEERED ENZYMES AND METHODS OF MAKING AND USING

      
Numéro d'application 18707150
Statut En instance
Date de dépôt 2022-10-26
Date de la première publication 2024-09-05
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Shah, Amit Mahendra
  • Zhang, Deqiang
  • Warner, Joseph Roy
  • Griffin, Benjamin Matthew
  • Shah, Jinel
  • Colquitt, Justin Robert

Abrégé

The invention provides an engineered carboxylic acid reductase (CAR) enzyme, a nucleic acid encoding the CAR enzyme, and a non-naturally occurring microbial organism comprising an exogenous nucleic acid encoding the CAR, an engineered transaminase (TA) enzyme, and/or a hexamethylenediamine (HMD) transaminase (TA2) enzyme. The invention provides a non-naturally occurring microbial organism that has a 1,6-hexanediol (HDO) pathway with a HDO pathway enzyme expressed in sufficient amounts to produce 6 aminocaproate semialdehyde, HDO, or both. The invention further provides a non-naturally occurring microbial organism that has an HMD pathway with a HMD pathway enzyme expressed in sufficient amounts to produce 6-aminocaproate semialdehyde, HMD, or both. The invention additionally provides bioderived HMD, 6-aminocaproate semialdehyde, and/or HDO and methods for producing bioderived HMD, 6-aminocaproate semialdehyde, and/or HDO.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 7/04 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle acycliques
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote

43.

Microorganisms and methods for improving product yields on methanol using acetyl-CoA synthesis

      
Numéro d'application 18390570
Numéro de brevet 12529078
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-12-20
Date de la première publication 2024-09-05
Date d'octroi 2026-01-20
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Osterhout, Robin E.
  • Burgard, Anthony P.
  • Pharkya, Priti
  • Andrae, Stefan

Abrégé

The invention provides non-naturally occurring microbial organisms containing enzymatic pathways and/or metabolic modifications for enhancing carbon flux through acetyl-CoA. In some embodiments, the microbial organisms of the invention having such pathways also include pathways for generating reducing equivalents, formaldehyde fixation and/or formate assimilation. The enhanced carbon flux through acetyl-CoA, in combination with pathways for generating reducing equivalents, formaldehyde fixation and/or formate assimilation can, in some embodiments, be used for production of a bioderived compound. Accordingly, in some embodiments, the microbial organisms of the invention can include a pathway capable of producing a bioderived compound of the invention. The invention still further provides a bioderived compound produced by a microbial organism of the invention, culture medium having the bioderived compound of the invention, compositions having the bioderived compound of the invention, a biobased product comprising the bioderived compound of the invention, and a process for producing a bioderived compound of the invention.

Classes IPC  ?

  • C12P 5/02 - Préparation des hydrocarbures acycliques
  • C12N 1/14 - ChampignonsLeurs milieux de culture
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 1/21 - BactériesLeurs milieux de culture modifiés par l'introduction de matériel génétique étranger
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12N 15/81 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour champignons pour levures
  • C12P 7/02 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle
  • C12P 7/04 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle acycliques
  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12P 7/40 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carboxyle
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques
  • C12P 7/44 - Acides polycarboxyliques
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 17/10 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle

44.

MICROORGANISMS AND METHODS FOR REDUCING BY-PRODUCTS

      
Numéro d'application US2024014854
Numéro de publication 2024/168072
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2024-02-07
Date de publication 2024-08-15
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Nagarajan, Harish
  • Scalcinati, Gionata
  • Noble, Michael, Angus

Abrégé

The present disclosure provides nonrnaturally occurring microbial organisms having eliminate, substantially eliminate, or reduced production of unwanted by-products (e.g, 3HB, acetate, and others) and/or to enhance or increase carbon flux through 3 HB-CoA, and/or 3HBAId, and/or the CoA thioesters or acyl-CoAs of unwanted by-products, which can increase production of acetyl-CoA derived compounds (e.g, 1,3-BDO, MMA, and (3R)-hydroxybutyl (3R)-hydroxybutyrate, or any other acetyl-CoA derived compounds), and products made from any of these compounds. Also provided are one or more exogenous nucleic acids encoding enzymes that can eliminate, substantially eliminate, or reduce production of unwanted by-products (e.g, 3HB, acetate, and others) and/or that can enhance or increase carbon flux through 3HB-CoA, 3HBAId, and/or the CoA thioesters/acyl-CoAs of unwanted by-products.

Classes IPC  ?

  • C07C 31/20 - Alcools dihydroxyliques
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 1/13 - Algues unicellulairesLeurs milieux de culture modifiés par l'introduction de matériel génétique étranger
  • C12N 9/14 - Hydrolases (3.)
  • C12P 7/16 - Butanols
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase

45.

Production of non-native monounsaturated fatty acids in bacteria

      
Numéro d'application 18284349
Numéro de brevet 12649937
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-03-22
Date de la première publication 2024-07-11
Date d'octroi 2026-06-09
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Schirmer, Andreas W.
  • Perry, Erin Frances
  • Ramos-Solis, Alma Itzel
  • Zabala-Bautista, Angelica

Abrégé

Recombinant proteobacteria, including γ-proteobacteria, comprising a heterologous acyl-ACP desaturase and a heterologous acyl-ACP thioesterase, wherein the native dual 3-hydroxy acyl-ACP dehydratase/isomerase is deleted are provided herein. The recombinant proteobacteria produce non-native monounsaturated free fatty acids or derivatives thereof. Methods of producing non-native monounsaturated free fatty acids or derivatives thereof are also provided, in addition to cell cultures and fatty acid compositions produced by the recombinant proteobacteria. The recombinant proteobacteria may be used to produce insect pheromones or precursors thereof, and fragrances or precursors thereof.

Classes IPC  ?

  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12P 7/6409 - Acides gras

46.

1,3-BUTYLENE GLYCOL COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF

      
Numéro d'application 18569956
Statut En instance
Date de dépôt 2022-06-10
Date de la première publication 2024-07-11
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s) Huston, Kyle

Abrégé

The disclosure provides embodiments directed to a composition comprising a 1,3-butylene glycol (1,3-BG; such as but not limited to, bioBG) and one or more fragrance ingredients, which form a fragrance component of the composition. 1,3-BG demonstrates exemplary qualities and characteristics of being natural, sustainable, and substantially non-odorous, for use in fragrance compositions. Methods of using or applying such 1,3-BG fragrance compositions provide a cost-efficient, sustainable composition, since 1,3-BG does not mask or alter the fragrance notes of the fragrance ingredients allowing for the use of smaller quantities of fragrance ingredients. The 1,3-BG fragrance compositions of the disclosure also improve fragrance performance and reduces greenhouse gases, while avoiding any irritation, sensitization, or allergic reaction in humans.

Classes IPC  ?

47.

LIGASE AND DEHYDROGENASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application US2023086280
Numéro de publication 2024/145507
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-12-28
Date de publication 2024-07-04
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Van Hove, Bob
  • Mcmurry, Jonathan, Lewis
  • Carlin, Dylan, Alexander
  • Qu, Fiona
  • Martinez Del Campo, Ana, Elisa
  • Shah, Amit, Mahendra
  • Nagarajan, Harish
  • Goormans, Anke René R.

Abrégé

The disclosure provides polypeptides and encoding nucleic acids of engineered acyl coenzyme-A ligases, engineered acetylating aldehyde dehydrogenases or both. The disclosure also provides cells expressing an engineered form of the acyl coenzyme-A ligases, acetylating aldehyde dehydrogenases or both. The disclosure further provides methods for producing a bioderived compound, such as 6-hydroxyhexanoyl coenzyme-A, 6 -hydroxy hexanal, 1,6 hexanediol, 6-aminocaproyl-CoA, 6-aminocaproate semialdehyde, hexamethylenediamine, and products derived therefrom comprising culturing cells expressing an engineered acyl coenzyme-A ligases, engineered acetylating aldehyde dehydrogenases or both.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/90 - Isomérases (5.)
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes

48.

PHOSPHOKETOLASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application 18554448
Statut En instance
Date de dépôt 2022-04-08
Date de la première publication 2024-07-04
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Zhou, Hui
  • Schmidt, Nathan
  • Praveschotinunt, Pichet
  • Carvalho, Brian

Abrégé

The disclosure provides polypeptides and encoding nucleic acids of engineered phosphoketolases. The disclosure also provides cells expressing an engineered phosphoketolase. The disclosure further provides methods for producing a bioderived compound comprising culturing cells expressing an engineered phosphoketolase.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12P 1/00 - Préparation de composés ou de compositions, non prévue dans les groupes , utilisant des micro-organismes ou des enzymesProcédés généraux de préparation de composés ou de compositions utilisant des micro-organismes ou des enzymes

49.

PROCESS AND SYSTEMS FOR OBTAINING 1,3-BUTANEDIOL FROM FERMENTATION BROTHS

      
Numéro d'application 18469170
Statut En instance
Date de dépôt 2023-09-18
Date de la première publication 2024-06-13
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Khandurina, Julia
  • Pacheco, Rachel Diane
  • Suominen, Lauri Hannunpoika
  • Wagester, Rainer

Abrégé

Provided herein are bioderived 1,3-butanediol compositions and systems and processes for producing such bioderived 1,3-butanediol compositions.

Classes IPC  ?

  • C07C 29/80 - SéparationPurificationStabilisationEmploi d'additifs par traitement physique par distillation
  • B01D 3/14 - Distillation fractionnée
  • B01D 15/36 - Adsorption sélective, p. ex. chromatographie caractérisée par le mécanisme de séparation impliquant une interaction ionique, p. ex. échange d'ions, paire d'ions, suppression d'ions ou exclusion d'ions
  • C07C 29/94 - Emploi d'additifs, p. ex. pour la stabilisation
  • C07C 31/20 - Alcools dihydroxyliques

50.

