Systems, methods, and computer program products for analyzing a sample volume (18). One or more holographs (32) of the sample volume (18) are generated. Each holograph (32) includes a plurality of pixels, and each pixel has an intensity. Information is extracted from the holographs (32) by analyzing the pixels to determine a property of the sample volume (18) without first reconstructing photographs (62) from the holograph (32). Methods of extracting the information include determining a dispersion factor for the intensity of pixels, and extracting holographic features (34) from the plurality of pixels that belong to a class of shapes including one or more diffraction patterns (26).
G01N 15/14 - Techniques de recherche optique, p. ex. cytométrie en flux
G01N 21/17 - Systèmes dans lesquels la lumière incidente est modifiée suivant les propriétés du matériau examiné
G01N 21/45 - RéfringencePropriétés liées à la phase, p. ex. longueur du chemin optique en utilisant des méthodes interférométriquesRéfringencePropriétés liées à la phase, p. ex. longueur du chemin optique en utilisant les méthodes de Schlieren
G03H 1/04 - Procédés ou appareils pour produire des hologrammes
G06V 10/42 - Extraction de caractéristiques globales par l’analyse du motif entier, p. ex. utilisant des transformations dans le domaine de fréquence ou d’autocorrélation
G06V 10/764 - Dispositions pour la reconnaissance ou la compréhension d’images ou de vidéos utilisant la reconnaissance de formes ou l’apprentissage automatique utilisant la classification, p. ex. des objets vidéo
G03H 1/00 - Procédés ou appareils holographiques utilisant la lumière, les infrarouges ou les ultraviolets pour obtenir des hologrammes ou pour en obtenir une imageLeurs détails spécifiques
G01N 15/10 - Recherche de particules individuelles
05 - Produits pharmaceutiques, vétérinaires et hygièniques
09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques
10 - Appareils et instruments médicaux
Produits et services
Diagnostic test kit consisting primarily of medical diagnostic reagents, chemicals, antimicrobial agents, and containers for detecting microorganisms and determining antimicrobial susceptibility of the microorganisms in a patient sample Scientific instruments, namely, portable and benchtop imagers and analyzers that use light scattering, microscopy, and image analysis software to detect, quantify, and bind biological or chemical molecules Medical diagnostic apparatus for testing bacterial and fungal resistance to antimicrobials
3.
LENS-FREE HOLOGRAPHIC OPTICAL SYSTEM FOR HIGH SENSITIVITY LABEL-FREE CELL AND MICROBIAL GROWTH DETECTION AND QUANTIFICATION
Disclosed are optical interrogation apparatus that can produce lens-free images using an optoelectronic sensor array to generate a holographic image of sample objects, such as microorganisms in a sample. Also disclosed are methods of detecting and/or identifying microorganisms in a biological sample, such as microorganisms present in low levels. Also disclosed are methods of using systems to detect microorganisms in a biological sample, such as microorganisms present in low levels. In addition or as an alternative, the methods of using systems may identify microorganisms present in a sample and/or determine antimicrobial susceptibility of such microorganisms.
G03H 1/04 - Procédés ou appareils pour produire des hologrammes
G03H 1/26 - Procédés ou appareils adaptés spécialement pour produire des hologrammes multiples ou pour en obtenir des images, p. ex. procédés pour l'holographie à plusieurs couleurs
G01B 9/021 - Interféromètres utilisant des techniques holographiques
G01N 21/45 - RéfringencePropriétés liées à la phase, p. ex. longueur du chemin optique en utilisant des méthodes interférométriquesRéfringencePropriétés liées à la phase, p. ex. longueur du chemin optique en utilisant les méthodes de Schlieren
G01N 33/48 - Matériau biologique, p. ex. sang, urineHémocytomètres
C12Q 1/04 - Détermination de la présence ou du type de micro-organismeEmploi de milieux sélectifs pour tester des antibiotiques ou des bactéricidesCompositions à cet effet contenant un indicateur chimique
C12Q 1/18 - Test de l'activité antimicrobienne d'un matériau
4.
LENS-FREE HOLOGRAPHIC OPTICAL SYSTEM FOR HIGH SENSITIVITY LABEL-FREE CELL AND MICROBIAL GROWTH DETECTION AND QUANTIFICATION FOR SCREENING, IDENTIFICATION, AND SUSCEPTIBILITY TESTING
Disclosed are optical interrogation apparatus that can produce lens-free images using an optoelectronic sensor array to generate a holographic image of sample objects, such as microorganisms in a sample. Also disclosed are methods of detecting and/or identifying microorganisms in a biological sample, such as microorganisms present in low levels. Also disclosed are methods of using systems to detect microorganisms in a biological sample, such as microorganisms present in low levels. In addition or as an alternative, the methods of using systems may identify microorganisms present in a sample and/or determine antimicrobial susceptibility of such microorganisms.