Method of producing and processing diamines to a diamine free base using a carbonate intermediate and an engineered microorganism

      
Numéro d'application 18321585
Numéro de brevet 12503711
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-05-22
Date de la première publication 2024-06-06
Date d'octroi 2025-12-23
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Suominen, Lauri H.
  • Galleher, Connor J.
  • Japs, Michael
  • Burk, Mark J.
  • Tracewell, Cara

Abrégé

Provided is a method of producing and isolating a diamine produced by microbial fermentation that minimizes undesirable salt formation to provide a lower cost process.

Classes IPC  ?

  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12N 1/02 - Séparation des micro-organismes de leurs milieux de culture
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 9/96 - Stabilisation d'une enzyme par formation d'un adduct ou d'une compositionFormation de conjugaisons d'enzymes
  • C12N 11/16 - Enzymes ou cellules microbiennes immobilisées sur ou dans une cellule biologique
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

51.

Downstream processing of fatty alcohol compositions produced by recombinant host cells

      
Numéro d'application 18334745
Numéro de brevet 12516007
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-06-14
Date de la première publication 2024-05-16
Date d'octroi 2026-01-06
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Ko, Myong
  • Wang, Haibo
  • Cole, Patricia J.
  • Liao, Perry Y.
  • Li, Simon

Abrégé

The disclosure relates to downstream processing of fatty alcohol (FALC) and provides a novel purification method that provides FALC at high purity and yield.

Classes IPC  ?

  • C07C 29/88 - SéparationPurificationStabilisationEmploi d'additifs par traitement donnant lieu à une modification chimique d'au moins un composé
  • C07C 29/17 - Préparation de composés comportant des groupes hydroxyle ou O-métal liés à un atome de carbone ne faisant pas partie d'un cycle aromatique à six chaînons par hydrogénation de liaisons doubles ou triples carbone-carbone

52.

MICROORGANISMS AND METHODS FOR PRODUCING (3R)-HYDROXYBUTYL (3R)-HYDROXYBUTYRATE

      
Numéro d'application 18482834
Statut En instance
Date de dépôt 2023-10-06
Date de la première publication 2024-05-09
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Adelstein, Benjamin
  • Osterhout, Robin E.
  • Burk, Mark J.

Abrégé

Provided herein are non-naturally occurring microbial organisms having a pathway for production of (3R)-hydroxybutyl (3R)-hydroxybutyrate, wherein the organism can further include a (R)-1,3-butanediol pathway, a (3R)-hydroxybutyrate pathway, a (3R)-hydroxybutyryl-CoA pathway, an acetoacetate pathway, an acetoacetyl-CoA pathway, a (3R)-hydroxybutyl-ACP pathway, or an acetoacetyl-ACP pathway. Additionally provided are methods and processes for producing and isolating (3R)-hydroxybutyl (3R)-hydroxybutyrate using the microbial organisms, and various compositions having the (3R)-hydroxybutyl (3R)-hydroxybutyrate. Still further provided are methods of treating or preventing a disease, disorder or condition using the (3R)-hydroxybutyl (3R)-hydroxybutyrate produced by the microbial organisms of the invention.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/62 - Esters d’acides carboxyliques
  • A23L 33/135 - Bactéries ou leurs dérivés, p. ex. probiotiques
  • A61K 31/22 - Esters, p. ex. nitroglycérine, sélénocyanates d'acides carboxyliques d'acides acycliques, p. ex. pravastatine
  • A61K 35/66 - Micro-organismes ou substances provenant de micro-organismes
  • A61K 36/064 - Saccharomycetales, p. ex. levure de boulanger
  • C07C 69/675 - Esters d'acides carboxyliques dont le groupe carboxyle estérifié est lié à un atome de carbone acyclique et dont l'un des groupes OH, O-métal, —CHO, céto, éther, acyloxy, des groupes , des groupes ou des groupes se trouve dans la partie acide d'acides saturés d'acides hydroxycarboxyliques saturés
  • C12N 1/00 - Micro-organismes, p. ex. protozoairesCompositions les contenantProcédés de culture ou de conservation de micro-organismes, ou de compositions les contenantProcédés de préparation ou d'isolement d'une composition contenant un micro-organismeLeurs milieux de culture
  • C12N 1/14 - ChampignonsLeurs milieux de culture
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 9/18 - Hydrolases agissant sur les esters d'acides carboxyliques
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

53.

Production of fatty acid derivatives

      
Numéro d'application 18344219
Numéro de brevet 12662679
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-06-29
Date de la première publication 2024-05-09
Date d'octroi 2026-06-23
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Greenfield, Derek L.
  • Schirmer, Andreas W.
  • Clarke, Elizabeth J.
  • Groban, Eli S.
  • Da Costa, Bernardo M.
  • Hu, Zhihao
  • Holden, Kevin
  • Helman, Noah

Abrégé

The disclosure relates to recombinant host cells including strain modifications effective to improve titer, yield and/or productivity of fatty acid derivatives. The disclosure further relates to cell cultures including the recombinant host cells for the fermentative production of fatty acid derivatives and compositions thereof.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12N 1/21 - BactériesLeurs milieux de culture modifiés par l'introduction de matériel génétique étranger
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 9/90 - Isomérases (5.)
  • C12P 7/04 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle acycliques
  • C12P 7/6409 - Acides gras
  • C12P 7/6436 - Esters d'acides gras

54.

MICROORGANISMS AND METHODS FOR THE PRODUCTION OF BIOSYNTHESIZED TARGET PRODUCTS HAVING REDUCED LEVELS OF BYPRODUCTS

      
Numéro d'application 18242912
Statut En instance
Date de dépôt 2023-09-06
Date de la première publication 2024-05-02
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Osterhout, Robin E.
  • Pharkya, Priti

Abrégé

Provided herein are non-naturally occurring microbial organisms having biosynthetic pathways for production of target products and one or more genetic modifications that reduce a byproduct of the biosynthetic pathway. Compositions of target products from such cells and methods of using such cells are provided.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/10 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12P 7/40 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carboxyle
  • C12P 7/44 - Acides polycarboxyliques
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 17/08 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'oxygène comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle d'au moins sept chaînons, p. ex. zéaraléone, aglycones de macrolides

55.

Methods and organisms with increased carbon flux efficiencies

      
Numéro d'application 18453987
Numéro de brevet 12435346
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-08-22
Date de la première publication 2024-04-18
Date d'octroi 2025-10-07
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Burgard, Anthony P.
  • Osterhout, Robin E.
  • Van Dien, Stephen J.
  • Pharkya, Priti
  • Yang, Tae Hoon
  • Choi, Jungik

Abrégé

The invention is directed to a non-naturally occurring microbial organism comprising a first attenuation of a succinyl-CoA synthetase or transferase and at least a second attenuation of a succinyl-CoA converting enzyme or a gene encoding a succinate producing enzyme within a multi-step pathway having a net conversion of succinyl-CoA to succinate.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/18 - Polyols
  • C07K 14/245 - Escherichia (G)
  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 9/52 - Protéinases provenant de bactéries
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques

56.

Acyl-ACP reductase with improved properties

      
Numéro d'application 18355990
Numéro de brevet 12173329
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-07-20
Date de la première publication 2024-04-11
Date d'octroi 2024-12-24
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Rude, Mathew
  • Trinh, Na
  • Schirmer, Andreas
  • Gano, Jacob

Abrégé

The disclosure relates to acyl-ACP reductase (AAR) enzyme variants that result in improved fatty aldehyde and fatty alcohol production when expressed in recombinant host cells. The disclosure further relates to methods of making and using such AAR variants for the production of fatty alcohol compositions having particular characteristics.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12P 7/04 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle acycliques
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12P 7/6409 - Acides gras

57.

Microorganisms and methods for enhancing the availability of reducing equivalents in the presence of methanol, and for producing 1,4-butanediol related thereto

      
Numéro d'application 18346715
Numéro de brevet 12668820
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-07-03
Date de la première publication 2024-02-15
Date d'octroi 2026-06-30
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Burgard, Anthony P.
  • Osterhout, Robin E.
  • Van Dien, Stephen J.
  • Tracewell, Cara Ann
  • Pharkya, Priti
  • Andrae, Stefan

Abrégé

Provided herein is a non-naturally occurring microbial organism having a methanol metabolic pathway (MMP) that can enhance the availability of reducing equivalents in the presence of methanol. Such reducing equivalents can be used to increase the product yield of organic compounds produced by the microbial organism, such as 1,4-butanediol (BDO). Also provided herein are methods for using such an organism to produce BDO.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/18 - Polyols
  • C07D 207/12 - Atomes d'oxygène ou de soufre
  • C08G 18/32 - Composés polyhydroxylésPolyaminesHydroxyamines
  • C08G 63/06 - Polyesters dérivés soit d'acides hydroxycarboxyliques, soit d'acides polycarboxyliques et de composés polyhydroxylés dérivés des acides hydroxycarboxyliques
  • C08G 63/12 - Polyesters dérivés soit d'acides hydroxycarboxyliques, soit d'acides polycarboxyliques et de composés polyhydroxylés dérivés d'acides polycarboxyliques et de composés polyhydroxylés
  • C08G 63/66 - Polyesters contenant de l'oxygène sous forme de groupes éther
  • C08G 69/26 - Polyamides dérivés, soit des acides amino-carboxyliques, soit de polyamines et d'acides polycarboxyliques dérivés de polyamines et d'acides polycarboxyliques
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12P 19/02 - Monosaccharides

58.

Aldehyde dehydrogenase variants and methods of using same

      
Numéro d'application 18191774
Numéro de brevet 12371673
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-03-28
Date de la première publication 2023-12-28
Date d'octroi 2025-07-29
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Shah, Amit
  • Warner, Joseph

Abrégé

The invention provides polypeptides and encoding nucleic acids of aldehyde dehydrogenase variants. The invention also provides cells expressing aldehyde dehydrogenase variants. The invention further provides methods for producing 3-hydroxybutyraldehyde (3-HBal) and/or 1,3-butanediol (1,3-BDO), or an ester or amide thereof, comprising culturing cells expressing an aldehyde dehydrogenase variant or using lysates of such cells. The invention additional provides methods for producing 4-hydroxybutyraldehyde (4-HBal) and/or 1,4-butanediol (1,4-BDO), or an ester or amide thereof, comprising culturing cells expressing an aldehyde dehydrogenase variant or using lysates of such cells.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 15/90 - Introduction stable d'ADN étranger dans le chromosome
  • C12P 7/04 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle acycliques
  • C12P 7/62 - Esters d’acides carboxyliques
  • C12P 13/02 - Amides, p. ex. chloramphénicol

59.

COMPOSITIONS AND MULTIPLEXED SYSTEMS FOR COUPLED CELL-FREE TRANSCRIPTION-TRANSLATION AND PROTEIN SYNTHESIS AND METHODS FOR USING THEM

      
Numéro d'application 18120951
Statut En instance
Date de dépôt 2023-03-13
Date de la première publication 2023-12-14
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Culler, Stephanie
  • Chen, Ihsiung Brandon
  • Pharkya, Priti
  • Van Dien, Steve
  • Barton, Nelson

Abrégé

In alternative embodiments, provided herein are transcription/translation (TX-TL) systems and methods of using them for use as rapid prototyping platforms for the synthesis, modification and identification of natural products (NPs), and natural product analogs (NPAs) and secondary metabolites, from biosynthetic gene cluster pipelines. In alternative embodiments, exemplary TX-TL systems as provided herein are used for the combinatorial biosynthesis of natural products (NPs), natural product analogs (NPAs) and secondary metabolites. In alternative embodiments, exemplary TX-TL systems as provided herein are used for the rapid prototyping of complex biosynthetic pathways as a way to rapidly assess combinatorial and biosynthetic designs before moving to cellular hosts. In alternative embodiments, these exemplary TX-TL systems are multiplexed for high-throughput (HT) automation and for prototyping engineered platforms for the synthesis or modification of natural products (NPs), and natural product analogs (NPAs) and secondary metabolites analogs.

Classes IPC  ?

  • C12Q 1/6869 - Méthodes de séquençage
  • A61K 35/66 - Micro-organismes ou substances provenant de micro-organismes
  • C12P 21/02 - Préparation de peptides ou de protéines comportant une séquence connue de plusieurs amino-acides, p. ex. glutathion
  • C12P 19/34 - Polynucléotides, p. ex. acides nucléiques, oligoribonucléotides
  • A61K 36/02 - Algues
  • A61K 36/06 - Champignons, p. ex. levures
  • C12N 5/16 - Cellules animales
  • C12N 15/09 - Technologie d'ADN recombinant
  • C40B 40/04 - Bibliothèques comprenant uniquement des composés organiques

60.

ENGINEERED ENZYMES AND METHODS OF MAKING AND USING

      
Numéro d'application 17996921
Statut En instance
Date de dépôt 2021-04-23
Date de la première publication 2023-11-02
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Shah, Amit Mahendra
  • Zhang, Deqiang
  • Warner, Joseph Roy
  • Griffin, Benjamin Matthew
  • Komor, Russell Scott
  • Nagarajan, Harish
  • Ghatak, Sankha
  • Richardson, Toby Howard

Abrégé

The invention provides an engineered carboxylic acid reductase (CAR) enzyme, a nucleic acid encoding the CAR enzyme, and a non-naturally occurring microbial organism comprising an exogenous nucleic acid encoding the CAR, an engineered transaminase (TA) enzyme, and/or a hexamethylenediamine (HMD) transaminase (TA2) enzyme. The invention provides a non-naturally occurring microbial organism that has a 1,6-hexanediol (HDO) pathway with a HDO pathway enzyme expressed in sufficient amounts to produce 6 aminocaproate semi aldehyde, HDO, or both. The invention further provides a non-naturally occurring microbial organism that has an HMD pathway with a HMD pathway enzyme expressed in sufficient amounts to produce 6-aminocaproate semialdehyde, HMD, or both. The invention additionally provides bioderived HMD, 6-aminocaproate semialdehyde, and/or HDO and methods for producing bioderived HMD, 6-aminocaproate semialdehyde, and/or HDO.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 7/04 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle acycliques
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)

61.

1,3-BUTYLENE GLYCOL COMPOSITIONS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application US2023065599
Numéro de publication 2023/201208
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-04-10
Date de publication 2023-10-19
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Tadesse, Fasil, A.
  • Parikh, Aakash

Abrégé

Provided herein are methods, compositions, and uses for a bioderived 1,3 butylene glycol (1,3-BG) characterized by one or more odor-active regions on a chromatograph. Various methods of producing and characterizing an odorless and a fragrant bioderived 1,3-BG for cosmetic uses are also provided.

Classes IPC  ?

62.

MICROORGANISMS AND METHODS FOR ENHANCING THE AVAILABILITY OF REDUCING EQUIVALENTS IN THE PRESENCE OF METHANOL, AND FOR PRODUCING ADIPATE, 6-AMINOCAPROATE, HEXAMETHYLENEDIAMINE OR CAPROLACTAM RELATED THERETO

      
Numéro d'application 18158680
Statut En instance
Date de dépôt 2023-01-24
Date de la première publication 2023-10-19
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Burgard, Anthony P.
  • Osterhout, Robin E.
  • Van Dien, Stephen J.
  • Tracewell, Cara Ann
  • Pharkya, Priti
  • Andrae, Stefan

Abrégé

Provided herein is a non-naturally occurring microbial organism having a methanol metabolic pathway that can enhance the availability of reducing equivalents in the presence of methanol. Such reducing equivalents can be used to increase the product yield of organic compounds produced by the microbial organism, such as adipate, 6-aminocaproate, hexamethylenediamine or caprolactam. Also provided herein are methods for using such an organism to produce adipate, 6-aminocaproate, hexamethylenediamine or caprolactam.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/10 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle
  • C12P 7/44 - Acides polycarboxyliques
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C08G 63/78 - Procédés de préparation
  • C08G 73/02 - Polyamines
  • C08G 69/16 - Procédés de préparation
  • C08G 69/08 - Polyamides dérivés, soit des acides amino-carboxyliques, soit de polyamines et d'acides polycarboxyliques dérivés d'acides aminocarboxyliques
  • A23L 29/00 - Aliments ou produits alimentaires contenant des additifsLeur préparation ou leur traitement
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

63.

NEUTRAL TASTE 1,3-BUTYLENE GLYCOL PRODUCTS AND COMPOSITIONS THEREOF

      
Numéro d'application US2023065595
Numéro de publication 2023/201205
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-04-10
Date de publication 2023-10-19
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Tadesse, Fasil, A.
  • Parikh, Aakash

Abrégé

The disclosure provides embodiments directed to a 1,3-butylene glycol (BG) product that has a neutral taste, a composition comprising the BG product described here, and methods of using the BG product and compositions comprising the BG products. BG products described here demonstrate exemplary qualities and characteristics of being natural, sustainable, and having a neutral taste for use in food products (including beverages). Such BG compositions of the description provide a BG product that does not mask or alter the taste of the food products. The BG products and compositions comprising such BG products as disclosed here provide advantageous properties while maintaining a neutral taste.

Classes IPC  ?

  • A23L 27/20 - Épices, agents aromatiques ou condiments synthétiques
  • A23L 2/52 - Addition d'ingrédients
  • A23C 9/13 - Préparations à base de lait fermentéTraitements utilisant des micro-organismes ou des enzymes comportant l'emploi d'additifs
  • A23C 9/133 - Fruits ou légumes
  • A23C 9/137 - Substances épaississantes

64.

NEUTRAL ODOR 1,3-BUTYLENE GLYCOL COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF

      
Numéro d'application US2023065603
Numéro de publication 2023/201211
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-04-10
Date de publication 2023-10-19
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Tadesse, Fasil, A.
  • Parikh, Aakash

Abrégé

The disclosure provides embodiments directed to a 1,3-butylene glycol (BG) product that has a neutral odor, a composition comprising the BG product described here, and methods of using the BG product and compositions comprising the BG products. BG products described here demonstrate exemplary qualities and characteristics of being natural, sustainable, and having a neutral odor for use in cosmetics, cosmeceuticals, and personal care products. Such BG compositions of the description provide a BG product that does not mask or alter the fragrance notes of the cosmetics, cosmeceuticals, and personal care products. The BG products and compositions comprising such BG products as disclosed here are cost-effective while maintaining a neutral odor.

Classes IPC  ?

  • A61K 8/04 - DispersionsÉmulsions
  • A61K 8/02 - Cosmétiques ou préparations similaires pour la toilette caractérisés par une forme physique particulière
  • A61K 8/81 - Cosmétiques ou préparations similaires pour la toilette caractérisés par la composition contenant des composés organiques macromoléculaires obtenus par des réactions faisant intervenir uniquement des liaisons insaturées carbone-carbone
  • A61K 9/06 - OnguentsExcipients pour ceux-ci

65.