A system for automated microorganism identification and antibiotic susceptibility testing comprising a reagent cartridge, a reagent stage, a cassette, a cassette, stage, a pipettor assembly, an optical detection system, and a controller is disclosed. The system is designed to dynamically adjust motor idle torque to control heat load and employs a fast focus process for determining the true focus position of an individual microorganism. The system also may quantify the relative abundance of viable microorganisms in a sample using dynamic dilution, and facilitate growth of microorganisms in customized media for rapid, accurate antimicrobial susceptibility testing.
C12Q 1/02 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des micro-organismes viables
G02B 7/28 - Systèmes pour la génération automatique de signaux de mise au point
G01N 15/06 - Recherche de la concentration des suspensions de particules
B01L 3/00 - Récipients ou ustensiles pour laboratoires, p. ex. verrerie de laboratoireCompte-gouttes
C12Q 1/04 - Détermination de la présence ou du type de micro-organismeEmploi de milieux sélectifs pour tester des antibiotiques ou des bactéricidesCompositions à cet effet contenant un indicateur chimique
G01N 1/38 - Dilution, dispersion ou mélange des échantillons
G01N 35/02 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet en utilisant une série de récipients à échantillons déplacés par un transporteur passant devant un ou plusieurs postes de traitement ou d'analyse
G01N 35/10 - Dispositifs pour transférer les échantillons vers, dans ou à partir de l'appareil d'analyse, p. ex. dispositifs d'aspiration, dispositifs d'injection
41 - Éducation, divertissements, activités sportives et culturelles
Produits et services
Printed publications, namely, brochures, hand-outs and
pamphlets in the field of infectious disease diagnostics. Publication of online newsletters and bulletins in the field
of infectious disease diagnostics.
41 - Éducation, divertissements, activités sportives et culturelles
Produits et services
Printed publications, namely, brochures, hand-outs and
pamphlets in the field of infectious disease diagnostics. Publication of online newsletters and bulletins in the field
of infectious disease diagnostics.
8.
LENS-FREE HOLOGRAPHIC OPTICAL SYSTEM FOR HIGH SENSITIVITY LABEL-FREE MICROBIAL GROWTH DETECTION AND QUANTIFICATION FOR SCREENING, IDENTIFICATION, AND SUSCEPTIBILITY TESTING
Disclosed are optical interrogation apparatus that can produce lens-free images using an optoelectronic sensor array to generate a holographic image of sample objects, such as microorganisms in a sample, and at least one deeply supervised convolutional neural network. Also disclosed are methods of detecting and/or identifying microorganisms in a biological sample, such as microorganisms present in low levels. Also disclosed are methods of using systems to detect microorganisms in a biological sample, such as microorganisms present in low levels. In addition or as an alternative, the methods of using systems may identify microorganisms present in a sample and/or determine antimicrobial susceptibility of such microorganisms.
05 - Produits pharmaceutiques, vétérinaires et hygièniques
Produits et services
Diagnostic test kit for detecting microorganisms and
determining antimicrobial susceptibility of the
microorganisms, consisting primarily of chemicals, reagents,
and containers, including nucleic acid probes and
antimicrobial agents.
01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture
09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques
42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception
Produits et services
Chemical compositions for use in detecting, quantifying
and/or binding biological and chemical molecules. Scientific instruments, namely, portable and benchtop
imagers and analyzers that use light scattering, microscopy,
and image analysis software to detect, quantify, and bind
biological or chemical molecules. Consulting services in the field of biosciences.
01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture
09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques
42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception
Produits et services
Chemical compositions for use in detecting, quantifying
and/or binding biological and chemical molecules. Scientific instruments, namely, portable and benchtop
imagers and analyzers that use light scattering, microscopy,
and image analysis software to detect, quantify, and bind
biological or chemical molecules. Consulting services in the field of biosciences.
01 - Produits chimiques destinés à l'industrie, aux sciences ainsi qu'à l'agriculture
09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques
42 - Services scientifiques, technologiques et industriels, recherche et conception
Produits et services
Chemical compositions for use in detecting, quantifying
and/or binding biological and chemical molecules. Scientific instruments, namely, portable and benchtop
imagers and analyzers that use light scattering, microscopy,
and image analysis software to detect, quantify, and bind
biological or chemical molecules. Consulting services in the field of biosciences.
09 - Appareils et instruments scientifiques et électriques
Produits et services
Scientific instruments, namely, portable and benchtop
imagers and analyzers that use light scattering, microscopy,
and image analysis software to detect, quantify, and bind
biological or chemical molecules.
16.
INSTRUMENT AND SYSTEM FOR RAPID MICROORGANISM IDENTIFICATION AND ANTIMICROBIAL AGENT SUSCEPTIBILITY TESTING
A system for automated microorganism identification and antibiotic susceptibility testing comprising a reagent cartridge, a reagent stage, a cassette, a cassette, stage, a pipettor assembly, an optical detection system, and a controller is disclosed. The system is designed to dynamically adjust motor idle torque to control heat load and employs a fast focus process for determining the true focus position of an individual microorganism. The system also may quantify the relative abundance of viable microorganisms in a sample using dynamic dilution, and facilitate growth of microorganisms in customized media for rapid, accurate antimicrobial susceptibility testing.