ACYL-ACP THIOESTERASE VARIANTS AND USES THEREOF

      
Numéro d'application US2023064461
Numéro de publication 2023/178193
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-03-15
Date de publication 2023-09-21
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Schirmer, Andreas W.
  • Popova, Emanuela Emilova
  • Wong, Leland Ken
  • Holden, Kevin

Abrégé

Variant acyl-ACP thioesterases and recombinant cells, microorganisms, or microbes, including proteobacteria and cyanobacteria, comprising the variant acyl-ACP thioesterases, are provided herein. The recombinant microbes produce monounsaturated free fatty acids and/or derivatives thereof, including palmitoleic acid and palmitoleic acid ethyl ester. Methods of producing monounsaturated free fatty acids or derivatives thereof are also provided, in addition to cell cultures and fatty acid derivative compositions produced by the recombinant microbes. The recombinant microbes may be used to produce fragrances, flavors, pheromones, pharmaceutical agents, nutraceuticals, nutritional or dietary supplements, or precursors thereof.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 15/00 - Techniques de mutation ou génie génétiqueADN ou ARN concernant le génie génétique, vecteurs, p. ex. plasmides, ou leur isolement, leur préparation ou leur purificationUtilisation d'hôtes pour ceux-ci

66.

RECOMBINANT MICROBES FOR PRODUCTION OF TRANS-2 UNSATURATED FATTY ACIDS AND DERIVATIVES THEREOF

      
Numéro d'application US2023064465
Numéro de publication 2023/178197
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-03-15
Date de publication 2023-09-21
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Schirmer, Andreas W.
  • Georgianna, David Ryan
  • Perry, Erin Frances

Abrégé

Recombinant microbes comprising a novel pathway for producing trans-2 fatty acids and derivatives thereof are provided herein. The recombinant microbes comprise (1) either a combination of a 3-hydroxy acyl-ACP thioesterase and an acyl-CoA synthetase, or a 3-hydroxy acyl-ACP:CoA transacylase; (2) a heterologous R-3-hydroxy-acyl-CoA dehydratase or a heterologous R-specific enoyl-CoA hydratase; and, optionally (3) a fatty acid derivative enzyme, such as, for example, an ester synthase, an acyl-CoA reductase, or an acyl-CoA thioesterase. Methods of producing trans-2 fatty acids or derivatives thereof are also provided, in addition to cell cultures and fatty acid compositions produced by the recombinant microbes. The trans-2 fatty acids and derivatives thereof produced by the recombinant microbes may be used to produce fragrances, flavors, pheromones, pharmaceutical agents, nutraceuticals, or precursors thereof.

Classes IPC  ?

  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 9/16 - Hydrolases (3.) agissant sur les liaisons esters (3.1)
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 15/09 - Technologie d'ADN recombinant
  • C12P 7/6409 - Acides gras

67.

MICROORGANISMS AND METHODS FOR PRODUCTION OF FATTY ACID DERIVATIVES WITH REDUCED LEVELS OF BYPRODUCTS

      
Numéro d'application US2023064485
Numéro de publication 2023/178211
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-03-15
Date de publication 2023-09-21
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s) Schirmer, Andreas W.

Abrégé

RRR-specific enoyl-CoA hydratase and optionally a heterologous trans-2-enoyl-CoA reductase to a recombinant microbe reduces the amount of 3-hydroxy fatty acid byproducts produced by the acyl-ACP dependent fatty acid biosynthesis pathway of the recombinant microbe. Methods of producing the fatty acid derivatives are also provided, in addition to cell cultures and fatty acid derivative compositions produced by the recombinant microbes. The fatty acid derivatives produced by the recombinant microbes may be used to produce fragrances, pheromones, pharmaceutical agents, nutraceuticals or precursors thereof.

Classes IPC  ?

  • C12N 1/20 - BactériesLeurs milieux de culture
  • C12N 9/18 - Hydrolases agissant sur les esters d'acides carboxyliques
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 7/64 - GraissesHuilesCires de type esterAcides gras supérieurs, c.-à-d. ayant une chaîne continue d'au moins sept atomes de carbone liée à un groupe carboxyleHuiles ou graisses oxydées

68.

MICROBIAL PRODUCTION OF Z3-HEXENOL, Z3-HEXENAL AND Z3-HEXENYL ACETATE

      
Numéro d'application US2023064560
Numéro de publication 2023/178261
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-03-16
Date de publication 2023-09-21
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Schirmer, Andreas W.
  • Nagarajan, Harish

Abrégé

RRR-3-hydroxyhexanoyl-CoA dehydratase/e2-z3-hexenoyl-CoA isomerase; a heterologous aldehyde dehydrogenase; a heterologous acyl-CoA reductase; and an alcohol dehydrogenase for the production of z3-hexenol, z3-hexenal, and/or z3-hexenyl acetate. Methods of producing z3-hexenol, z3-hexenal, and/or z3-hexenyl acetate are also provided, in addition to cell cultures and fatty acid derivative compositions produced by the recombinant microbes.

Classes IPC  ?

69.

MICROORGANISMS AND METHODS FOR REDUCING BY-PRODUCTS

      
Numéro d'application 17772990
Statut En instance
Date de dépôt 2020-10-28
Date de la première publication 2023-09-14
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Nagarajan, Harish
  • Scalcinati, Gionata
  • Yang, Tae Hoon

Abrégé

The present disclosure provides microbial organisms having decreased production of unwanted by-products (e.g, pyruvate-, CO2—, TCA-derived by-products; acetate; ethanol; and/or, alanine) to enhance carbon flux through acetyl-CoA, which can increase production of acetyl-CoA derived compounds (e.g, 1,3-BDO, MMA, and (3R)-hydroxybutyl (3R)-hydroxybutyrate, or any other acetyl-CoA derived compounds), and products made from any of these compounds. Also provided are one or more exogenous nucleic acids encoding enzymes that can decrease production of unwanted by-products (e.g, aldehyde dehydrogenase, acetyl-CoA synthase, amino acid dehydrogenase, alanine racemase, and/or citrate synthase), and/or one or more gene attenuations occurring in genes (e.g., acetolactate synthase) that result in decreased production of unwanted by-products. Various combinations of the exogenous nucleic acids and gene deletions are also provided in the present disclosure. Methods of making and using the same, including methods for culturing cells, and for the production of the various products are also provided.

Classes IPC  ?

70.

MICROORGANISMS AND METHODS FOR THE PRODUCTION OF BUTADIENE USING ACETYL-COA

      
Numéro d'application 17749529
Statut En instance
Date de dépôt 2022-05-20
Date de la première publication 2023-09-14
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Pharkya, Priti
  • Burgard, Anthony P.
  • Burk, Mark J.

Abrégé

The invention provides non-naturally occurring microbial organisms containing butadiene or 2,4-pentadienoate pathways comprising at least one exogenous nucleic acid encoding a butadiene or 2,4-pentadienoate pathway enzyme expressed in a sufficient amount to produce butadiene or 2,4-pentadienoate. The organism can further contain a hydrogen synthesis pathway. The invention additionally provides methods of using such microbial organisms to produce butadiene or 2,4-pentadienoate by culturing a non-naturally occurring microbial organism containing butadiene or 2,4-pentadienoate pathways as described herein under conditions and for a sufficient period of time to produce butadiene or 2,4-pentadienoate. Hydrogen can be produced together with the production of butadiene or 2,4-pentadienoate.

Classes IPC  ?

  • C12P 5/02 - Préparation des hydrocarbures acycliques
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 3/00 - Préparation d'éléments ou de composés inorganiques à l'exception du dioxyde de carbone
  • C12P 7/40 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carboxyle
  • C01B 3/00 - HydrogèneMélanges gazeux contenant de l'hydrogèneSéparation de l'hydrogène à partir de mélanges en contenantPurification de l'hydrogène
  • C08F 36/06 - Butadiène
  • C08F 36/14 - Homopolymères ou copolymères de composés contenant un ou plusieurs radicaux aliphatiques non saturés, l'un au moins contenant plusieurs liaisons doubles carbone-carbone le radical ne contenant que deux doubles liaisons carbone-carbone conjuguées contenant des éléments autres que le carbone et l'hydrogène
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

71.

FLAVIN-DEPENDENT OXIDASES HAVING CANNABINOID SYNTHASE ACTIVITY

      
Numéro d'application US2023063479
Numéro de publication 2023/168266
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-03-01
Date de publication 2023-09-07
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s) Huddleston, Jamison, Parker

Abrégé

The present disclosure relates to a non-natural flavin-dependent oxidase that does not comprise a disulfide bond and that is capable of oxidative cyclization of a prenylated aromatic compound into a cannabinoid. In some embodiments, the non-natural flavin-dependent oxidase comprises: (i) at least 70% sequence identity to SEQ ID NO:3; and (ii) substitutions at amino acid positions Q275, C285, V323, E370, V372, N400, D404, and T438, wherein the amino acid positions correspond to SEQ ID NO:3. The present disclosure further relates to a polynucleotide, an expression construct, and an engineered cell for making the non-natural flavin-dependent oxidase. Also provided are a composition omprising the non-natural flavin-dependent oxidase; an isolated non-natural flavin-dependent oxidase and methods of making the same; a cell extract or cell culture medium comprising the non-natural flavin-dependent oxidase; and methods of making a cannabinoid.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12P 7/22 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle aromatiques
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/83 - Vecteurs viraux, p. ex. virus de la mosaïque du chou-fleur

72.

FLAVIN-DEPENDENT OXIDASES HAVING CANNABINOID SYNTHASE ACTIVITY

      
Numéro d'application US2023063485
Numéro de publication 2023/168272
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-03-01
Date de publication 2023-09-07
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Huddleston, Jamison Parker
  • Schirmer, Andreas
  • Purdy, Trevor Nelson

Abrégé

12345678910111212-Gly, wherein each X is any amino acid; and wherein the FAD cofactor is covalently attached to the Cys residue, wherein the flavin-dependent oxidase is capable of oxidative cyclization of a prenylated aromatic compound into a cannabinoid, and wherein the flavin-dependent oxidase is a bacterial protein or a fungal protein.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12P 17/06 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'oxygène comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons, p. ex. fluorescéine

73.

METHOD OF PRODUCING CANNABINOIDS

      
Numéro d'application US2023063492
Numéro de publication 2023/168277
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2023-03-01
Date de publication 2023-09-07
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Huddleston, Jamison Parker
  • Schirmer, Andreas
  • Purdy, Trevor Nelson
  • Griffin, Benjamin Matthew

Abrégé

C. sativaC. sativa.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 15/74 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes procaryotes autres que E. coli, p. ex. Lactobacillus, Micromonospora
  • C12N 15/80 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour champignons
  • A61K 38/44 - Oxydoréductases (1)
  • A61K 31/352 - Composés hétérocycliques ayant l'oxygène comme seul hétéro-atome d'un cycle, p. ex. fungichromine ayant des cycles à six chaînons avec un oxygène comme seul hétéro-atome d'un cycle condensés avec des carbocycles, p. ex. cannabinols, méthanthéline

74.

Methanol dehydrogenase fusion proteins

      
Numéro d'application 17943482
Numéro de brevet 12534710
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-09-13
Date de la première publication 2023-08-24
Date d'octroi 2026-01-27
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Barton, Nelson R.
  • Li, Jingyi
  • Warner, Joseph R.
  • Pharkya, Priti

Abrégé

Described herein are fusion proteins including methanol dehydrogenase (MeDH) and at least one other polypeptide such as 3-hexulose-6-phosphate dehydrogenase (HPS) or 6-phospho-3-hexuloisomerase (PHI), such as DHAS synthase or fructose-6-Phosphate aldolase or such as DHA synthase or DHA kinase. In a localized manner, the fusion protein can promote the conversion of methanol to formaldehyde and then to a ketose phosphate such as hexulose 6-phosphate or then to DHA and G3P. When expressed in cells, the fusion proteins can promote methanol uptake and rapid conversion to the ketose phosphate or to the DHA and D3P, which in turn can be used in a pathway for the production of a desired bioproduct. Beneficially, the rapid conversion to the ketose phosphate or to the DHA and G3P can avoid the undesirable accumulation of formaldehyde in the cell. Also described are engineered cells expressing the fusion protein, optionally include one or more additional metabolic pathway transgene(s), methanol metabolic pathway genes, target product pathway genes, cell culture compositions including the cells, methods for promoting production of the target product or intermediate thereof from the cells, compositions including the target product or intermediate, and products made from the target product or intermediate.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 9/90 - Isomérases (5.)
  • C12N 9/92 - Isomérase de glucose
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 15/62 - Séquences d'ADN codant pour des protéines de fusion
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle

75.

PROCESS OF SYNTHESIZING AND PURIFYING (3R)-HYDROXYBUTYL (3R)-HYDROXYBUTANOATE

      
Numéro d'application 17998111
Statut En instance
Date de dépôt 2021-05-10
Date de la première publication 2023-06-08
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Chen, Bo
  • Safari, Iman
  • Levine, Seth

Abrégé

A process for synthesizing (R)-3 -hy droxybutyl (R)-3 -hy droxybutanoate from ethyl (R)-3-hydroxybutanoate and (R)-1,3-butanediol, as well a process for synthesizing (R)-3-hy droxybutyl (R)-3-hy droxybutanoate from (R)-3-hydroxybutyric acid and (R)-1,3-butanediol. Also provided are processes for isolating (R)-3-hy droxybutyl (R)-3-hy droxybutanoate, including from a fermentation broth.

Classes IPC  ?

  • C07C 67/08 - Préparation d'esters d'acides carboxyliques par réaction d'acides carboxyliques ou d'anhydrides symétriques avec le groupe hydroxyle ou O-métal de composés organiques
  • C07C 67/54 - SéparationPurificationStabilisationEmploi d'additifs par modification de l'état physique, p. ex. par cristallisation par distillation
  • C12P 7/18 - Polyols

76.

Omega-Hydroxylase-Related Fusion Polypeptides With Improved Properties

      
Numéro d'application 17818038
Statut En instance
Date de dépôt 2022-08-08
Date de la première publication 2023-06-01
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Zhu, Baolong
  • Schirmer, Andreas W.
  • Chang, Cindy

Abrégé

The disclosure relates to omega-hydroxylase-related fusion polypeptides that result in improved omega-hydroxylated fatty acid derivative production when expressed in recombinant host cells. The disclosure further relates to microorganisms for ex pressing the omega-hydroxylase-related fusion polypeptides for the production of omega-hydroxylated fatty acid derivatives.

Classes IPC  ?

77.

Omega-hydroxylase-related fusion polypeptide variants with improved properties

      
Numéro d'application 17834681
Numéro de brevet 12180515
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-06-07
Date de la première publication 2023-05-25
Date d'octroi 2024-12-31
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Schirmer, Andreas
  • Zhu, Baolong
  • Popova, Emanuela

Abrégé

The disclosure relates to omega-hydroxylase-related fusion polypeptides that result in improved omega-hydroxylated fatty acid derivative production when expressed in recombinant host cells. The disclosure further relates to microorganisms for expressing the omega-hydroxylase-related fusion polypeptides for the production of omega-hydroxylated fatty acid derivatives.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/18 - Hydrolases agissant sur les esters d'acides carboxyliques
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 15/62 - Séquences d'ADN codant pour des protéines de fusion
  • C12N 15/81 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour champignons pour levures

78.

ENGINEERED ENZYMES AND METHODS OF MAKING AND USING

      
Numéro d'application US2022078739
Numéro de publication 2023/076966
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-10-26
Date de publication 2023-05-04
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Shah, Amit, Mahendra
  • Zhang, Deqiang
  • Warner, Joseph, Roy
  • Griffin, Benjamin, Matthew
  • Shah, Jinel
  • Colquitt, Justin, Robert

Abrégé

The invention provides an engineered carboxylic acid reductase (CAR) enzyme, a nucleic acid encoding the CAR enzyme, and a non-naturally occurring microbial organism comprising an exogenous nucleic acid encoding the CAR, an engineered transaminase (TA) enzyme, and/or a hexamethylenediamine (HMD) transaminase (TA2) enzyme. The invention provides a non-naturally occurring microbial organism that has a 1,6-hexanediol (HDO) pathway with a HDO pathway enzyme expressed in sufficient amounts to produce 6 aminocaproate semialdehyde, HDO, or both. The invention further provides a non-naturally occurring microbial organism that has an HMD pathway with a HMD pathway enzyme expressed in sufficient amounts to produce 6-aminocaproate semialdehyde, HMD, or both. The invention additionally provides bioderived HMD, 6-aminocaproate semialdehyde, and/or HDO and methods for producing bioderived HMD, 6-aminocaproate semialdehyde, and/or HDO.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle

79.

COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE BIOSYNTHESIS OF 1,4-BUTANEDIOL AND ITS PRECURSORS

      
Numéro d'application 17749015
Statut En instance
Date de dépôt 2022-05-19
Date de la première publication 2023-05-04
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Burk, Mark J.
  • Van Dien, Stephen J.
  • Burgard, Anthony P.
  • Niu, Wei

Abrégé

The invention provides a non-naturally occurring microbial biocatalyst including a microbial organism having a 4-hydroxybutanoic acid (4-HB) biosynthetic pathway having at least one exogenous nucleic acid encoding 4-hydroxybutanoate dehydrogenase, succinyl-CoA synthetase, CoA-dependent succinic semialdehyde dehydrogenase, or α-ketoglutarate decarboxylase, wherein the exogenous nucleic acid is expressed in sufficient amounts to produce monomeric 4-hydroxybutanoic acid (4-HB). Also provided is a non-naturally occurring microbial biocatalyst including a microbial organism having 4-hydroxybutanoic acid (4-HB) and 1,4-butanediol (BDO) biosynthetic pathways, the pathways include at least one exogenous nucleic acid encoding 4-hydroxybutanoate dehydrogenase, succinyl-CoA synthetase, CoA-dependent succinic semialdehyde dehydrogenase, 4-hydroxybutyrate:CoA transferase, 4-butyrate kinase, phosphotransbutyrylase, α-ketoglutarate decarboxylase, aldehyde dehydrogenase, alcohol dehydrogenase or an aldehyde/alcohol dehydrogenase, wherein the exogenous nucleic acid is expressed in sufficient amounts to produce 1,4-butanediol (BDO). Additionally provided are methods for the production of 4-HB and BDO.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12P 7/52 - Acide propioniqueAcides butyriques
  • C12P 17/04 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'oxygène comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à cinq chaînons, p. ex. griséofulvine
  • B01D 3/00 - Distillation ou procédés d'échange apparentés dans lesquels des liquides sont en contact avec des milieux gazeux, p. ex. extraction
  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12N 15/81 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes eucaryotes pour champignons pour levures

80.

3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase variants and methods of use

      
Numéro d'application 17812636
Numéro de brevet 12203102
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-07-14
Date de la première publication 2023-05-04
Date d'octroi 2025-01-21
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Hoff, Kevin
  • Tracewell, Cara Ann
  • Chan, Kui
  • Kuchinskas, Michael
  • Nagarajan, Harish

Abrégé

The present disclosure provides thiolases and polypeptide variants of 3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase, nucleic acids encoding the same, vectors comprising the nucleic acids, and cells comprising the polypeptide variants and/or thiolase, the nucleic acids, and/or the vectors. The present disclosure also provides methods of making and using the same, including methods for culturing cells, and for the production of various products, including 3-hydroxybutyryl-CoA (3-HB-CoA), 3-hydroxybutyraldehyde (3-HBal), 3-hydroxybutyrate (3-HB), 1,3-butanediol (1,3-BDO), and esters and amides thereof, and products made from any of these.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12P 7/52 - Acide propioniqueAcides butyriques
  • C12P 19/32 - Nucléotides avec un système cyclique condensé, contenant un cycle à six chaînons, comportant deux atomes d'azote dans le même cycle, p. ex. nucléotides puriques, dinucléotide de la nicotinamide-adénine

81.