G01N 35/02 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet en utilisant une série de récipients à échantillons déplacés par un transporteur passant devant un ou plusieurs postes de traitement ou d'analyse
B01L 3/00 - Récipients ou ustensiles pour laboratoires, p. ex. verrerie de laboratoireCompte-gouttes
B01L 9/00 - Dispositifs de supportDispositifs de serrage
C12M 1/34 - Mesure ou test par des moyens de mesure ou de détection des conditions du milieu, p. ex. par des compteurs de colonies
G01N 15/06 - Recherche de la concentration des suspensions de particules
C12Q 1/02 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des micro-organismes viables
C12Q 1/04 - Détermination de la présence ou du type de micro-organismeEmploi de milieux sélectifs pour tester des antibiotiques ou des bactéricidesCompositions à cet effet contenant un indicateur chimique
G01N 1/38 - Dilution, dispersion ou mélange des échantillons
G01N 35/10 - Dispositifs pour transférer les échantillons vers, dans ou à partir de l'appareil d'analyse, p. ex. dispositifs d'aspiration, dispositifs d'injection
H04N 5/232 - Dispositifs pour la commande des caméras de télévision, p.ex. commande à distance
G01N 35/00 - Analyse automatique non limitée à des procédés ou à des matériaux spécifiés dans un seul des groupes Manipulation de matériaux à cet effet
A method of immobilizing microorganisms comprising:contacting a sample comprising a plurality of microorganisms at a sample microorganism concentration with an immobilizing agent to produce a pre-immobilization sample with a pre-immobilization sample microorganism concentration and a pre-immobilization sample composition; immobilizing the pre-immobilization sample to produce an immobilized sample having immobilized sample properties and an immobilized sample volume; confining a first microorganism to a first location in the immobilized sample volume in response to producing the immobilized sample; and confining a second microorganism to a second location in the immobilized sample volume in response to producing the immobilized sample; wherein the first location and the second location are distinguishable by a detection system configured to acquire microorganism information.
C12Q 1/02 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des micro-organismes viables
G01N 33/50 - Analyse chimique de matériau biologique, p. ex. de sang ou d'urineTest par des méthodes faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiques par ligandsTest immunologique
G01N 33/543 - Tests immunologiquesTests faisant intervenir la formation de liaisons biospécifiquesMatériaux à cet effet avec un support insoluble pour l'immobilisation de composés immunochimiques
18.
RAPID DETERMINATION OF MICROBIAL GROWTH AND ANTIMICROBIAL SUSCEPTIBILITY
This disclosure is related to systems and methods for rapid determination of microorganism growth and antimicrobial agent susceptibility and/or resistance.
C12Q 1/02 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des micro-organismes viables
C12M 1/34 - Mesure ou test par des moyens de mesure ou de détection des conditions du milieu, p. ex. par des compteurs de colonies
C12M 3/00 - Appareillage pour la culture de tissus, de cellules humaines, animales ou végétales, ou de virus
G06K 9/46 - Extraction d'éléments ou de caractéristiques de l'image
Generally provided are methods for rapid culture of microorganisms in a sample, including methods for growth and recovery of live microbial cells directly from a sample. Various features include enabling growth of microorganisms in a sample along with a reduction of sample debris that may interfere with microorganism detection, and reduction in toxicities that may inhibit microorganism growth. Further methods for selectively degrading non-viable microbial cells, are provided, for enhanced detection of viable microbial cells following a growth period.
Methods and systems for purifying cells and viruses are provided. The sample is added to a well disposed in a medium. A potential is applied across the medium to cause the contaminants to enter one or more walls of the well, and retain the cells and/or viruses in the well. The cells and/or viruses can be removed from the well, and optionally adhered or fixed to a surface, or detected. In one embodiment, the cells and/or viruses may be retained in the well by embedding in the medium. The medium including the embedded cells and/or viruses may be excised or otherwise removed and transferred to a glass slide or other solid surface.
C12Q 1/24 - Méthodes d'échantillonnage, d'inoculation ou de développement d'un échantillonMéthodes pour isoler physiquement un micro-organisme intact
C12Q 1/70 - Procédés de mesure ou de test faisant intervenir des enzymes, des acides nucléiques ou des micro-organismesCompositions à cet effetProcédés pour préparer ces compositions faisant intervenir des virus ou des bactériophages
C12Q 1/04 - Détermination de la présence ou du type de micro-organismeEmploi de milieux sélectifs pour tester des antibiotiques ou des bactéricidesCompositions à cet effet contenant un indicateur chimique
C12M 1/12 - Appareillage pour l'enzymologie ou la microbiologie avec des moyens de stérilisation, filtration ou dialyse