MICROORGANISMS AND METHODS FOR ENHANCING THE AVAILABILITY OF REDUCING EQUIVALENTS IN THE PRESENCE OF METHANOL, AND FOR PRODUCING 3-HYDROXYISOBUTYRATE OR METHACRYLIC ACID RELATED THERETO

      
Numéro d'application 17833695
Statut En instance
Date de dépôt 2022-06-06
Date de la première publication 2023-05-04
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Burgard, Anthony P.
  • Osterhout, Robin E.
  • Van Dien, Stephen J.
  • Tracewell, Cara Ann
  • Pharkya, Priti
  • Andrae, Stefan

Abrégé

Provided herein is a non-naturally occurring microbial organism having a methanol metabolic pathway that can enhance the availability of reducing equivalents in the presence of methanol. Such reducing equivalents can be used to increase the product yield of organic compounds produced by the microbial organism, such as 3-hydroxyisobutyrate or MAA. Also provided herein are methods for using such an organism to produce 3-hydroxyisobutyrate or MAA.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques
  • C08F 120/06 - Acide acryliqueAcide méthacryliqueLeurs sels métalliques ou leurs sels d'ammonium
  • C08G 63/664 - Polyesters contenant de l'oxygène sous forme de groupes éther dérivés d'acides hydroxycarboxyliques
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12P 7/40 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carboxyle
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/06 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des composés contenant de l'azote comme donneurs (1.4, 1.5, 1.7)
  • C12N 9/10 - Transférases (2.)
  • C12P 7/62 - Esters d’acides carboxyliques

82.

NON-NATURAL MICROBIAL ORGANISMS WITH IMPROVED ENERGETIC EFFICIENCY

      
Numéro d'application 17843589
Statut En instance
Date de dépôt 2022-06-17
Date de la première publication 2023-04-27
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Pharkya, Priti
  • Burgard, Anthony P.
  • Nunez Van Name, Eric Roland

Abrégé

The invention provides non-natural microbial organisms containing enzymatic pathways and/or metabolic modifications for enhancing carbon flux through acetyl-CoA, or oxaloacetate and acetyl-CoA. Embodiments of the invention include microbial organisms having a pathway to acetyl-CoA and oxaloacetate that includes phosphoketolase (a PK pathway). The organisms also have either (i) a genetic modification that enhances the activity of the non-phosphotransferase system (non-PTS) for sugar uptake, and/or (ii) a genetic modification(s) to the organism's electron transport chain (ETC) that enhances efficiency of ATP production, that enhances availability of reducing equivalents or both. The microbial organisms can optionally include (iii) a genetic modification that maintains, attenuates, or eliminates the activity of a phosphotransferase system (PTS) for sugar uptake. The enhanced carbon flux through acetyl-CoA and oxaloacetate can be used for production of a bioderived compound, and the microbial organisms can further include a pathway capable of producing the bioderived compound.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12N 9/88 - Lyases (4.)
  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)
  • C12P 5/02 - Préparation des hydrocarbures acycliques
  • C12P 7/04 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle acycliques
  • C12P 7/40 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carboxyle

83.

ALDEHYDE DEHYDROGENASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application US2022078308
Numéro de publication 2023/069952
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-10-18
Date de publication 2023-04-27
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Shah, Amit, Mahendra
  • Colquitt, Justin, Robert
  • Warner, Joseph, Roy
  • Zhang, Deqiang

Abrégé

The disclosure provides polypeptides and encoding nucleic acids of engineered aldehyde dehydrogenases. The disclosure also provides cells expressing an engineered form of the aldehyde dehydrogenase. The disclosure further provides methods for producing a bioderived compound, such as 3 -hydroxybutyraldehyde, 1,3 -butanediol, 4- hydroxybutyraldehyde, 1,4-butanediol, comprising culturing cells expressing an engineered aldehyde dehydrogenase.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12P 7/24 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carbonyle
  • C12N 15/63 - Introduction de matériel génétique étranger utilisant des vecteursVecteurs Utilisation d'hôtes pour ceux-ciRégulation de l'expression
  • C12N 15/90 - Introduction stable d'ADN étranger dans le chromosome

84.

ALDEHYDE DEHYDROGENASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application US2022078315
Numéro de publication 2023/069957
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-10-18
Date de publication 2023-04-27
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Shah, Amit Mahendra
  • Colquitt, Justin Robert
  • Warner, Joseph Roy
  • Schmidt, Nathan
  • Praveschotinunt, Pichet

Abrégé

The disclosure provides polypeptides and encoding nucleic acids of engineered aldehyde dehydrogenases. The disclosure also provides cells expressing an engineered form of the aldehyde dehydrogenase. The disclosure further provides methods for producing a bioderived compound, such as 3-hydroxybutyraldehyde, 1,3-butanediol, 4-hydroxybutyraldehyde, 1,4-butanediol, comprising culturing cells expressing an engineered aldehyde dehydrogenase.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes

85.

METHOD FOR THE PROCESSING AND TRANSPORT OF HEXANE-1,6-DIAMINE OR PENTANE-1,5-DIAMINE

      
Numéro d'application EP2022075928
Numéro de publication 2023/041768
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-09-19
Date de publication 2023-03-23
Propriétaire
  • COVESTRO DEUTSCHLAND AG (Allemagne)
  • GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s) Merkel, Michael

Abrégé

The invention relates to a method for the processing and transport of hexane-1,6-diamine or pentane-1,5-diamine comprising the steps of: a) Providing a first composition including 60 to 98 wt.-% water and 2 to 40 wt.-% hexane-1,6-diamine or pentane-1,5-diamine, b) partially removing water from the first composition by distillation at a first production location, whereby a second composition is generated, said second composition including the hexane-1,6-diamine or pentane-1,5-diamine and 1 wt.-% to 35 wt.-% water, and c) transporting said second composition during a span of time t from the first production location to a second production location, wherein the span of time t including times for optional temporary storage is at least 6 h.

Classes IPC  ?

  • C07C 209/84 - Purification
  • C07C 211/12 - Diamino-1,6 hexanes
  • C07C 211/09 - Diamines
  • C07C 263/10 - Préparation de dérivés d'acide isocyanique par réaction d'amines avec des halogénures de carbonyle, p. ex. avec du phosgène
  • C07C 265/14 - Dérivés d'acide isocyanique contenant au moins deux groupes isocyanate liés au même squelette carboné
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C08G 18/00 - Polymérisats d'isocyanates ou d'isothiocyanates

86.

OBTAINING ALIPHATIC AMINES FROM COMPOSITIONS

      
Numéro d'application EP2022075929
Numéro de publication 2023/041769
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-09-19
Date de publication 2023-03-23
Propriétaire
  • COVESTRO DEUTSCHLAND AG (Allemagne)
  • GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Merkel, Michael
  • Leimbrink, Mathias
  • Steffens, Friedhelm

Abrégé

The invention relates to a method for obtaining an amine from a composition by means of distillation and a composition obtainable by that method. The invention also relates to a method for the production of an isocyanate from the composition obtainable.

Classes IPC  ?

  • C07C 209/84 - Purification
  • C07C 211/09 - Diamines
  • C07C 263/10 - Préparation de dérivés d'acide isocyanique par réaction d'amines avec des halogénures de carbonyle, p. ex. avec du phosgène
  • C07C 265/14 - Dérivés d'acide isocyanique contenant au moins deux groupes isocyanate liés au même squelette carboné

87.

METHOD FOR THE REMOVAL OF WATER FROM AND TRANSPORT OF ALIPHATIC DIAMINES

      
Numéro d'application EP2022075933
Numéro de publication 2023/041771
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-09-19
Date de publication 2023-03-23
Propriétaire
  • COVESTRO DEUTSCHLAND AG (Allemagne)
  • GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Merkel, Michael
  • Leimbrink, Mathias
  • Steffens, Friedhelm

Abrégé

22 groups per molecule, each of them bound to a primary or secondary carbon atom, b) removing water at least partially from said first composition by distillation at a first production location in a distillation apparatus comprising at least two distillation columns operating at different head pressures, thus generating a second composition comprising the diamine and ≤ 55 wt.-% water, wherein the vapours emerging from the distillation column operating at the higher head pressure are used to evaporate the liquid in the bottoms and/or the feed of a distillation column operating at the lower head pressure at least partially, c) transporting said second composition during a span of time t from the first production location to a second production location, wherein the span of time t including times for optional temporary storage is at least 6 h.

Classes IPC  ?

  • C07C 209/84 - Purification
  • C07C 263/10 - Préparation de dérivés d'acide isocyanique par réaction d'amines avec des halogénures de carbonyle, p. ex. avec du phosgène
  • C07C 211/09 - Diamines
  • C07C 211/12 - Diamino-1,6 hexanes
  • C07C 211/36 - Composés contenant des groupes amino liés à un squelette carboné ayant des groupes amino liés à des atomes de carbone de cycles autres que des cycles aromatiques à six chaînons d'un squelette carboné saturé contenant au moins deux groupes amino liés au squelette carboné
  • C07C 211/27 - Composés contenant des groupes amino liés à un squelette carboné ayant des groupes amino liés à des atomes de carbone acycliques d'un squelette carboné non saturé contenant au moins un cycle aromatique à six chaînons ayant des groupes amino reliés au cycle aromatique à six chaînons par l'intermédiaire de chaînes carbonées saturées
  • C07C 211/18 - Composés contenant des groupes amino liés à un squelette carboné ayant des groupes amino liés à des atomes de carbone acycliques d'un squelette carboné saturé contenant des cycles autres que des cycles aromatiques à six chaînons contenant au moins deux groupes amino liés au squelette carboné
  • C07C 265/14 - Dérivés d'acide isocyanique contenant au moins deux groupes isocyanate liés au même squelette carboné
  • C08G 69/26 - Polyamides dérivés, soit des acides amino-carboxyliques, soit de polyamines et d'acides polycarboxyliques dérivés de polyamines et d'acides polycarboxyliques

88.

FLAVIN-DEPENDENT OXIDASES HAVING CANNABINOID SYNTHASE ACTIVITY

      
Numéro d'application US2022075759
Numéro de publication 2023/034862
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-08-31
Date de publication 2023-03-09
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Huddleston, Jamison Parker
  • Schirmer, Andreas
  • Purdy, Trevor Nelson

Abrégé

The disclosure relates to a non-natural flavin-dependent oxidase comprising at least one amino acid variation as compared to a wild type flavin-dependent oxidase, wherein the non-natural flavin-dependent oxidase does not comprise a disulfide bond, and wherein the non-natural flavin-dependent oxidase is capable of oxidative cyclization of a prenylated aromatic compound into a cannabinoid. The disclosure also relates to a nucleic acid, an expression construct, and an engineered cell for making the non-natural flavin-dependent oxidase. Also provided are compositions comprising the non-natural flavin-dependent oxidase; isolated non-natural flavin-dependent oxidase and methods of making the same; cell extracts comprising the non-natural flavin-dependent oxidase; methods of making cannabinoids; and compositions comprising a cannabinoid and/or the non-natural flavin-dependent oxidase.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12N 15/74 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes procaryotes autres que E. coli, p. ex. Lactobacillus, Micromonospora

89.

FLAVIN-DEPENDENT OXIDASES HAVING CANNABINOID SYNTHASE ACTIVITY

      
Numéro de document 03230234
Statut En instance
Date de dépôt 2022-08-31
Date de disponibilité au public 2023-03-09
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Huddleston, Jamison Parker
  • Schirmer, Andreas
  • Purdy, Trevor Nelson

Abrégé

The disclosure relates to a non-natural flavin-dependent oxidase comprising at least one amino acid variation as compared to a wild type flavin-dependent oxidase, wherein the non-natural flavin-dependent oxidase does not comprise a disulfide bond, and wherein the non-natural flavin-dependent oxidase is capable of oxidative cyclization of a prenylated aromatic compound into a cannabinoid. The disclosure also relates to a nucleic acid, an expression construct, and an engineered cell for making the non-natural flavin-dependent oxidase. Also provided are compositions comprising the non-natural flavin-dependent oxidase; isolated non-natural flavin-dependent oxidase and methods of making the same; cell extracts comprising the non-natural flavin-dependent oxidase; methods of making cannabinoids; and compositions comprising a cannabinoid and/or the non-natural flavin-dependent oxidase.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
  • C12N 15/74 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés aux hôtes procaryotes autres que E. coli, p. ex. Lactobacillus, Micromonospora

90.

FORMATE DEHYDROGENASE VARIANTS AND METHODS OF USE

      
Numéro d'application US2022075588
Numéro de publication 2023/034745
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-08-29
Date de publication 2023-03-09
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Shah, Amit Mahendra
  • Colquitt, Justin Robert
  • Napolitano, Michael Gregory
  • Schmidt, Nathan
  • Praveschotinunt, Pichet
  • Warner, Joseph Roy

Abrégé

The disclosure provides polypeptides and encoding nucleic acids of engineered formate dehydrogenases. The disclosure also provides cells expressing an engineered formate dehydrogenase. The disclosure further provides methods for producing a bioderived compound comprising culturing cells expressing an engineered formate dehydrogenase. Where the engineered formate dehydrogenase is capable of catalyzing a conversion.

Classes IPC  ?

  • C12N 9/00 - Enzymes, p. ex. ligases (6.)ProenzymesCompositions les contenantProcédés pour préparer, activer, inhiber, séparer ou purifier des enzymes
  • C12Q 1/26 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir une oxydoréductase

91.

Miscellaneous Design

      
Numéro d'application 1713982
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2022-11-16
Date d'enregistrement 2022-11-16
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Classes de Nice  ?
  • 01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture
  • 17 - Produits en caoutchouc ou en matières plastiques; matières à calfeutrer et à isoler
  • 18 - Cuir et imitations du cuir
  • 22 - Cordes; filets; tentes, auvents, voiles et sacs; matières de rembourrage
  • 23 - Fils à usage textile
  • 24 - Tissus et produits textiles
  • 25 - Vêtements; chaussures; chapellerie

Produits et services

Polymer compositions used in the manufacture of commercial, industrial and domestic goods; polymer precursors used in the manufacture of commercial, industrial and domestic goods; polymers, biopolymers, polymeric additives and biopolymeric additives for use in the manufacture of industrial products and consumer and household products; chemicals for use in industry; chemicals used in the manufacture of fabric or textiles; and polyamide. Resins in bars, blocks, pellets, rods, sheets and tubes for general industrial use; resins in extruded form for general industrial use; and semi-processed synthetic resins. Bio-nylon sold as a component of tote bags, all-purpose sports bags, all-purpose carrying bags, carry-on bags, weekend bags, sack packs, namely, drawstring bags used as backpacks, beach bags, toiletry bags sold empty, cosmetic bags sold empty, shopping bags, wheeled shopping bags, reusable shopping bags, sling bags for carrying infants, knitted bags not of precious metals, travel bags, school book bags, duffle bags, wheeled duffle bags, messenger bags, diaper bags, gym bags, purses, handbags, cross-body bags, drawstring bags, shoulder bags, waist bags, wristlet bags, backpacks, rucksacks, wallets, not of precious metal, briefcases, attaché cases, clutch bags, hip bags, umbrellas, credit card cases, business card cases, key cases, pocket wallets, haversacks, suitcases, daypacks, suit bags, garment bags for travel, and luggage. Textile fibers; yarn fibers; synthetic fibers for textile use; raw textile fibers; woven fibers of bio-nylon for textile use; non-woven polymeric fibers for conversion into a variety of industrial and consumer goods, namely, non-woven polymeric fibers for textile use and industrial use; woven polymeric fibers for conversion into a variety of industrial and consumer goods, namely woven polymeric fibers for textile use and industrial use; and synthetic fibers and filaments for use in the manufacture of fabrics, textiles, yarns, and carpets. Thread; yarn; synthetic thread; synthetic yarn; thread for textile use; yarn for textile use; synthetic fiber thread and yarn; and yarn and thread for textile purposes. Bio-nylon fabric for use as a textile in the manufacture of clothing; textile fabrics for use in the manufacture of garments, bags, jackets, gloves, and apparel; fabrics made of bio-nylon for textile use; fabrics for textile use. Bio-nylon sold as a component of clothing, headwear, footwear and outerwear for men, women and children, namely, shirts, t-shirts, sweat shirts, sweat pants, dresses, eveningwear, blouses, neckties, sweaters, cardigans, jerseys, overalls, suits, skirts, shorts, trousers, pants, yoga pants, jeans, bodysuits, leggings, leotards, tights, hosiery, swimwear, bathing trunks, bathing suits, pajamas, nightwear, robes, bras, underwear, panties, girdles, thermal underwear, socks, base layer tops and bottoms, coats, raincoats, jackets, vests, shawls, gloves, slippers, shoes, sneakers, athletic footwear, overshoes, sandals, boots, hats and caps being headwear, headbands being clothing, suspenders, scarves, knee warmers, neck tubes, hand warmers, gaiters, and clothing belts; and finished textile linings for garments.

92.

ENGINEERED CELLS FOR PRODUCTION OF CANNABINOIDS AND OTHER MALONYL-CoA-DERIVED PRODUCTS

      
Numéro d'application 17780421
Statut En instance
Date de dépôt 2020-11-25
Date de la première publication 2023-02-02
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Li, Jingyi
  • Dewals, Pierre
  • Schirmer, Andreas
  • Ghatak, Sankha
  • Georgianna, David Ryan

Abrégé

The invention relates to engineered microorganisms (e.g., E. coli) and associated improvements for increasing the production cannabinoids (e.g. CBGA) or precursors or derivatives thereof.

Classes IPC  ?

  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques
  • C12P 19/32 - Nucléotides avec un système cyclique condensé, contenant un cycle à six chaînons, comportant deux atomes d'azote dans le même cycle, p. ex. nucléotides puriques, dinucléotide de la nicotinamide-adénine
  • C12P 7/06 - Éthanol en tant que produit chimique et non en tant que boisson alcoolique

93.

Microorganisms and methods for the biosynthesis of adipate, hexamethylenediamine and 6-aminocaproic acid

      
Numéro d'application 17527902
Numéro de brevet 11834690
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2021-11-16
Date de la première publication 2023-01-26
Date d'octroi 2023-12-05
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Burk, Mark J.
  • Burgard, Anthony P.
  • Osterhout, Robin E.
  • Pharkya, Priti

Abrégé

The invention provides a non-naturally occurring microbial organism having a 6-aminocaproic acid, caprolactam, hexametheylenediamine or levulinic acid pathway. The microbial organism contains at least one exogenous nucleic acid encoding an enzyme in the respective 6-aminocaproic acid, caprolactam, hexametheylenediamine or levulinic acid pathway. The invention additionally provides a method for producing 6-aminocaproic acid, caprolactam, hexametheylenediamine or levulinic acid. The method can include culturing a 6-aminocaproic acid, caprolactam or hexametheylenediamine producing microbial organism, where the microbial organism expresses at least one exogenous nucleic acid encoding a 6-aminocaproic acid, caprolactam, hexametheylenediamine or levulinic acid pathway enzyme in a sufficient amount to produce the respective product, under conditions and for a sufficient period of time to produce 6-aminocaproic acid, caprolactam, hexametheylenediamine or levulinic acid.

Classes IPC  ?

  • C12P 17/10 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle
  • C12N 1/38 - Stimulation chimique de la croissance ou de l'activité par addition de composés chimiques qui ne sont pas des facteurs essentiels de croissanceStimulation de la croissance par élimination d'un composé chimique
  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 7/40 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe carboxyle
  • C12P 7/44 - Acides polycarboxyliques
  • C12P 13/00 - Préparation de composés organiques contenant de l'azote
  • C12P 13/02 - Amides, p. ex. chloramphénicol
  • C12P 17/12 - Préparation de composés hétérocycliques comportant O, N, S, Se ou Te comme uniques hétéro-atomes du cycle l'azote comme unique hétéro-atome du cycle contenant un hétérocycle à six chaînons

94.

THE SUSTAINABLE SOURCE

      
Numéro d'application 1706650
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2022-11-23
Date d'enregistrement 2022-11-23
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Classes de Nice  ?
  • 01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture
  • 40 - Traitement de matériaux; recyclage, purification de l'air et traitement de l'eau
  • 42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception

Produits et services

Chemicals for use in the manufacture of cosmetics, nutraceuticals, plastics, polymers, solvents, rubber, fiber-based products, fabrics, textiles, apparel, automotive parts, electronics, agricultural products, cleaning products, perfumes, lubricants, fuels, home care products, personal and beauty care products, and dietary and nutritional supplements and beverages; polymer precursors and polymer compositions used in the manufacture of commercial, industrial and domestic goods; chemicals for use in industry. Providing technical information in the field of chemical manufacturing; biomanufacturing, namely, manufacturing of chemicals and bio-nylon using biological organisms in the manufacturing process. Scientific research and engineering in the fields of chemicals, organisms, and bioprocesses; consulting services in the field of design and development of bioengineering processes; consulting services in the fields of bioengineering and biotechnology; research and development in the fields of bioengineering and biotechnology; product development consultation about products derived from plants or other renewable or maintainable resources; research and development in the field of bio-based chemicals and plant-derived products.

95.

géno.

      
Numéro d'application 1706652
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2022-11-23
Date d'enregistrement 2022-11-23
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Classes de Nice  ?
  • 01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture
  • 40 - Traitement de matériaux; recyclage, purification de l'air et traitement de l'eau
  • 42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception

Produits et services

Chemicals for use in the manufacture of cosmetics, nutraceuticals, plastics, polymers, solvents, rubber, fiber-based products, fabrics, textiles, apparel, automotive parts, electronics, agricultural products, cleaning products, perfumes, lubricants, fuels, home care products, personal and beauty care products, and dietary and nutritional supplements and beverages; polymer precursors and polymer compositions used in the manufacture of commercial, industrial and domestic goods; chemicals for use in industry. Providing technical information in the field of chemical manufacturing; biomanufacturing, namely, manufacturing of chemicals and bio-nylon using biological organisms in the manufacturing process. Scientific research and engineering in the fields of chemicals, organisms, and bioprocesses; consulting services in the field of design and development of bioengineering processes; consulting services in the fields of bioengineering and biotechnology; research and development in the fields of bioengineering and biotechnology; product development consultation about products derived from plants or other renewable or sustainable resources; research and development in the field of bio-based chemicals and plant-derived products.

96.

GENO

      
Numéro d'application 1706653
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2022-11-23
Date d'enregistrement 2022-11-23
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Classes de Nice  ?
  • 01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture
  • 40 - Traitement de matériaux; recyclage, purification de l'air et traitement de l'eau
  • 42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception

Produits et services

Chemicals for use in the manufacture of cosmetics, nutraceuticals, plastics, polymers, solvents, rubber, fiber-based products, fabrics, textiles, apparel, automotive parts, electronics, agricultural products, cleaning products, perfumes, lubricants, fuels, home care products, personal and beauty care products, and dietary and nutritional supplements and beverages; polymer precursors and polymer compositions used in the manufacture of commercial, industrial and domestic goods; chemicals for use in industry. Providing technical information in the field of chemical manufacturing; biomanufacturing, namely, manufacturing of chemicals and bio-nylon using biological organisms in the manufacturing process. Scientific research and engineering in the fields of chemicals, organisms, and bioprocesses; consulting services in the field of design and development of bioengineering processes; consulting services in the fields of bioengineering and biotechnology; research and development in the fields of bioengineering and biotechnology; product development consultation about products derived from plants or other renewable or sustainable resources; research and development in the field of bio-based chemicals and plant-derived products.

97.

BRONTIDE SKY

      
Numéro d'application 1704560
Statut Enregistrée
Date de dépôt 2022-11-23
Date d'enregistrement 2022-11-23
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Classes de Nice  ? 01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture

Produits et services

Chemicals for use in the manufacture of cosmetics, nutraceuticals, plastics, polymers, solvents, rubber, fiber-based products, apparel, automotive parts and electronics; industrial solvents; polymer precursors used in the manufacture of commercial, industrial and domestic goods.

98.

Microorganisms and methods for increasing co-factors

      
Numéro d'application 17770233
Numéro de brevet 12577591
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2020-10-22
Date de la première publication 2022-12-22
Date d'octroi 2026-03-17
Propriétaire Genomatica, Inc. (USA)
Inventeur(s)
  • Nagarajan, Harish
  • Scalcinati, Gionata
  • Yang, Tae Hoon

Abrégé

The present disclosure provides microbial organisms having increased availability of co-factors, such as NADPH, for increasing production of various products, including 1,3-BDO, MMA, (3R)-hydroxybutyl (3R)-hydroxybutyrate, amino acids, 3HB-CoA, adipate, caprolactam, 6-ACA, HMD A, or MAA, and products made from any of these. Also provided are one or more exogenous nucleic acids encoding an enzyme expressed in a sufficient amount to increase availability of NADPH, where the exogenous nucleic acid includes one or more of ATP-NADH kinase, pntAB, nadK, and gapN. Also provided are one or more gene attenuations occurring in genes, such as NDH-2, that result in an increased ratio of NADPH to NADH. Various combinations of the exogenous nucleic acids and gene deletions are also provided in the present disclosure. The present disclosure also provides methods of making and using the same, including methods for culturing cells, and for the production of the various products.

Classes IPC  ?

  • C12P 7/18 - Polyols
  • C12N 9/02 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase
  • C12N 9/04 - Oxydoréductases (1.), p. ex. luciférase agissant sur des groupes CHOH comme donneurs, p. ex. oxydase de glucose, déshydrogénase lactique (1.1)
  • C12N 9/12 - Transférases (2.) transférant des groupes contenant du phosphore, p. ex. kinases (2.7)

99.

1,3-BUTYLENE GLYCOL COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF

      
Numéro d'application US2022033061
Numéro de publication 2022/265935
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-06-10
Date de publication 2022-12-22
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s) Huston, Kyle

Abrégé

The disclosure provides embodiments directed to a composition comprising a 1,3 -butylene glycol (1,3-BG; such as but not limited to, bioBG) and one or more fragrance ingredients, which form a fragrance component of the composition. 1,3-BG demonstrates exemplary qualities and characteristics of being natural, sustainable, and substantially non-odorous, for use in fragrance compositions. Methods of using or applying such 1,3-BG fragrance compositions provide a cost- efficient, sustainable composition, since 1,3-BG does not mask or alter the fragrance notes of the fragrance ingredients allowing for the use of smaller quantities of fragrance ingredients. The 1,3-BG fragrance compositions of the disclosure also improve fragrance performance and reduces greenhouse gases, while avoiding any irritation, sensitization, or allergic reaction in humans.

Classes IPC  ?

  • A61Q 13/00 - Formulations ou additifs pour les préparations de parfums
  • A61K 8/00 - Cosmétiques ou préparations similaires pour la toilette
  • A61K 8/34 - Alcools
  • A61K 8/02 - Cosmétiques ou préparations similaires pour la toilette caractérisés par une forme physique particulière
  • A61K 8/18 - Cosmétiques ou préparations similaires pour la toilette caractérisés par la composition

100.

NOVEL OLIVETOL SYNTHASES FOR CANNABINOID PRODUCTION

      
Numéro d'application US2022031361
Numéro de publication 2022/251648
Statut Délivré - en vigueur
Date de dépôt 2022-05-27
Date de publication 2022-12-01
Propriétaire GENOMATICA, INC. (USA)
Inventeur(s)
  • Schirmer, Andreas W.
  • Noble, Michael Angus
  • Huddleston, Jamison Parker

Abrégé

The present disclosure provides a polynucleotide comprising: (a) a nucleic acid sequence encoding an olivetol synthase (OLS); and (b) a heterologous regulatory element operably linked to the nucleic acid sequence. The present disclosure further relates to an engineered cell comprising an olivetol synthase (OLS). Also provided are a cell extract or cell culture medium or a composition comprising 3,5,7- trioxododecanoyl-CoA, olivetol, olivetolic acid, a cannabinoid, and/or an isomer, analog, or derivative thereof, and a method of making 3,5,7-trioxododecanoyl-CoA, olivetol, olivetolic acid, a cannabinoid, and/or an isomer, analog, or derivative thereof. Also provided is a cannabinoid produced by the engineered cell, isolated from the cell extract or cell culture medium, and/or made by the method described herein. The present disclosure also provides a non-natural olivetol synthase (OLS).

Classes IPC  ?

  • C12N 15/52 - Gènes codant pour des enzymes ou des proenzymes
  • C12P 7/42 - Acides hydroxycarboxyliques
  • C12P 7/22 - Préparation de composés organiques contenant de l'oxygène contenant un groupe hydroxyle aromatiques
  • C12N 15/70 - Vecteurs ou systèmes d'expression spécialement adaptés à E. coli
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